[發明專利]一種篩選用于疾病診斷的菌群分子標記的分析技術

在審

• 申請號: 201810230261.0
• 申請日: 2018-03-20
• 公開（公告）號: CN109473167A
• 公開（公告）日: 2019-03-15
• 發明（設計）人: 倪加加;胡艷;吳瑤
• 申請（專利權）人: 廣東美立康生物科技有限公司
• 主分類號: G16H50/20
• 分類號: G16H50/20;C12Q1/04
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種篩選用于疾病診斷的菌群分子標記的分析技術，其特征是：根據菌群分組信息整理菌群組成相對豐度表，采用方差分析（ANOVA）檢驗方法或Kruskal-Wallis H檢驗方法篩選各疾病組菌群中存在顯著性差異的細菌種群，得到由存在組間顯著差異的細菌種群相對豐度信息組成的數據矩陣A。

2.然后對數據矩陣A進行主成分分析（PCA）和非參數多元方差分析（MANOVA），判斷是否存在能夠被有效區分的疾病組{D11, D12, D13, …, D1n}。

3.如果不存在能夠被有效區分的疾病組{D11, D12, D13, …, D1n}，則說明不存在能夠有效區分所分析疾病的菌群分子標記矩陣；如果存在能夠被有效區分的疾病組{D11,D12, D13, …, D1n}，則確定利用所篩選的數據矩陣A能夠有效區分疾病組{D11, D12,D13, …, D1n}。

4.然后，將刪除疾病組{D11, D12, D13, …, D1n}包含的所有樣品的菌群組成信息，再采用ANOVA檢驗方法或Kruskal-Wallis H檢驗方法從剩余疾病組樣品的全部菌群組成中篩選存在顯著性差異的菌群種群，得到由存在組間顯著差異的細菌種群相對豐度信息組成的數據矩陣B，然后對數據矩陣B進行PCA和MANOVA，判斷是否存在能夠被有效區分的疾病組{D21, D22, D23, …, D2n}。

5.重復以上步驟，直至各組都能夠明顯區分或無法再區分剩余的組為止。

6.權利要求書1-5所述的篩選用于疾病診斷的菌群分子標記的分析技術，其特征在于：采用ANOVA檢驗方法或Kruskal-Wallis H檢驗方法篩選存在組間顯著性差異的微生物種群時，顯著性水平p ≤ 0.05。

7.權利要求書1-5所述的篩選用于疾病診斷的菌群分子標記的分析技術，其特征在于：能夠區分開的疾病組為采用PCA后根據前兩個軸視覺上能夠看到存在明顯差異，同時采用MANOVA以p ≤ 0.05為顯著性水平能夠檢出顯著性差異。