[發明專利]一種影響杜洛克豬眼肌面積性狀的分子標記及應用

有效

• 申請號: 201810337360.9
• 申請日: 2018-04-16
• 公開（公告）號: CN108728552B
• 公開（公告）日: 2019-07-23
• 發明（設計）人: 楊杰;吳珍芳;王興旺;全建平;鄭恩琴;楊明;楊化強;蔡更元
• 申請（專利權）人: 華南農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 廣東廣信君達律師事務所 44329
• 代理人: 楊曉松

本發明屬于分子標記輔助選擇技術及動物遺傳育種領域，公開了一種影響豬眼肌面積的SNP分子標記及其應用。所述SNP分子標記為豬基因組第6號染色體第35091111位堿基由A到G的位點突變，對應于SEQ ID NO:1所示序列中的第214bp處(命名為：g.214 T>G)。利用本發明的引物對，以豬基因組DNA為模板進行PCR擴增，可以得到與豬眼肌面積性狀緊密連鎖的SNP分子標記。本發明提供的分子遺傳標記可以用于種豬的眼肌面積的篩選，能夠有效提高豬的眼肌面積及肉質性狀。

技術領域

本發明屬于分子標記輔助選擇技術及動物遺傳育種領域，特別涉及一種影響眼肌面積性狀的分子標記及其應用。

背景技術

我國是世界上豬肉生產和豬肉消費的第一大國。近些年來，隨著豬肉總量和人民生活水平的提高，人民對高品質的豬肉需求越來越高。眼肌也叫背最長肌，是豬全身最鮮嫩的肉，營養豐富，味美，易消化。眼肌就是高品質豬肉的代表。因此提高高品質豬肉產量成為新的育種目標，而眼肌面積作為影響豬肉品質的主要因素，成為豬育種計劃的一部分。

目前，利用基因組掃描法和候選基因法已經發現了與豬的眼肌面積性狀顯著相關的322個QTLs，分布在所有的染色體上。但是這兩種方法還是有著自身無法克服的缺陷。QTL連鎖分析的一致性檢驗會受到不同資源家系群體的影響，而且一個QTL的區域很大，往往包括上百個候選基因，要做到精細定位QTL同時找到更多的相鄰連鎖標記也比較困難，而在基因定位中，由于現用定位材料的局限性，常常存在定位不準確的問題，而且在數量性狀基因座QTL定位的技術中，并不是所有的目標QTL都可以被檢測出來，且QTL與環境存在互作、以及大效應的QTL對小效應的QTL的掩蓋等問題。候選基因法必須選擇功能已知的候選基因作為目標基因，基本不能鑒別出新的基因。GWAS是目前為止鑒定SNPs、候選基因或候選基因家族的一種更為有效的方法。眼肌面積性狀與產肉性能有強相關關系，眼肌面積越大，飼料利用率與瘦肉率也越高。對于眼肌面積的選擇可以促進其他的經濟性狀的提升。

杜洛克(Duroc)是世界上著名的瘦肉型豬種之一。其具備生長快，飼料轉化率高，胴體瘦肉率高，肌內脂肪含量較高，抗逆性強的特點。國內商品豬生產已建立起較為成熟的雜交配套體系。其中杜長大的雜交組合在我國的內銷和外銷市場中持續保持絕對的優勢地位。

發明內容

為克服上述現有技術中存在的缺點與不足，本發明的首要目的是提供一種影響眼肌面積性狀的SNP分子標記及其用途，以實現豬眼肌性狀的遺傳改良。

本發明的上述目的通過以下技術手段實現：

一方面，本發明提供了一種影響眼肌面積性狀的SNP分子標記，所述的分子標記的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其中序列中的M是T或G，該分子標記的SNP位點為SEQ IDNO:1序列片段標注位置g.214T>G，其差異導致眼肌面積的不同。所述分子標記的SNP位點對應于國際豬參考基因組11.1版本6號染色體上第35091111bp處的T>G突變。

另一方面，本發明還提供一種用于檢測上述分子標記的引物對，所述引物對的核酸序列如下所示：

上游引物如SEQ ID NO:2所示；

下游引物如SEQ ID NO:3所示。

另一方面，本發明還提供上述的分子標記、引物對、試劑盒在研究/鑒定/檢測/調節的豬眼肌面積性狀，或者是豬繁殖育種中的應用。進一步地，所述的繁殖育種優選為分子標記輔助選擇。

另一方面，本發明還提供了一種鑒定眼肌面積性狀的方法，其包含如下步驟：檢測SEQ ID NO:1序列的5’端第214bp是T還是G(即SEQ ID NO:1序列中的M標記處是T還是G)。該方法可以在豬生長早期對眼肌面積性狀進行鑒定，

作為優選的實施方式，采用上述的引物對進行檢測。