[發(fā)明專利]與水稻高產(chǎn)相關(guān)的分支酸變位酶核苷酸序列及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201810234477.4
• 申請日: 2018-03-21
• 公開（公告）號: CN108179222B
• 公開（公告）日: 2020-07-24
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 魯迎青;官山;許云章;高廣通;王曉玲
• 申請（專利權(quán)）人: 中國科學院植物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11;C12N15/61
• 代理公司: 北京紀凱知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245
• 代理人: 關(guān)暢;白艷

本發(fā)明公開了一種與水稻高產(chǎn)相關(guān)的分支酸變位酶核苷酸序列及其應(yīng)用。本發(fā)明所提供的篩選具有不同產(chǎn)量性狀的水稻的方法，可包括如下步驟：(1)檢測待測水稻基于特異基因片段的基因型；所述特異基因片段位于水稻基因組中，為OSCM3，存在OSCM3_a和OSCM3_b兩種等位形式，所述OSCM3_a如序列表的序列1所示，所述OSCM3_b如序列表的序列2所示；(2)進行如下判定：在毗鄰生長條件下比較兩個基因型，為OSCM3_b純合型的水稻群體的平均產(chǎn)量高于基因型為OSCM3_a純合型的水稻群體的平均產(chǎn)量。實驗證明，本發(fā)明提供的方法可有效篩選具有不同單株產(chǎn)量性狀的水稻，且操作簡單，準確率高，在水稻育種中具有重要的應(yīng)用價值。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種與水稻高產(chǎn)相關(guān)的分支酸變位酶核苷酸序列及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

隨著全球人口的增長，培育高產(chǎn)作物的需求與日俱增。水稻(Oryza sativa L.)是地球上多數(shù)人依賴的主食來源之一。在水稻中尋找影響高產(chǎn)的基因組片段，并建立有效評估該基因組片段對產(chǎn)量影響的具體方法，對分子育種的發(fā)展有重要推動作用。育種過程中有針對性地選取親本材料對最終培育出具高產(chǎn)性狀的水稻品種有重要的價值。目前科學和技術(shù)的發(fā)展已經(jīng)為獲得水稻中影響高產(chǎn)性狀的基因組成分、深度利用水稻基因的自然變異提供了可能。

在實踐中，育種方法大多依賴可見性狀或/和分子標記。對與產(chǎn)量相關(guān)基因的鑒定目前大多局限于對突變體的分析等手段。由于影響水稻產(chǎn)量性狀的因子較為復(fù)雜，多種基因的作用和環(huán)境對它們的影響均可能使有效評價基因組片段對產(chǎn)量的影響變得困難。顯然對產(chǎn)量而言，分子育種的一個制約因素是在大田條件下采取有效的實驗設(shè)計，以便確定哪些基因或分子片段適合作為選擇條件。結(jié)合水稻在大田的表現(xiàn)與其功能基因的定量研究對農(nóng)業(yè)育種可以起到指導(dǎo)作用。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明提供了一個被證明可以增加水稻產(chǎn)量的基因序列及其專用特異引物對，并以此為例建立了一個有效評價基因序列影響產(chǎn)量的方法。

本發(fā)明所提供的篩選方法適于選擇高產(chǎn)的水稻(方法甲)，包括如下步驟：

(1)檢測待測水稻基于特異基因片段的基因型；所述特異基因片段位于水稻基因組中，存在至少OSCM3_a和OSCM3_b兩種等位形式，所述OSCM3_a如序列表的序列1所示，所述OSCM3_b如序列表的序列2所示；

(2)進行如下判定：在鄰近生長條件下，基因型為OSCM3_b純合型的水稻群體的平均產(chǎn)量高于基因型為OSCM3_a純合型的水稻群體的平均產(chǎn)量。

所述鄰近生長條件為同一地理區(qū)域內(nèi)相鄰且同等生長條件。

本發(fā)明所提供的篩選方法適于選擇高產(chǎn)的水稻(方法乙)，可包括如下步驟：

(1)以待測水稻的基因組DNA為模板，采用下述特異引物對進行PCR擴增；如果PCR擴增產(chǎn)物只有一種且如序列表中序列1所示，則待測水稻的基因型為OSCM3_a純合型；如果PCR擴增產(chǎn)物只有一種且如序列表中序列2所示，則待測水稻的基因型為OSCM3_b純合型；

(2)進行如下判定：在鄰近生長條件下，基因型為OSCM3_b純合型的水稻群體的平均產(chǎn)量高于基因型為OSCM3_a純合型的水稻群體的平均產(chǎn)量。

本發(fā)明還可以提供一種高產(chǎn)水稻的篩選方法，為方法A或方法B；

所述方法A包括如下步驟：

(1)檢測待測水稻基于特異基因片段的基因型；所述特異基因片段位于水稻基因組中，為OsCM3，存在OsCM3_a和OsCM3_b兩種等位形式，所述OsCM3_a如序列表的序列1所示，所述OsCM3_b如序列表的序列2所示；

(2)進行如下判定：同等生長條件下，基因型為OsCM3_b純合型的水稻群體的平均產(chǎn)量均高于基因型為OsCM3_a純合型的水稻群體的平均產(chǎn)量；