[發明專利]一種牦牛體格相關的基因分子標記、檢測方法和試劑盒

有效

• 申請號: 201810400947.X
• 申請日: 2018-04-28
• 公開（公告）號: CN108531616B
• 公開（公告）日: 2021-08-10
• 發明（設計）人: 郭憲;裴杰;包鵬甲;吳曉云;熊琳;褚敏;丁學智;王宏博;閻萍;梁春年
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院蘭州畜牧與獸藥研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 東營雙橋專利代理有限責任公司 37107
• 代理人: 劉東亮

本發明涉及一種牦牛體格相關的基因分子標記、檢測方法和試劑盒，屬于分子生物學技術領域。本發明通過對牦牛MMP3基因的遺傳多態性進行分析，找到MMP3基因的一個可以影響牦牛體格相關的SNP位點；本發明還提供了對上述SNP位點進行檢測的PCR方法。通過上述方法可以較好地對牦牛進行分子育種。

技術領域

本發明涉及一種牦牛體格相關的基因分子標記、檢測方法和試劑盒，屬于分子生物學技術領域

背景技術

動物分子育種(Animal molecular breeding)是利用分子數量遺傳學理論和技術來改良畜禽品種的一門新興學科，是傳統的動物育種理論和方法的新發展。從目前發展現狀來看，它應包括兩方面內容：基因組育種(Genomic breeding)和轉基因育種(Transgenicbreed-ing)。其中，基因組育種是在基因組分析的基礎上，通過DNA標記技術來對畜禽數量性狀座位進行直接選擇，或通過標記輔助導入有利基因，通過標記輔助淘汰(Mar-kerassisted culling，MAC)清除不利基因等，以達到更有效地改良畜禽的目的。轉基因育種則是通過基因轉移技術將外源基因導入某種動物的基因組上，育成轉基因畜禽新品種(系)，從而達到改良重要生產性狀(如生長率、遺傳抗性等)或非常規性育種性狀(如生產人類藥用蛋白、工業用酶等)的目標。

牦牛是牛屬動物中能適應高寒氣候環境條件而延續至今的牛種。我國現有牦牛1300余萬頭，占世界牦牛總數的95％以上，占我國牛只總數的1/6，主要分布在青海、西藏、四川、甘肅、云南、新疆等省區。由于牦牛具有抗逆性強，適合高原氣候和耐粗飼等優點，并且受現代良種的沖擊比較小，具有地方品種的特異性，是當地畜牧業經濟中不可缺少的重要畜種，切實合理地保護和利用這些珍貴的遺傳資源，對于發展高海拔地區畜牧業具有重要意義。然而牦牛的生產性能遠遠低于其他牛種，這極大地限制了這些地區畜牧業經濟的進一步發展。如何發揮和利用這一寶貴的基因庫，提高當地畜牧業經濟效益是我國畜牧界急需研究的重要課題之一。在育種工作中，常規育種方法受到了極大的限制，牦牛產區曾采用種間雜交改良、本品種選育等多種方法來提高牦牛的生產性能，但由于受到雜種雄性不育、牦牛群體無系統的生產性能和系譜記錄等因素的影響，這些方法沒有達到改良牦牛品質、提高生產性能的目的，牦牛至今仍屬生產性能較低的原始牛種。因此，應用分子育種的理論和技術探討提高牦牛生產性能的其他新途徑和方法具有十分重要的理論和實際意義。

基質金屬蛋白酶3(MMP3)，也稱為間質細胞溶素1(基質溶素-1)或前明膠酶(明膠酶)，是基質金屬蛋白酶家族的一個重要成員。MMP3基因定位于人染色體11q22.3區域，大約1.8kb的長度。MMP3在細胞內形式(proMMP3)生成，有477個氨基酸組成的約57kDa的分子量。MMP3蛋白的結構可以在氨基末端肽區域、氨基末端催化結構域和羧基端結構域三個部分。傳統認為，MMP3通過調節細胞外基質的重建發揮其功能。其降解(包括Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅸ、Ⅹ型膠原、纖維連接蛋白、層粘連蛋白、彈性蛋白、蛋白聚糖等)幾乎全部的細胞外基質(extracellular matrix，ECM)成分，以多種方式調節細胞的增殖和遷移，可以通過水解各種ECM成分激活其他MMPs(MMP1、7、8、9、13)等來實現。此外最新的研究顯示MMP3還可以出現在細胞核內，并通過其催化活性誘導細胞凋亡，進一步表明MMP3的功能是多樣而復雜的。

本發明通過對牦牛MMP3基因進行多態性分析，以提高其在牦牛分子育種中的應用。

發明內容

本發明提供了一個與牦牛體格相關的基因分子標記，通過該分子標記可以用于牦牛的分子育種，同時本發明也提供了對該基因標記進行檢測的PCR方法和試劑盒。

技術方案是：

本發明的第一個方面，提供了：

一種牦牛體格相關的基因分子標記，是牦牛MMP3基因第1324位為G或者T的snp位點。