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[發明專利]一種血漿直接亞硫酸氫鹽轉化的方法及其應用在審

專利信息
申請號: 201810203756.4 申請日: 2018-03-13
公開(公告)號: CN108265050A 公開(公告)日: 2018-07-10
發明(設計)人: 田茹;陳勇;田媛;李西蘭;余占江;陳永強 申請(專利權)人: 普邁德(北京)科技有限公司
主分類號: C12N15/10 分類號: C12N15/10
代理公司: 北京恒和頓知識產權代理有限公司 11014 代理人: 蔡志勇
地址: 102200 北京市昌平*** 國省代碼: 北京;11
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 亞硫酸氫鹽 游離DNA 血漿 轉化 血漿游離DNA 高靈敏度 離心操作 轉化體系 保護劑 雜蛋白 磁珠 脂質 回收率 樣本 應用 自動化 回收
【權利要求書】:

1.一種血漿直接亞硫酸氫鹽轉化的方法及其應用,其特征在于,包括如下步驟:

(1)向離心管內加入血漿、樣本處理液、蛋白酶K和亞硫酸氫鹽溶液,充分混勻,高溫條件下恒溫孵育;

(2)向上述反應液中加入20~35μL磁珠和結合液,渦旋混勻,調節恒溫振蕩器轉速800~1500rpm,溫度18~50℃,孵育20~60min,孵育結束后將反應管置于磁力架,靜置1-10min,棄去殘余液體;

(3)加入漂洗液I,充分混勻,所得反應液置于磁力架,靜置1~10min,棄去殘余液體;

(4)加入漂洗液II,充分混勻,所得反應液置于磁力架,靜置1~10min,棄去殘余液體;

(5)重復步驟(4),室溫條件保證管內水分蒸發完全;

(6)向上述管內加入適量洗脫液45~100μL,37~60℃恒溫孵育5~15min,使結合在磁珠上的DNA充分洗脫下來,并轉移至新的不含核酸酶的離心管內,適當條件保存。

2.根據權利要求1所述,樣本處理液為Tris-HCl、二甲醚、鹽酸胍、異硫氰酸胍中的一種或幾種組合,優選為Tris-HCl、鹽酸胍,更優選濃度為10mmol/L、pH為7.4~8.0的Tris-HCl和3~5mol/L的鹽酸胍混合液。

3.根據權利要求1所述,亞硫酸氫鹽溶液成分優選為重亞硫酸鈉、亞硫酸氫鈉、焦亞硫酸鈉、亞硫酸氫氨、酸式亞硫酸鈉中的一種或幾種的組合,更優選為亞硫酸氫鈉和焦亞硫酸鈉的混合液,pH值優選為4.5~6.0,濃度優選為3mol/L~6mol/L,更優選為4.5mol/L;其中的保護劑成分優選為水溶性維生素E,濃度優選為0.5~20μg/ml。

4.根據權利要求1所述,其中所述高溫在50℃~95℃,優選為50℃~65℃,孵育時間為30min~24h,優選為40~60min。

5.根據權利要求1所述,磁珠為納米磁性顆粒為超順四氧化三鐵或超順三氧化二鐵顆粒,且顆粒外表由表面修飾有羥基的二氧化硅包被,本發明磁珠優選為納米磁珠,比表面積更大,核酸吸附性更強。

6.根據權利要求1所述,結合液為濃度1~8mol/L離液序列高的鹽溶液,鹽溶液如成分涉及碘化鈉、高氯酸鈉、硫氰酸胍、異硫氰酸胍或鹽酸胍中的一種或多種組合,本發明優選濃度為2~6mol/L的鹽酸胍。

7.根據權利要求書1所述,漂洗液I為堿性溶液,最優選為NaOH溶液,或含有NaOH的混合液,其中NaOH濃度在5~300mmol/L。

8.根據權利1所述漂洗液II為50%~90%的乙醇溶液(分析純級別),優選為75%。

9.根據權利1所述,洗脫液為TE溶液或無核酸酶的去離子水。

10.本發明所述血漿直接亞硫酸氫鹽轉化方法所得DNA可用于多種分子生物學下游試驗,尤其適用于甲基化特異PCR檢測(Methylation-specific PCR,MSP),。

11.一種血漿直接亞硫酸氫鹽轉化的試劑盒,其特征在于所用方法為權利要求1所述的方法,可用于多種分子生物學下游試驗,尤其適用于甲基化特異PCR檢測(Methylation-specific PCR,MSP)。

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