[發(fā)明專利]與谷子穗重性狀相關(guān)的SNP標(biāo)記及其檢測(cè)引物和應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201810339508.2
• 申請(qǐng)日: 2018-04-16
• 公開（公告）號(hào): CN108715900B
• 公開（公告）日: 2021-12-21
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 趙治海;李雙東;馮小磊;趙芳;張耕耘;張曉磊;魏瑋;邱風(fēng)倉;任全軍
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 張家口市農(nóng)業(yè)科學(xué)院
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 深圳鼎合誠知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 44281
• 代理人: 李小焦;彭家恩

1.一種SNP標(biāo)記在谷子穗重預(yù)測(cè)、谷子穗重早期鑒定或谷子穗重性狀方面的分子輔助篩選育種中的應(yīng)用；

所述SNP標(biāo)記為Seq ID No.1所示序列，具有自Seq ID No.1所示序列5’端起第24位堿基為C或T的SNP位點(diǎn)；所述SNP位點(diǎn)位于第五條染色體第42014092bp至第42327261bp的bin標(biāo)記內(nèi)，且與谷子穗重緊密連鎖；所述SNP位點(diǎn)位于第五條染色體的序列第42291221bp位置。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用，其特征在于：對(duì)SNP位點(diǎn)，利用復(fù)合區(qū)間作圖法，采用5%的總體顯著水平，QTL檢測(cè)的LOD值為4.4846，表型變異解釋率為4.14%。

3.一種引物對(duì)在谷子穗重預(yù)測(cè)、谷子穗重早期鑒定或谷子穗重性狀方面的分子輔助篩選育種中的應(yīng)用；

所述引物對(duì)的上游引物為Seq ID No.2所示序列，下游引物為Seq ID No.3所示序列；

Seq ID No.2：5’-AGATAGGTATGGAGGGAGGAT-3’；

Seq ID No.3：5’-TTGGGATATTGGGATTGAC-3’；

所述引物對(duì)用于檢測(cè)SNP標(biāo)記，所述SNP標(biāo)記為Seq ID No.1所示序列，具有自Seq IDNo.1所示序列5’端起第24位堿基為C或T的SNP位點(diǎn)；所述SNP位點(diǎn)位于第五條染色體第42014092bp至第42327261bp的bin標(biāo)記內(nèi)，且與谷子穗重緊密連鎖；所述SNP位點(diǎn)位于第五條染色體的序列第42291221bp位置。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用，其特征在于：對(duì)SNP位點(diǎn)，利用復(fù)合區(qū)間作圖法，采用5%的總體顯著水平，QTL檢測(cè)的LOD值為4.4846，表型變異解釋率為4.14%。