[發明專利]一種基于核磁共振CPMG衰減曲線鑒別玉米單倍體籽粒的方法有效
| 申請號： | 201810377928.X | 申請日： | 2018-04-25 |
| 公開（公告）號： | CN108445035B | 公開（公告）日： | 2021-02-02 |
| 發明（設計）人： | 陳紹江;李金龍;李偉;焦炎炎;張俊穩;陳琛;陳明;劉晨旭;田小龍;鐘裕;祁曉龍;王鼎昌 | 申請（專利權）人： | 中國農業大學 |
| 主分類號： | G01N24/08 | 分類號： | G01N24/08 |
| 代理公司： | 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245 | 代理人： | 關暢;何葉喧 |
| 地址： | 100193 *** | 國省代碼： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 基于 核磁共振 cpmg 衰減 曲線 鑒別 玉米 單倍體 籽粒 方法 | ||
【權利要求書】：
1.一種鑒別玉米單倍體的方法，包括如下步驟：
(1)采集訓練集各個玉米籽粒的核磁信號，獲得每個籽粒的CPMG衰減曲線，然后用每個時間點對應的振幅除以籽粒重量以歸一化數據，獲得每個籽粒質量歸一化后的CPMG衰減曲線；訓練集由若干玉米籽粒組成，其中一部分為真實單倍體，另一部分為真實二倍體；
(2)對步驟(1)獲得的質量歸一化后的CPMG衰減曲線的0-600ms區段進行數據處理，然后進行主成分分析，然后構建單倍體鑒別模型；構建單倍體鑒別模型的算法為支持向量機算法；支持向量機算法的參數為：sigma＝0.004976874，懲罰系數C＝16；
(3)取待測玉米籽粒，采集核磁信號，獲得CPMG衰減曲線，然后用每個時間點對應的振幅除以籽粒重量以歸一化數據，獲得質量歸一化后的CPMG衰減曲線；
(4)對步驟(3)獲得的質量歸一化后的CPMG衰減曲線的0-600ms區段進行數據處理，然后進行主成分分析，然后將結果代入步驟(2)構建的單倍體鑒別模型，由模型輸出該待測玉米籽粒為預測單倍體或者預測二倍體的結果；
所述步驟(2)和所述步驟(4)中，所述數據處理為10點平滑處理；
所述步驟(2)和所述步驟(4)中，所述主成分分析的主成分數量為100；
所述步驟(2)和所述步驟(4)中，所述主成分分析為基于R語言的主成分分析。
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