[發明專利]一種與綿羊毛伸直長度性狀相關的分子標記及其應用在審
| 申請號: | 201810167543.0 | 申請日: | 2018-02-28 |
| 公開(公告)號: | CN108165638A | 公開(公告)日: | 2018-06-15 |
| 發明(設計)人: | 李文蓉;劉書東;陳磊;賀三剛;馬燕;瑪依拉;劉明軍 | 申請(專利權)人: | 新疆畜牧科學院生物技術研究所(新疆畜牧科學院中國-澳大利亞綿羊育種研究中心) |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京華仲龍騰專利代理事務所(普通合伙) 11548 | 代理人: | 李靜 |
| 地址: | 830001 新疆維吾爾自治*** | 國省代碼: | 新疆;65 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 伸直 分子標記 性狀 分子標記輔助選擇 應用 堿基突變 突變位點 | ||
本發明公開了一種與綿羊毛伸直長度性狀相關的分子標記及其應用。分子標記的序列全長為634bp,在該序列的第315bp處有一個C315?T315的堿基突變。記為“W”,“W”之后的括號即(C/T)為突變位點。本發明是一種與綿羊毛伸直長度性狀相關的分子標記,可應用于綿羊毛伸直長度性狀相關的分子標記輔助選擇。
技術領域
本發明涉及綿羊的分子標記輔助選擇技術領域,具體是一種與綿羊毛伸直長度性狀相關的分子標記及其應用。
背景技術
綿羊毛是紡織業主要的天然纖維原料,用途廣泛,其制品具有自然、舒適、輕薄、柔軟、抗靜電等特點。羊毛的品質性狀決定著羊毛的經濟價值和工藝價值。伸直長度是細羊毛的主要物理性質,它在評價羊毛品質和經濟價值上占重要地位,并影響羊毛加工過程中的生產工藝設計。在相同細度的情況下,羊毛伸直長度愈長,紡紗性能愈高,羊毛制品的成品品質越好(趙有璋.羊生產學[M].北京:中國農業出版社,1999)。然而,綿羊毛的羊毛長度屬于遺傳力中等偏低的復雜數量性狀,運用常規育種方法需要很長時間才能改善和提高品種的羊毛長度。只有在掌握影響或控制綿羊長度性狀的主效基因和遺傳標記的基礎上,才能將獲得的候選基因/標記和設計方法應用于提高羊毛長度性狀的選擇和遺傳改良。因此,對綿羊毛伸直長度相關基因的克隆和鑒定可為解釋綿羊毛伸直長度和毛囊發育的遺傳機制提供重要線索,并為綿羊的毛品質性狀遺傳改良提供理論依據。
尋找基因中的多態位點,通過與性狀間的關聯分析發現基因與性狀間的關系是研究基因功能的一個重要手段,也是進行標記輔助選擇和改善羊毛長度的前提和基礎。MLH1基因在DNA修復方面發揮著重要作用,MLH1蛋白與hPMS2蛋白形成異二聚體hMutLα識別并結合hMutSα(hMSH2-hMSH6復合物)和hMutSβ(hMSH2-hMSH3復合物)兩種異源二聚體,參與錯配堿基的修復過程(Nijaguna B.Prasad,Helina Somervell,Ralph P.Tufano,AlanP.B.Dackiw,Michael R.Marohn,Joseph A.Califano,Yongchun Wang,William H.Westra,Douglas P.Clark,Christopher B.Umbricht,Steven K.Libutti,and MarthaA.Zeiger.Identification of Genes Differentially Expressed in Benign versusMalignant Thyroid Tumors[J].Clin Cancer Res.2008June 1;14(11):3327–3337.)。此外,該基因位于綿羊基因組OAR19的10.40MB-10.49MB區域內,與皮膚的生物學發生相關。該基因的突變能引起人類Muir-Torre綜合征,該病的主要特點是患者易感皮脂腫瘤(或多發角化棘皮瘤),皮膚及毛發出現異常,發病時一般先出現皮膚癥狀(Daniele Castiglia,Elena Pagani,Ester Alvino,Patrizia Vernole,Giancarlo Marra,Elda Cannavò,JosefJiricny,Giovanna Zambruno,Stefania D'Atri.Biallelic somatic inactivation ofthe mismatch repair gene MLH1 in a primary skin melanoma[J].Genes ChromosomesCancer.2003Jun;37(2):165-75.)。通過全基因組關聯分析的方法,對364只美利奴羊細毛羊的50K全基因組SNP芯片的與其羊毛伸直長度構建混合線性模型(Mixed liner model,MLM)。發現s33115.1為與綿羊毛伸直長度性狀差異極顯著相關的位點(p=0.05/47025=1.06×10-06=10-5.97)。該位點位于綿羊基因組3.1版本19號染色體第10480482bp處,這個堿基突變處于MLH1基因內。以上研究證明,MLH1基因參與多種生物學過程,可能與皮膚及毛發的生長相關。
因此,本發明探討MLH1基因與綿羊毛伸直長度的關系,尋求獲得一種與綿羊毛伸直長度性狀相關的分子標記。
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