[發明專利]一種基于核心系譜品種的高密度分子標記輔助聚合育種方法

有效

• 申請號: 201810217666.0
• 申請日: 2018-03-16
• 公開（公告）號: CN108371105B
• 公開（公告）日: 2019-10-25
• 發明（設計）人: 王重榮;周少川;周德貴;李宏;黃道強;賴穗春;王志東;陳宜波;吳玉坤
• 申請（專利權）人: 廣東省農業科學院水稻研究所
• 主分類號: A01H6/46
• 分類號: A01H6/46;A01H1/04;A01H1/02;C12Q1/6895
• 代理公司: 廣州市華學知識產權代理有限公司 44245
• 代理人: 崔紅麗;裘暉

1.一種基于核心系譜品種的高密度分子標記輔助聚合育種方法，其特征在于包括如下步驟：

（1）核心系譜品種和需要引入的外源品種進行重測序或SNP芯片檢測，得到SNP分型結果；

（2）利用分型結果，結合性狀關聯的基因組區段信息，分析確定核心系譜品種需要引入的外源片段信息；

（3）將核心系譜品種與需要引入的外源品種雜交，獲得F1代；

（4）F2群體大批量種植，F2群體先利用步驟（2）確定的外源片段內部SNP標記對F2進行篩選，篩選出盡可能多的包含外源片段的F2單株，接著根據表型進行進一步篩選出偏向某一親本或具有某些表型值的F2單株；或者先根據表型篩選出偏向某一親本或具有某些表型值的F2單株，再利用步驟（2）確定的外源片段內部SNP標記對F2進行篩選，篩選出盡可能多的包含外源片段的F2單株，具體操作根據資金與育種目標和條件而定；

（5）步驟（4）篩選后的F2單株不斷進行自交，在這個過程中根據表型不斷保留優質株，直至優良性狀穩定；

（6）根據表型挑選優質株，進行重測序或SNP芯片基因分型，以核心系譜品種為參考進行染色體片段來源分析，保留遺傳背景與核心系譜品種最接近的3～5株結果，再經過1～2代的田間選擇和表型考察，選育出1個株系成為自交系品種；

（7）重復步驟（1）～（6），通過核心系譜品種與眾多優良品種進行雜交、自交、篩選，得到一系列以核心系譜品種為主要遺傳背景的自交系品種；

（8）整合利用步驟（7）得到的一系列以核心系譜品種為主要遺傳背景的自交系品種，進行聚合育種，實現快速定向育種，培育優良品種；

（9）對于親緣關系較接近、農藝性狀差異不大的品種，在步驟（2）時先將需要引入的外源品種雜交，在F1′代或高世代通過與核心系譜品種復交將外源片段引入，再進行步驟（3）～（6）即實現多基因快速聚合，培育優良品種；

所述的核心系譜品種為水稻核心系譜品種。

2.根據權利要求1所述的基于核心系譜品種的高密度分子標記輔助聚合育種方法，其特征在于：

步驟（2）中所述的核心系譜品種需要引入的外源片段信息，分以下情況：

A、對于某個具體的性狀，品種表型指標與核心系譜品種基本一致，遺傳差異較大；對于這種情況，通過雜交重組，引入其他品種的外源片段，與核心系譜品種的片段進行組合，產生累加效應，強強聯合，形成性狀更優良的品種；

B、對于某個具體的性狀，品種表型指標優于核心系譜品種，遺傳差異程度較小；對于這種情況，品種存在效應很強的片段，使得性狀表現優于核心系譜品種，通過找出該品種與核心系譜品種存在差異的片段，通過雜交重組，將該片段引入到核心系譜品種中；

C、對于某個具體的性狀，品種表型指標優于核心系譜品種，遺傳差異程度較大；對于這種情況，品種單個片段的效應或者片段的組合顯著優于核心系譜品種，通過雜交重組，將優勢片段和組合大規模引入到核心系譜品種中。

3.根據權利要求1或2所述的基于核心系譜品種的高密度分子標記輔助聚合育種方法，其特征在于：

所述的核心系譜品種為華南水稻核心系譜品種“黃華占”及其衍生品種。

4.根據權利要求3所述的基于核心系譜品種的高密度分子標記輔助聚合育種方法，其特征在于：所述的黃華占衍生品種為黃廣油占。

5.根據權利要求3所述的基于核心系譜品種的高密度分子標記輔助聚合育種方法，其特征在于：

步驟（2）中所述的結合性狀關聯的基因組區段信息為黃華占系譜基因組區段信息。

6.根據權利要求1或2所述的基于核心系譜品種的高密度分子標記輔助聚合育種方法，其特征在于：

步驟（4）中所述的F2群體大批量種植的群體大小為4000～10000株，根據親本遺傳差異大小和擬導入多少個目標性狀而定。

7.根據權利要求1或2所述的基于核心系譜品種的高密度分子標記輔助聚合育種方法，其特征在于：

步驟（4）中所述的對F2進行篩選時，每個外源片段內部挑選1個SNP標記。

8.根據權利要求1或2所述的基于核心系譜品種的高密度分子標記輔助聚合育種方法，其特征在于：

步驟（6）中所述的優質株的群體大小為10～50株。