[發明專利]一種高產含有L-Val結構單元的化合物的菌株△mfnH有效
| 申請號: | 201810326214.6 | 申請日: | 2015-10-10 |
| 公開(公告)號: | CN108486028B | 公開(公告)日: | 2021-06-01 |
| 發明(設計)人: | 李青連;鞠建華;秦湘靜;劉靜 | 申請(專利權)人: | 中國科學院南海海洋研究所 |
| 主分類號: | C12N1/21 | 分類號: | C12N1/21;C12R1/465 |
| 代理公司: | 廣州科粵專利商標代理有限公司 44001 | 代理人: | 劉明星 |
| 地址: | 511458 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 高產 含有 val 結構 單元 化合物 菌株 mfnh | ||
本發明公開了氨基轉移酶和異構酶在催化形成L?allo?Ile中的應用。所述的氨基轉移酶為氨基轉移酶DsaD或氨基轉移酶MfnO,所述的異構酶為異構酶DsaE或異構酶MfnH,所述的氨基轉移酶DsaD的氨基酸序列如SEQ ID NO.7所示,所述的異構酶DsaE的氨基酸序列如SEQ ID NO.8所示,所述的氨基轉移酶MfnO的氨基酸序列如SEQ ID NO.5所示,所述的異構酶MfnH的氨基酸序列如SEQ ID NO.6所示。本發明公開了由氨基轉移酶和異構酶組成的酶對在催化形成L?別異亮氨酸或L?異亮氨酸中的應用。從而在酶學水平上解釋L?allo?Ile的生物合成機制奠定了重要的基礎。L?allo?Ile生物合成酶學機制的解釋,將為利用綠色的酶學方法制備L?allo?Ile,以及對楓糖尿癥的診斷和治療具有重要的實用意義。
本申請是申請日:2015年10月10日,申請號:201510651516.7,發明名稱:氨基轉移酶和異構酶在催化形成L-allo-Ile中的應用的專利申請的分案申請。
技術領域:
本發明屬于基因工程和生物催化技術領域,具體涉及一類由磷酸吡哆醛(pyridoxal 5’-phosphate,PLP)依賴的氨基轉移酶(PLP-linked aminotransferase)和一種新型異構酶(isomerase)組成的酶對,在共同協作催化形成L-別異亮氨酸(L-allo-Ile)中的應用。
背景技術:
異亮氨酸具有兩個不對稱中心,因此存在著4種立體異構體:L-異亮氨酸(L-Ile)、D-異亮氨酸(D-Ile)、L-別異亮氨酸(L-allo-Ile)和D-別異亮氨酸(D-allo-Ile),其對應關系如圖1所示。除L-Ile之外,D-Ile,L-allo-Ile和D-allo-Ile均屬于非蛋白質氨基酸,其在自然界中的存在已有相關報道。其中,L-allo-Ile由于其在自然界中的廣泛存在及重要科學意義,而引起了科學家們的特別關注。L-allo-Ile于1985年首次被報道發現,在隨后的研究中,發現其除了存在于植物中,還可以作為結構單元存在于大量的環肽抗生素,如來源于真菌的aureobasidin A,cordyheptapeptides和aspergillicin E,以及來源于放線菌的globomycin,cypemycin,desotamides和marformycins(結構如圖2)。有趣的是,L-allo-Ile還被發現存在于人體血漿中,在健康人群的血漿中,L-allo-Ile的濃度很低,處于幾乎可以被檢測的濃度水平;然而,在患有常染色體隱性遺傳病——楓糖尿癥(maple syrup urinedisease)的病人血漿中,L-allo-Ile卻因為病人的代謝缺陷而得到累積,濃度達到5μM以上,因此,L-allo-Ile在血漿中的濃度水平已經作為診斷楓糖尿癥的重要手段之一。
L-allo-Ile與蛋白質氨基酸L-Ile的結構非常相似,L-allo-Ile與L-Ile的差別在β位的碳原子上的甲基的構象不同。盡管L-allo-Ile在結構上與L-Ile非常相似,以及在自然界中廣泛存在,但目前為止,生命體是如何生物合成L-allo-Ile這種非蛋白質氨基酸,以及在此過程當中涉及的酶和酶促反應機制,還是一個未解之謎。
Desotamides和marformycins從分別從南海深海來源的鏈霉菌Streptomycesscopuliridis SCSIO ZJ46和Streptomyces drozdowiczii SCSIO 10141分離純化得到的兩類環肽類抗生素,研究表明,desotamides對革蘭氏陽性細菌具有較好的抑制活性,而marformycins對痤瘡丙酸桿菌(Propionibacterium acnes)具有較好的抑制作用,是較好的用于治療痤瘡藥物的先導化合物。更為重要的是,這兩類環肽化合物結構中,均含有非蛋白質氨基酸結構單元L-allo-Ile。目前,desotamides和margormycins的生物合成基因簇己經被克隆,以上研究結果為我們在酶學水平上解釋L-allo-Ile的生物合成機制奠定了重要的基礎。L-allo-Ile生物合成酶學機制的解釋,將為利用綠色的酶學方法制備L-allo-Ile,以及對楓糖尿癥的診斷和治療具有重要的實用意義。
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