[發明專利]HPV16-HPV18重組序列、包含其的質粒及其應用在審
| 申請號: | 201810261842.0 | 申請日: | 2018-03-28 |
| 公開(公告)號: | CN108342406A | 公開(公告)日: | 2018-07-31 |
| 發明(設計)人: | 李祥;鄒立林 | 申請(專利權)人: | 寧波市凱美生物技術有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/62 | 分類號: | C12N15/62;C12N15/63;C12N15/66;C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 南京品智知識產權代理事務所(普通合伙) 32310 | 代理人: | 奚曉寧 |
| 地址: | 315000 浙江省寧波市杭*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 重組序列 質粒 實時熒光定量PCR 應用 分子診斷 檢測 | ||
1.一種HPV16-HPV18重組序列,序列如SEQID NO.1所示。
2.含有權利要求1所述重組序列的質粒,其特征在于:將SEQID NO.1所示序列插入到pAC57質粒中構建而成。
3.如權利要求2所述的質粒,其特征在于:所述質粒是將pAC57質粒經EcoRⅠ和BamHⅠ雙酶切消化后,與上游加入EcoRⅠ酶切位點、下游加入HindⅢ酶切位點、如SEQID NO.2所示的HPV16 DNA保守序列,和上游加入HindⅢ酶切位點、下游引入BamHⅠ酶切位點、如SEQID NO.3所示的HPV18 DNA保守序列,在連接酶作用下進行連接而成。
4.如權利要求2所述的質粒,其特征在于所述質粒是由如下方法制備得到:
步驟(1):提取HPV16DNA和HPV18 DNA,PCR擴增,
其中,HPV16 DNA擴增的上游引物序列為:
CGGAATTCGACGACTATCCAGCGACCAAG,CGGAATTC為保護堿基及EcoRⅠ酶切位點,
下游引物序列為:
CCAAGCTTTGAGGATTGGAGCACTGTCC,CCAAGCTT為保護堿基及HindⅢ酶切位點;
HPV18擴增的上游引物序列為:
CCAAGCTTGGGTGACACTGTGCCTCAATCC,CCAAGCTT為保護堿基及HindⅢ酶切位點,
下游引物序列為:
CGGGATCCTTGGAGAGGGAGAATACACAC,CGGGATCC為保護堿基及BamHⅠ酶切位點;
步驟(2):將HPV16 DNA PCR擴增產物經EcoRⅠ和HindⅢ雙酶切消化,HPV18 DNA PCR擴增產物經HindⅢ和BamHⅠ雙酶切消化,pAC57質粒經EcoRⅠ和BamHⅠ雙酶切消化;
步驟(3):將步驟(2)所得消化產物純化后在連接酶作用下進行連接即得。
5.權利要求1所述的重組序列和權利要求2至4任一項所述的質粒在檢測HPV16 DNA和/或HPV18 DNA中的應用。
6.如權利要求5所述的應用,其特征在于:權利要求1所述的重組序列和權利要求2至4任一項所述的質粒作為實時熒光PCR檢測HPV16 DNA和/或HPV18 DNA的參考標準品或陽性質控品。
7.如權利要求5所述的應用,其特征在于包括以下步驟:
步驟a:配制一系列濃度的含有本發明HPV16-HPV18重組序列質粒的標準溶液;
步驟b:分別以步驟a中不同濃度的含有本發明HPV16-HPV18重組序列質粒的標準溶液為模板,以GACGACTATCCAGCGACCAAG為上游引物,以TGAGGATTGGAGCACTGTCC為下游引物,以FAM-CGGAAACCCCTGCCACAC-MGB為探針,實時熒光PCR,以濃度為橫坐標,熒光強度為縱坐標,制得HPV16 DNA檢測標準曲線;和/或分別以步驟a中不同濃度的含有本發明HPV16-HPV18重組序列質粒的標準溶液為模板,以GGGTGACACTGTGCCTCAATCC為上游引物,以TTGGAGAGGGAGAATACACAC為下游引物,以VIC-CAGGTGAAGCACGCATA-MGB為探針,實時熒光PCR,以濃度為橫坐標,熒光強度為縱坐標,制得HPV18 DNA檢測標準曲線;
步驟c:提取待測樣品的HPV16DNA,同步驟b的方法進行實時熒光PCR,根據步驟b制得的HPV16 DNA檢測標準曲線得到待測樣品HPV16DNA濃度;和/或提取待測樣品的HPV18DNA,同步驟b的方法進行實時熒光PCR,根據步驟b制得的HPV18 DNA檢測標準曲線得到待測樣品HPV18DNA濃度。
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