[發(fā)明專利]一種與母豬肢蹄骨密度相關(guān)的SNP分子標(biāo)記

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201810452332.1
• 申請日: 2018-05-12
• 公開（公告）號: CN108624701B
• 公開（公告）日: 2021-02-02
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 劉向東;南九紅;唐振雙;尹立林;葉燈燈;馬官軍;趙書紅;李新云;劉小磊
• 申請（專利權(quán)）人: 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6837;C12N15/11
• 代理公司: 武漢宇晨專利事務(wù)所 42001
• 代理人: 張紅兵

本發(fā)明屬于動物分子標(biāo)記篩選技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及與一種與母豬肢蹄骨密度相關(guān)SNP的分子標(biāo)記。該分子標(biāo)記克隆自登陸號為H3GA0030503的基因片段，通過基因芯片對該基因進(jìn)行分型篩選得到一種與母豬肢蹄骨密度相關(guān)的分子標(biāo)記，該分子標(biāo)記的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在該序列的第51位的堿基處存在一個G/T的等位基因突變，且當(dāng)SEQ ID NO：1上的第51位核苷酸為G時，則母豬的肢蹄具有更高的骨密度。本發(fā)明還公開了篩選與母豬肢蹄骨密度相關(guān)分子標(biāo)記的方法及其關(guān)聯(lián)分析方法的應(yīng)用。為豬肢蹄結(jié)實(shí)度性狀尤其是骨密度的標(biāo)記輔助選擇提供了一個新的SNP分子標(biāo)記。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及豬分子標(biāo)記制備技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及與一種母豬肢蹄骨密度相關(guān)SNP的分子標(biāo)記及其應(yīng)用。本發(fā)明所述的分子標(biāo)記可用于豬肢蹄骨密度性狀的預(yù)測。

背景技術(shù)

隨著科技的發(fā)展，豬養(yǎng)殖業(yè)在遺傳育種、營養(yǎng)調(diào)控以及疾病防控等方面均取得了顯著突破，商品豬的瘦肉率、料肉比以及生長速度均有了巨大的提升。但伴隨集約化養(yǎng)殖而來的便是日益突出的肢蹄問題，為了集約化生產(chǎn)，豬群的活動范圍有限，另外欄舍的設(shè)計(jì)(漏縫地板)更是加劇了豬肢蹄病的發(fā)生。據(jù)報(bào)道，在所有通過性能測定的后備公豬中，有20-50％的后備公豬因肢蹄軟弱而被淘汰，在生產(chǎn)母豬中由于肢蹄軟弱而被淘汰的母豬也高達(dá)6.1-15％(張徐非等，位置功能候選基因HMGA1、C6orf106和ENSSSCG00000023160與豬肢蹄結(jié)實(shí)度的關(guān)聯(lián)性[J]，中國農(nóng)業(yè)科學(xué),2016,49(20):4030-4039)。另外，由于生產(chǎn)成本的限制，豬的肢蹄一旦出現(xiàn)問題，只有極少數(shù)能夠被治愈(郭春艷，淺談母豬肢蹄病的發(fā)病原因及防治措施[J]，農(nóng)家致富顧問,2017(16):20-20)，絕大多數(shù)則采取淘汰措施，給豬養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。

肢蹄結(jié)實(shí)度，是指肢蹄健康程度和四肢運(yùn)動協(xié)調(diào)程度的綜合反應(yīng)，但為了研究方便一般用其對立面-肢蹄軟弱(leg weakness)來衡量。總的來說，肢蹄結(jié)實(shí)度可以從肢蹄評分、步態(tài)評分、腿型評分、骨礦物含量和骨密度、軟骨病評分、關(guān)節(jié)面軟骨評分及肱二頭肌長度等多個方面衡量(候利娟等，豬肢蹄結(jié)實(shí)度的遺傳解析進(jìn)展，豬業(yè)科學(xué)2013:94-7)。而骨密度是人類骨質(zhì)疏松診斷的一個重要參照標(biāo)準(zhǔn)(程曉光，骨密度測量和骨質(zhì)疏松診斷[J].，國際內(nèi)分泌代謝雜志,2005,25(5):308-310)。另外，有報(bào)道稱骨密度(Bone MineralDensity,BMD)可以反映骨骼強(qiáng)度的58-70％(曹海偉等，定量超聲與雙能骨密度測定在骨質(zhì)疏松診斷中的應(yīng)用及評價(jià)[J]，中國骨質(zhì)疏松雜志,2001,7(2):110-112)。由此可見，骨密度在動物骨骼強(qiáng)度的研究中是一個重要指標(biāo)，但由于各種生產(chǎn)條件的限制，人們對于家畜骨骼的研究十分罕見。

骨密度，即單位體積骨礦物質(zhì)的含量，單位為g/cm3，常見的骨密度測定方法有放射吸收法、雙能X射線測定法、定量計(jì)算機(jī)斷層掃描技術(shù)以及軸向超聲波傳播技術(shù)等(曹健，骨密度(BMD)測定的應(yīng)用評價(jià)[J]，醫(yī)藥前沿,2013(2))，其中雙能X射線測定法及定量計(jì)算機(jī)斷層掃描技術(shù)應(yīng)用最廣，但雙能X射線測量技術(shù)測定得為面積骨密度，受物體幾何體積的影響，而定量計(jì)算機(jī)斷層掃描技術(shù)可以更準(zhǔn)確地測量動物骨密度，但其設(shè)備價(jià)格昂貴(劉珺，雙能X線骨密度儀與定量CT測量骨密度的比較研究[D]，中南大學(xué),2005)，且操作十分麻煩(對于大型家畜需要麻醉后進(jìn)行)，大大限制了其在動物骨密度研究中的應(yīng)用。而超聲波骨軸傳播技術(shù)，是近年來新興的一種骨密度測定技術(shù)，其不僅能夠測定動物骨密度，在一定程度上還可以反映動物骨強(qiáng)度及骨結(jié)構(gòu)的情況，具有簡便、無輻射損傷、重復(fù)精度高、且價(jià)格便宜，易于攜帶的優(yōu)點(diǎn)(孫濤.骨密度無損測定方法簡介及其最新進(jìn)展[J].，中國醫(yī)療設(shè)備,2009,24(1):49-51)。由此可以看出，利用超聲骨軸傳播技術(shù)測定豬肢蹄骨密度，并利用GWAS篩選出與中肢蹄骨密度相關(guān)的SNP分子標(biāo)記，為家豬肢蹄性狀的遺傳選良提供了一種可行途徑，對于豬養(yǎng)殖業(yè)具有重要意義。

本發(fā)明中發(fā)現(xiàn)的SNP與豬肢蹄骨密度性狀的相關(guān)性達(dá)到了顯著水平，為家豬肢蹄結(jié)實(shí)度性狀的研究提供了新的遺傳資源。

發(fā)明內(nèi)容