[發(fā)明專利]一種基于QPCR定量檢測畜禽肉中羊源性成分的方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810303676.6 | 申請日: | 2018-04-03 |
| 公開(公告)號: | CN108384863A | 公開(公告)日: | 2018-08-10 |
| 發(fā)明(設計)人: | 趙新;蘭青闊;陳銳;王永;朱珠 | 申請(專利權(quán))人: | 天津市農(nóng)業(yè)質(zhì)量標準與檢測技術(shù)研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12Q1/6851;C12N15/11 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 300195 *** | 國省代碼: | 天津;12 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 靈敏度 畜禽肉 檢測 應用生物信息學 設計通用引物 實時熒光PCR 單拷貝基因 動物基因組 特異性基因 特異性引物 定量分析 定量檢測 含量鑒定 基因定量 內(nèi)參基因 動物源 肉制品 源種 校正 可信 量化 篩選 分析 | ||
1.用于鑒定羊源性成分含量的PCR擴增引物及探針引物,其特征在于,包括內(nèi)參基因Ref-8引物正向序列:5′-GCTTGAGGGCTGAGTGATAGATTC-3′,Ref-8反向序列:5′-ACACATAAGCTCATCGCAAATCAT-3′,Ref-8探針序列:5′-FAM-CCTGCCTGAAGCATCCCAGTGTGTTT-BHQ1-3′;羊源種屬特異性基因Mutton-3引物正向序列:5′-GATCAAAGGCAGAGATTACCAGTCA-3′,Mutton-3反向序列:5′-TTGTGGTTTGTGATTGATTTTAGTCA-3′,Mutton-3探針序列:5′-FAM-TCGCTCTTCCCCTGCTCCAGACAC-BHQ1-3′。
2.一種采用權(quán)利要求1所述內(nèi)參基因和羊源種屬特異性基因,快速鑒定羊源性成分含量的方法,其特征在于包括如下步驟:
(1)采用權(quán)利要求1所述的內(nèi)參基因PCR引物和探針及Premix Ex Taq(Probe qPCR)預混液,加入供試樣品模板DNA進行PCR擴增;其中的PCR擴增反應體系:擴增反應的總體積為20μL,其各種成分分別為:2×Premix Ex Taq(Probe qPCR)預混液10μL,上下游引物各1μL(濃度為10μmol/L),探針引物0.4μL(濃度為10μmol/L),模板DNA 1μL(濃度為50/μL),用滅菌去離子水補齊至20μL;
反應程序:95℃變性5min;進行45次循環(huán)擴增反應(95℃變性15s,60℃退火延伸1min);在第二階段的退火延伸(60℃)時段收集熒光信號。
(2)構(gòu)建羊源性成分定量檢測標準參照物,采取SDS-硅膠柱改良方法提取DNA梯度稀釋,配制標準曲線。標準溶液中羊源性成分的濃度為50、10、5、1、0.5ng/μL,每個反應加入1μL DNA做模板,每個反應分別對應50、10、5、1、0.5ng,每個反應設置3個平行。根據(jù)標準DNA溶液PCR反應的Ct值及初始模板濃度的對數(shù)分別繪制Ref-8內(nèi)參基因和Mutton-3羊源特異性基因的標準曲線。
(3)設定閾值后,熒光定量PCR儀的數(shù)據(jù)分析軟件自動計算每個反應的Ct值和靶標濃度,并記錄。按照公式A=B/[B+(C-B)/D]×100%,計算出試樣中羊源性成分種屬特異性基因百分含量。
3.如權(quán)利要求2所述的鑒定方法,公式中A為羊源性成分種屬特異性基因百分含量,B為Mutton-3羊源種屬特異性基因的靶標濃度,C為Ref-8內(nèi)參基因的靶標濃度,D為羊源性成分中摻入其他動物源性成分的校正系數(shù),即為羊基因組大小/摻入動物基因組大小。
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