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[發明專利]一種用于鑒別擬穴青蟹和鋸緣青蟹的方法有效

專利信息
申請號: 201810235934.1 申請日: 2018-03-21
公開(公告)號: CN108251542B 公開(公告)日: 2021-05-11
發明(設計)人: 陳夏月;李榮華;王春琳;母昌考;宋微微;葉央芳;劉磊;史策 申請(專利權)人: 寧波大學
主分類號: C12Q1/6888 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 北京科億知識產權代理事務所(普通合伙) 11350 代理人: 湯東鳳
地址: 315200 浙*** 國省代碼: 浙江;33
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 用于 鑒別 擬穴青蟹 鋸緣青蟹 方法
【說明書】:

發明提供一種用于鑒別擬穴青蟹和鋸緣青蟹的方法,是提取待檢測的青蟹樣品的核酸樣品,然后用PCR引物對擴增核酸樣品進行基因分型;其中擬穴青蟹中對應的核苷酸片段的序列為SEQ ID NO:1:鋸緣青蟹中對應的核苷酸片段的序列為SEQ ID NO:2。本發明所建立的方法能夠有效的鑒別擬穴青蟹和鋸緣青蟹,其通過高分辨率熔融曲線HRM對待檢測的青蟹進行分型,從而快速、準確鑒別青蟹種質,為青蟹的育苗養殖提供技術支持。

技術領域

本發明屬于分子標記輔助遺傳育種技術領域,具體涉及一種用于鑒別擬穴青蟹和鋸緣青蟹的方法。

背景技術

青蟹屬(Scylla)隸屬于甲殼綱(Crustacea)、十足目(Decapode)、短尾亞目(Brachyura)、梭子蟹科(Portunidae)。廣泛分布于印度一西太平洋沿岸水域,包括東南亞、澳大利亞、日本、印度、南非等海域的紅樹林地區及河口內灣區,在我國主要分布于浙江、福建、臺灣、廣東、廣西和海南沿岸水域。青蟹具有個體大、生長快、適應性強、肉味鮮美、營養豐富等特點,已成為世界性的經濟養殖品種,但是隨著捕撈強度的加大,海洋環境的污染,野生青蟹資源嚴重衰退,根據陳丕茂等人在2002-2004年各礁區拖網調查,蟹類資源密度為180.985kg·km-2,但經濟蟹類所占比例僅為26.69%,且在以往調查中出現率較高且經濟價值較高的鋸緣青蟹未捕到,因此青蟹的人工養殖迫在眉睫。擬穴青蟹和鋸緣青蟹是我們國家常見青蟹種類,由于不同青蟹在養殖生態學、繁殖學、營養學等生理生態方面有較大差異,不同種青蟹育苗要求不同,開展青蟹屬種類的鑒定研究有助于青蟹養殖技術的發展。

發明內容

本發明提供一種用于鑒別擬穴青蟹和鋸緣青蟹的方法,以及該方法所使用的分子標記;通過本發明的方法能夠有效的鑒別擬穴青蟹和鋸緣青蟹,從而彌補現有技術的不足。

本發明的用于鑒別擬穴青蟹和鋸緣青蟹的方法,是提取待檢測的青蟹樣品的核酸樣品,然后用PCR引物對擴增核酸樣品進行基因分型;

其中擬穴青蟹(Scylla paramamosain)中對應的核苷酸片段的序列為SEQ ID NO:1:

AATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTTGCACGGTCAAAATACCGCGGCTATTTAACA-TTTTTGTCAGTGAGCAGGCTAGACTATA;

鋸緣青蟹(Scylla_serrata)中對應的核苷酸片段的序列為SEQ ID NO:2:

AATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTTGCACGGTCAAAATACCGCGGCTATTTAACACTTTTTGTCAGTGAGCAGGCTAGACTATA;

其中所使用的引物對,能夠同時擴增上述核苷酸序列為SEQ ID NO:1和SEQ IDNO:2的基因片段;

作為實施例的一種具體記載,所述的引物對的上游引物的序列如下:

5′-AATTAAAAAACTAATGATTATGCTACC-3′(SEQ ID NO:3)

下游引物的序列如下:

5′-TATAGTCTAGCCTGCTCACTGACA-3′(SEQ ID NO:4);

上述的基因分析是使用高分辨率熔解曲線方法,其中反應程序如下:95℃預變性10min,95℃變性30s,Tm退火30s,72℃30s,45個循環。

本發明所建立的方法能夠有效的鑒別擬穴青蟹和鋸緣青蟹,其通過高分辨率熔融曲線HRM對待檢測的青蟹進行分型,從而快速、準確鑒別青蟹種質,為青蟹的育苗養殖提供技術支持。

附圖說明

圖1:擬穴青蟹和鋸緣青蟹的外部形態圖;

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