[發明專利]一種滸苔種群的線粒體分子標記引物及其應用有效

申請號：	201810305129.1	申請日：	2018-04-08
公開（公告）號：	CN108315468B	公開（公告）日：	2021-07-27
發明（設計）人：	高大海;孫忠民;黃超華	申請（專利權）人：	中國科學院海洋研究所
主分類號：	C12Q1/6895	分類號：	C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司：	沈陽科苑專利商標代理有限公司 21002	代理人：	李穎;周秀梅
地址：	266071 ***	國省代碼：	山東;37
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摘要：
搜索關鍵詞：	一種種群線粒體分子標記引物及其應用
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【說明書】：

本發明屬于藻類分子標記技術領域，具體涉及一種滸苔種群的線粒體分子標記引物及其應用。線粒體分子標記引物，所述引物在鑒別滸苔種群的高分辨率線粒體分子標記(rps2?trnL基因間隔區序列)中的應用。本發明方法可檢測藻體樣品，也可對微觀繁殖體樣品進行檢測，比常規方法更可靠實用，進而其對于綠潮災害研究、滸苔種質鑒定、系統發育、系統地理學研究，以及保護和利用滸苔資源方面都具有重要意義。

技術領域

本發明屬于藻類分子標記技術領域，具體涉及一種滸苔種群的線粒體分子標記引物及其應用。

背景技術

滸苔（Ulva prolifera）屬于石莼科、石莼屬，是潮間帶常見的綠藻，在我國廣泛分布。近年來，滸苔的爆發性增殖，在我國黃海大面積漂浮引發“綠潮”災害，為沿岸經濟和生態都造成嚴重的負面影響，引起了社會、媒體、政府和相關學者的廣泛關注。目前的研究已經表明，漂浮的滸苔有別于近岸定生滸苔，是一種單一而獨特的“漂浮生態型”，因此，漂浮滸苔和定生滸苔的關系是綠潮滸苔溯源的關鍵，是指導滸苔災害防控的重要依據。從形態上來說，不同種群滸苔在微觀繁殖體階段沒有區別，而在發育成熟期，漂浮型滸苔常常呈黃綠色，中空管狀，分支較多，而定生滸苔則隨環境不同而具有多變的形態。在分子水平上，目前石莼屬研究中常用的分子標記ITS、rbcL和18S的分辨率無法對滸苔種群進行有效區分，而用于進行種下分析的5S spacer分子標記，由于在基因組中存在多拷貝，在操作中也常常不夠穩定，無法準確判別不同的滸苔種群。由此可見，開發高分辨率的可靠分子標記，將有利于滸苔災害的防控。

發明內容

本發明的目的在于提供一種滸苔種群的線粒體分子標記引物及其應用。

為實現上述目的，本發明采用技術方案為：

一種滸苔種群的線粒體分子標記引物，線粒體分子標記引物為：

上游引物序列：5'AAAATCAAAATCTAGTAAACCAGGC3'（SEQ ID 1）

下游引物序列：5'GCTAGCGATTCTTAACGCGATTGGG3’（SEQ ID 2）。

所述引物在鑒別滸苔種群的高分辨率線粒體分子標記（rps2-trnL基因間隔區序列）中的應用。

一種用于鑒別滸苔種群的高分辨率線粒體分子標記方法，

1）以待測樣品的DNA為模板，以所述鑒定滸苔種群的引物對作為引物，進行PCR擴增；

2）將上述擴增獲得產物經電泳檢測，將電泳檢測中在500bp左右存在條帶（線粒體rps2-trnL基因間隔區）的樣品進一步測序分析，進而高分辨率的鑒別滸苔種群。

所述鑒定滸苔種群的引物對為上游引物序列：5'AAAATCAAAATCTAGTAAACCAGGC3'（SEQ ID 1）；

下游引物序列：5'GCTAGCGATTCTTAACGCGATTGGG3’（SEQ ID 2）。