[發明專利]用于診斷肺癌的方法

在審

• 申請號: 201810410227.1
• 申請日: 2018-05-02
• 公開（公告）號: CN110055313A
• 公開（公告）日: 2019-07-26
• 發明（設計）人: 丹尼·弗魯姆金;亞當·瓦瑟斯特羅姆
• 申請（專利權）人: 紐克萊克斯有限公司
• 主分類號: C12Q1/686
• 分類號: C12Q1/686;G16H50/20
• 代理公司: 北京安信方達知識產權代理有限公司 11262
• 代理人: 王瑋瑋;鄭霞

1.一種用于鑒定人受試者的肺癌的方法，所述方法包括：

(a)將來自從所述受試者獲得的血漿樣品的DNA應用于用至少一種甲基化敏感性限制性內切核酸酶的消化，以獲得限制性內切核酸酶處理的DNA；

(b)從所述限制性內切核酸酶處理的DNA共擴增包含SEQ ID NO:4中列出的基因座的至少一種限制性基因座和對照基因座，從而生成每種基因座的擴增產物；

(c)計算所述至少一種限制性基因座的每一種和所述對照基因座的擴增產物的信號強度之間的比率；以及

(d)檢測所述比率關于肺癌比率的高概率評分，從而鑒定人受試者的肺癌。

2.如權利要求1所述的方法，其中所述至少一種限制性基因座還包括選自SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6中列出的基因座的組的至少一種另外的限制性基因座，并且所述概率評分為所述SEQ ID NO:4的比率以及所述至少一種另外的限制性基因座的至少一種另外的比率關于肺癌比率的組合概率評分。

3.如權利要求2所述的方法，其中所述至少一種另外的限制性基因座包括SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6中列出的所有基因座，并且所述組合概率評分為SEQ ID NO:4的比率、SEQ ID NO:1的比率、SEQ ID NO:2的比率、SEQ IDNO:3的比率、SEQ ID NO:5的比率和SEQ ID NO:6的比率關于肺癌比率的組合概率評分。

4.如權利要求1所述的方法，所述方法還包括：

提供第一對照DNA和第二對照DNA，所述第一對照DNA和所述第二對照DNA各自包括人細胞系來源的DNA，其中所述第一對照DNA包括來自其中所述至少一種限制性基因座大部分被甲基化的人細胞系的DNA，且所述第二對照DNA包括來自其中所述至少一種限制性基因座的一種或更多種大部分未被甲基化的人細胞系的DNA；

用所述甲基化敏感性限制性內切核酸酶消化所述第一對照DNA和所述第二對照DNA；以及

從所述第一對照DNA和所述第二對照DNA擴增所述至少一種限制性基因座和所述對照基因座；

其中所述第一對照DNA中所述至少一種限制性基因座和所述對照基因座的充分擴增的檢測指示成功的DNA擴增，且其中所述第二對照DNA中所述至少一種限制性基因座的一種或更多種的低擴增或不擴增伴隨所述對照基因座的正常擴增指示成功的DNA消化。

5.如權利要求4所述的方法，其中，所述其中所述至少一種限制性基因座大部分被甲基化的人細胞系是HCT-15。

6.如權利要求4所述的方法，其中，所述其中所述至少一種限制性基因座的一種或更多種大部分未被甲基化的人細胞系是A673。