[發(fā)明專利]一種用于檢測家族性高膽固醇血癥易感性相關的SNP位點的引物及其檢測方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810412509.5 | 申請日: | 2018-05-03 |
| 公開(公告)號: | CN108588215A | 公開(公告)日: | 2018-09-28 |
| 發(fā)明(設計)人: | 黃曉霞;張蓉;譚遙;彭柯又 | 申請(專利權)人: | 成都中創(chuàng)清科醫(yī)學檢驗所有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 成都正華專利代理事務所(普通合伙) 51229 | 代理人: | 李林合 |
| 地址: | 610041 四川省成都市中國(四川)自*** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 引物 家族性高膽固醇血癥 位點 檢測 易感性 序列分析儀 引物特異性 基因組DNA 風險評估 高膽固醇 疾病預防 擴增產(chǎn)物 引物序列 可用 回收 分析 | ||
本發(fā)明公開了一種用于檢測家族性高膽固醇血癥易感性相關的SNP位點的引物及其檢測方法。引物包括rs41291161位點的引物、rs12720772位點的引物、rs12084215位點的引物和rs2922126位點的引物,其引物序列見SEQ ID NO.1~8;檢測方法包括以下步驟:(1)提取患者基因組DNA;(2)以步驟(1)中所得DNA為模板,采用權利要求1中所述引物進行PCR擴增;(3)回收擴增產(chǎn)物,然后進行PCR擴增,再進行純化,最后通過序列分析儀對SNP分型進行分析確定。本發(fā)明方法準確性高,引物特異性好,可用于家族性高膽固醇血癥的風險評估,為高膽固醇的疾病預防提供指導。
技術領域
本發(fā)明屬于基因工程技術領域,具體涉及一種用于檢測家族性高膽固醇血癥易感性相關的SNP位點的引物及其檢測方法。
背景技術
家族性高膽固醇血癥又稱家族性高β脂蛋白血癥,是兒童期最常見的遺傳性高脂血癥,也是脂質(zhì)代謝疾病中最嚴重的一種,可導致各種危及生命的心血管疾病并發(fā)癥的出現(xiàn),是冠狀動脈疾病的一種。該病的臨床表現(xiàn)為低密度脂蛋白膽固醇水平增高、黃色瘤、角膜弓和早發(fā)性冠心病。隨著生活水平的提高,越來越多的人對自身健康也十分注重。家族性高膽固醇血癥其癥狀嚴重,因此對家族性高膽固醇血癥患者早期基因檢測和篩查十分必要,通過檢測與家族性高膽固醇易感性相關的SNP,就能夠幫助高膽固醇易感人群了解其患上高膽固醇的風險,提前做好預防工作,避免家族性高膽固醇血癥的發(fā)生。單核苷酸多態(tài)性(SNP)目前已成為繼限制性片段長度多態(tài)(RFLP)標志和微衛(wèi)星串聯(lián)重復(STR)標志后的第三代遺傳標記。為了實現(xiàn)家族性高膽固醇血癥的早發(fā)現(xiàn)、早預防和早控制,通過單核苷酸多態(tài)性(SNP)檢測高膽固醇易感性已成為國內(nèi)外的研究熱點,有全基因組關聯(lián)研究表明,這4個SNP(rs41291161,rs12720772,rs12084215,rs2922126,)位點與高膽固醇易感性密切相關,通過檢測與高膽固醇易感性相關的SNP位點的多態(tài)性,可以評估患家族性高膽固醇血癥的易感風險,為高膽固醇的疾病預防提供指導。
發(fā)明內(nèi)容
針對現(xiàn)有技術中的上述不足,本發(fā)明提供一種用于檢測家族性高膽固醇血癥SNP位點的引物及其檢測方法,其引物特異性好,檢測方法準確性高,可用于家族性高膽固醇血癥的風險評估,為高膽固醇的疾病預防提供指導。
為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明解決其技術問題所采用的技術方案是:
一種用于檢測家族性高膽固醇血癥易感性相關的SNP位點的引物,引物包括rs41291161位點的引物、rs12720772位點的引物、rs12084215位點的引物和rs2922126位點的引物,其各引物具體序列如下:
rs41291161-F:5’-CTTCACAAATACACACCTG-3’;(SEQ ID NO.1)
rs41291161-R:5’-TGTCCTATCTGAACCTTAGC-3’;(SEQ ID NO.2)
rs12720772-F:5’-AAGTACACACTTGGAAGGAA-3’;(SEQ ID NO.3)
rs12720772-R:5’-GTCCACACCTATCTCTAACTAT-3’;(SEQ ID NO.4)
rs12084215-F:5’-GACACAGATTAGTTCTGGAT-3’;(SEQ ID NO.5)
rs12084215-R:5’-AAGATGATGTGACCACTGT-3’;(SEQ ID NO.6)
rs2922126-F:5’-AGTCTCACGCAGTTATAGG-3’;(SEQ ID NO.7)
rs2922126-R:5’-CTTCTACTTCTCAACAGCAAC-3’。(SEQ ID NO.8)
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