[發(fā)明專利]用于鼻咽癌診斷的標(biāo)志物有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201810424633.3 | 申請(qǐng)日: | 2018-05-07 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN108707665B | 公開(kāi)(公告)日: | 2022-03-22 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 羅微;王躍建;金亞彬;張國(guó)義;林凱容;崔金環(huán);陳湘萍;潘英明 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 佛山市第一人民醫(yī)院(中山大學(xué)附屬佛山醫(yī)院) |
| 主分類號(hào): | C12Q1/6886 | 分類號(hào): | C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 廣州嘉權(quán)專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 44205 | 代理人: | 胡輝 |
| 地址: | 528000 廣東*** | 國(guó)省代碼: | 廣東;44 |
| 權(quán)利要求書(shū): | 查看更多 | 說(shuō)明書(shū): | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 用于 鼻咽癌 診斷 標(biāo)志 | ||
本發(fā)明公開(kāi)了一種用于鼻咽癌診斷的標(biāo)志物,該組標(biāo)志物包括TCRBV5.4、TCRBV6.3、TCRBV6.4、TCRBV6.6、TCRBV6.7、TCRBV7.9、TCRBV8.1、TCRBV10.2、TCRBV10.3、TCRBV12.3、TCRBV12.4、TCRBV15、TCRBV20.1、TCRBV22、TCRBV25.1,并通過(guò)LASSO模型構(gòu)建了鼻咽癌診斷公式,得到了根據(jù)這些TCR基因預(yù)測(cè)鼻咽癌的方法,經(jīng)過(guò)ROC檢測(cè),診斷公式在測(cè)試組中的AUC值達(dá)到0.96,當(dāng)靈敏度為0.95時(shí),特異性為0.86;在驗(yàn)證組中的AUC值為0.74,當(dāng)靈敏度為0.79時(shí),特異性為0.75,診斷效能良好。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及一種用于鼻咽癌診斷的標(biāo)志物。
背景技術(shù)
鼻咽癌目前屬于一種治愈率較高的疾病,關(guān)鍵在于早期診斷、及時(shí)治療。因此,鼻咽癌的篩查和診斷尤為重要。然而由于鼻咽部解剖位置隱蔽,鼻咽癌早期癥狀不明顯,給鼻咽癌早期診斷帶來(lái)了一定困難。
目前鼻咽癌的主要輔助檢查手段有電子鼻咽鏡、鼻咽CT及EB病毒血清學(xué)檢查等。電子鼻咽鏡照明度強(qiáng),圖像清晰,可動(dòng)態(tài)觀察鼻咽全貌,能夠發(fā)現(xiàn)鼻咽部微小隱蔽的病變,但是由于電子鼻咽鏡不能發(fā)現(xiàn)粘膜下病變,故也存在一些假陰性。CT圖像分辨率極高,較為經(jīng)濟(jì)實(shí)用,技能分辨骨質(zhì),也能分辨軟組織,設(shè)備比較普及,是目前鼻咽癌診斷中常用的方法,但是,由于部分容積效應(yīng)的影響,CT對(duì)于咽隱窩等隱蔽部位體積較小的早期病灶,尤其在等密度病灶時(shí)往往很難發(fā)現(xiàn),同時(shí),局部的驗(yàn)證、分泌物和淋巴組織是的在CT上判斷鼻咽癌部的對(duì)稱性變得困難。研究表明EB病毒與鼻咽癌的發(fā)生發(fā)展緊密相關(guān),EB病毒血清學(xué)檢查作為目前鼻咽癌診斷的輔助指標(biāo),在鼻咽癌上具有一定的指導(dǎo)意義,但是該方法存在一定的假陽(yáng)性,不僅增加了臨床的工作量,也給受檢者帶來(lái)不必要的壓力。鼻咽癌診斷仍主要依賴于活檢手術(shù)樣本的病理診斷,亟需獲得其他可有效輔助于鼻咽癌診斷的特異分子指標(biāo)。
機(jī)體免疫系統(tǒng)識(shí)別和清除腫瘤細(xì)胞主要依賴于T細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞免疫。T細(xì)胞受體(TCR)是T細(xì)胞表面特異性識(shí)別抗原和介導(dǎo)免疫應(yīng)答的分子,是人類基因組中多態(tài)性最高的區(qū)域之一,決定著人的免疫系統(tǒng)如何適應(yīng)環(huán)境的變化。T細(xì)胞受體庫(kù)的多樣性(包括基因重組以及選擇性表達(dá))直接反映了機(jī)體免疫應(yīng)答的狀態(tài)。
TCR可分為TCRα/β和TCRγ/δ兩種類型,人類外周血T細(xì)胞主要為TCRα/β的T細(xì)胞,是介導(dǎo)機(jī)體特異性細(xì)胞免疫反應(yīng)的主要細(xì)胞。TCRβ基因由可變區(qū)(V)、多變區(qū)(D)、結(jié)合區(qū)(J)和恒定區(qū)(C)四部分基因片段組成,形成互補(bǔ)決定區(qū)(complementarities determiningregion,CDR)和間隔的4個(gè)骨架區(qū)(framework region,FR)。
在T細(xì)胞發(fā)育過(guò)程中CDR1,CDR2和FR區(qū)域相對(duì)保守,CDR3區(qū)由V、D和J進(jìn)行重排而形成具有功能的TCR編碼基因(T細(xì)胞克隆),由于V(65種)、D(2種)、J(13種)基因片段本身具有多樣性,此外,由于在重排的過(guò)程中,在VD及D-J的連接區(qū)經(jīng)常有非模板的核苷酸的隨機(jī)插入或刪除,進(jìn)一步增加了CDR3區(qū)的多樣性(連接形成的多樣性約為2×1011)。這種基因片段連接的不準(zhǔn)確性使TCR的表達(dá)呈多樣性(即TCR庫(kù)的多樣性),以識(shí)別各種不同的抗原。正常個(gè)體在無(wú)抗原刺激時(shí),TCR基因重排是隨機(jī)的,因此正常人外周T細(xì)胞呈多家族、多克隆性特點(diǎn)。在不同抗原(腫瘤、疫苗、病院微生物或者移植物等)刺激后,TCR V區(qū)基因可對(duì)該抗原產(chǎn)生特異性識(shí)別,并使帶有這類基因的T細(xì)胞得到優(yōu)勢(shì)擴(kuò)增,可用于分析不同TCR V亞家族T細(xì)胞的表達(dá)和利用。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的在于提供一種用于鼻咽癌診斷的組合標(biāo)志物,該組合標(biāo)志物具有靈敏度高,特異性好的優(yōu)點(diǎn)。
本發(fā)明所采取的技術(shù)方案是:
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