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[發明專利]針對人源ADRB2基因設計的四條sgRNA有效

專利信息
申請號: 201810382911.3 申請日: 2018-04-26
公開(公告)號: CN108546703B 公開(公告)日: 2021-04-13
發明(設計)人: 施明;鄭駿年;劉丹;孫毓 申請(專利權)人: 徐州醫科大學
主分類號: C12N15/113 分類號: C12N15/113
代理公司: 北京預立生科知識產權代理有限公司 11736 代理人: 李紅偉;高倩倩
地址: 221000 *** 國省代碼: 江蘇;32
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摘要:
搜索關鍵詞: 針對 adrb2 基因 設計 sgrna
【說明書】:

發明屬于基因修飾技術領域,公開了針對人源ADRB2基因設計的四條sgRNA序列。登錄網站檢索人源ADRB2基因的CDS序列,根據sgRNA的設計原則,在其CDS區近5’端采取頭對頭的排列方式,設計了四條sgRNA。在此基礎上,分別構建了單sgRNA表達質粒和多重sgRNA載體。經T7EN1酶切鑒定和TA克隆測序證實兩種質粒轉染HEK293T細胞后均可引導Cas9蛋白切割靶基因,特別是多重sgRNA其基因修飾的效率可高達100%。

技術領域

本發明屬于CRISPR/Cas9基因編輯技術領域,具體是指針對人源ADRB2基因設計的四條sgRNA。

背景技術

基因編輯技術,是近年來發展起來的一項可以對基因進行精準修飾的技術。在科學研究領域,基因編輯技術可用于模式生物的快速構建;在農業領域,該技術可用于植物品種改造;而在健康醫療領域,該技術還有可能通過改造人類自身基因,達到治療疾病的目的。因此,基因編輯技術具有極其廣泛的發展前景和應用價值。

目前,基因編輯技術主要有鋅指核酸酶(ZFN)、轉錄激活樣效應因子核酸酶(TALEN)和成簇規律間隔短回文重復技術(CRISPR/Cas9)。技術原理上,三種基因編輯技術都是通過特異序列的靶向識別和切割,造成基因組斷裂,在細胞通過非同源末端連接修復(non-homologous end joining,NHEJ)和同源重組修復(HR)的過程中達到對基因精確修飾的目的。

鋅指核酸酶作為第一代基因編輯技術,首次實現了對基因的靶向性操作。原理如下:鋅指核糖核酸酶由一個DNA識別域和一個核酸內切酶構成。DNA識別域又是由一系列鋅指蛋白模塊串聯組成,每個鋅指蛋白模塊識別并結合一個特異的三聯體堿基,從而實現核酸內切酶對基因組特定位點的靶向性切割。盡管有文獻報道鋅指核酸酶的基因打靶效率能達到30%,但其發展仍存在較大局限性。一方面,鋅指核酸酶的識別結構域中存在上下文序列依賴性,增加了設計、篩選難度;另一方面,鋅指核酸酶的脫靶切割會導致細胞毒性,制約了其在基因治療領域的應用。

轉錄激活樣效應因子核酸酶(TALEN)是第二代基因編輯技術,TALEN在設計上比ZFN更加簡單,使用上更加靈活。TALEN的作用原理與ZFN相似,但其特異性識別DNA序列的是TALEN蛋白。TALEN蛋白利用其重復單元中第12/13位氨基酸殘基于A、G、C、T形成的保守且恒定的對應關系,進而實現對基因組上任意特定位點的識別、切割。

CRISPR/Cas9是新近發展起來的第三代基因編輯技術,它來源于細菌和古細菌的適應性性免疫系統。前兩代基因編輯技術不同,CRISPR/Cas9系統是RNA介導的Cas9核酸內切酶對特定DNA序列進行識別、切割,進而實現對基因組的精確編輯。其中,起向導作用的RNA被稱為sgRNA(single-guide RNA)。它由兩部分構成,一部分是crRNA(CRISPR RNA),其通過堿基互補配對原則與靶序列結合,起精準定位的作用,另一部分是tracrRNA(trans-acting CRISPR RNA),其協助crRNA/Cas9蛋白形成穩定的復合物,實現Cas9在基因組上的精準定位,進而剪切DNA雙鏈,形成DSB(Double Stranded Breaks)缺口,激活細胞自身的DNA損傷修復機制,在修復的過程中造成移碼突變,最終實現靶基因的敲除。

CRISPR/Cas9系統一經出現便在基礎研究領域及研發領域得到廣泛應用,主要是它有著前兩代基因編輯技術無可比擬的優勢。首先,其構建過程簡單,可操作性強,成本低。其次,可以實現單基因多位點或多基因的同時敲除,大大提高了基因編輯的效率。再次,質粒載體體量小,減少了轉染過程中的細胞毒性。最后,可供編輯的位點在基因組上出現頻率高,容易選擇合適的位點進行高效基因編輯操作。除此以外,與目前基因沉默領域應用最為廣泛的基因干擾技術(RNAi)相比,CRISPR/Cas9同樣優勢顯著:

發明內容

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