[發明專利]一種鑒定位于蘿卜R02染色體上的晚抽薹QTL的InDel引物及其應用

有效

• 申請號: 201810487227.1
• 申請日: 2018-05-04
• 公開（公告）號: CN108588261B
• 公開（公告）日: 2020-09-29
• 發明（設計）人: 張麗;王慶彪
• 申請（專利權）人: 北京市農林科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京高沃律師事務所 11569
• 代理人: 馬云華

本發明提供了一種鑒定位于蘿卜R02染色體上的晚抽薹QTL的InDel引物，屬于生物技術技術領域，InDel引物包括InDel520引物對和InDel535引物對。本發明提供的InDel引物能夠鑒定蘿卜晚抽薹QTL，對蘿卜晚抽薹材料進行分子標記輔助鑒定的準確度為100％。

技術領域

本發明屬于生物技術技術領域，尤其涉及一種鑒定位于蘿卜R02染色體上的晚抽薹QTL的InDel引物及其應用。

背景技術

蘿卜起源于我國，是我國重要的蔬菜作物，長期以來是我國城鄉居民的“當家菜”。年播種面積1600萬畝，占我國整個蔬菜生產的6％。蘿卜是長日照植物，通過低溫春化后在長日照條件下由營養生長轉向生殖生長，從而抽薹開花。未熟抽薹開花對蘿卜生產最重要的影響是營養生長向生殖生長的轉變，抑制肉質根的膨大，導致產量和品質下降。培育蘿卜晚抽薹品種是解決這一問題的根本途徑。而發現蘿卜晚抽薹基因，開發與耐抽薹性狀相關的分子標記用于輔助選擇能夠加快育種進程、縮短育種時間。

在白菜、甘藍等蕓薹屬作物中已經發現許多與抽薹性狀相關的分子標記，但在蘿卜中相關標記較少，Liu等(Liu L W，Zhao L P，Gong Y Q，Wang M X.DNA fingerprintingand genetic diversity analysis of late-bolting radish cultivars with RAPD，ISSR and SRAP markers.Scientia Horticulturae，2008，116：240-247.)用35份晚抽薹蘿卜構建指紋圖譜，獲得了可能與抽薹性主效位點緊密連鎖的6個RAPD標記、1個ISSR標記和1個SRAP標記。徐文玲等(徐文玲，王淑芬，牟晉華，王翠花，劉賢嫻.蘿卜抽薹基因連鎖的AFLP和SCAR分子標記鑒定.分子植物育種，2009，7(4)，743-749.)獲得2個與蘿卜抽薹基因相連鎖的AFLP標記，遺傳距離分別為14.6cM和9.1cM。但上述研究結果尚難以在蘿卜耐抽薹性分子標記輔助篩選中應用。一方面是由于已經獲得的分子標記與相關基因的連鎖距離不夠緊密，另一方面由于植物抽薹開花是一個復雜的網絡系統，受多個基因的影響和調控，不同作物或同一作物不同材料間影響抽薹開花的分子機制可能不同。

發明內容

本發明的目的在于提供一種鑒定位于蘿卜R02染色體上的晚抽薹QTL的InDel引物，能夠鑒定晚抽薹QTL。

為了實現上述發明目的，本發明提供以下技術方案：

本發明提供了一種鑒定位于蘿卜R02染色體上的晚抽薹QTL的InDel引物，所述InDel引物包括InDel520引物對和InDel535引物對；

所述InDel520引物對的上游引物具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，所述InDel520引物對的下游引物具有SEQ ID No.2所示的核苷酸序列；

所述InDel535引物對的上游引物具有SEQ ID No.3所示的核苷酸序列；所述InDel535引物對的下游引物具有SEQ ID No.4所示的核苷酸序列。

本發明還提供了一種鑒定位于蘿卜R02染色體上的晚抽薹QTL的InDel分子標記，所述InDel分子標記包括InDel520和InDel535，所述InDel520由上述技術方案所述InDel引物中的InDel520引物對擴增得到，所述InDel535由上述技術方案所述InDel引物中的InDel535引物對擴增得到。

本發明還提供了一種鑒定位于蘿卜R02染色體上的晚抽薹QTL的試劑盒，包括引物，10×PCR Buffer，dNTPs，Taq酶和ddH₂O；所述引物包括權利要求1所述的InDel引物，所述InDel引物包括InDel520引物對和/或InDel535引物對。

本發明還提供了上述技術方案所述的InDel引物在鑒定蘿卜抽薹性狀中的應用。