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[發(fā)明專利]檢測染色體畸變的方法有效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201810147310.4 申請日: 2016-06-23
公開(公告)號: CN108467884B 公開(公告)日: 2023-01-17
發(fā)明(設計)人: 皮爾·馬格拉夫-羅加拉;斯文·豪克 申請(專利權)人: 茲托視覺有限公司
主分類號: C12Q1/6841 分類號: C12Q1/6841
代理公司: 青島聯(lián)智專利商標事務所有限公司 37101 代理人: 邵新華;遲承柏
地址: 德國不*** 國省代碼: 暫無信息
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摘要:
搜索關鍵詞: 檢測 染色體 畸變 方法
【權利要求書】:

1.至少四個彼此不同的位點特異性雜交探針在制備用于通過原位雜交,通過檢測生物樣品中的染色體區(qū)域和/或DNA區(qū)域而檢測其中基因ALK和ROS1受影響的染色體倒位和/或易位的診斷劑中的用途,其中所述原位雜交以間期原位雜交形式進行,其中

(a)標記有檢測標記A的第一位點特異性雜交探針和標記有檢測標記B的第二位點特異性雜交探針位于第一染色體片段的遠端和近端側面,并在通過原位雜交生成的信號圖像中產生融合信號A-B,

(b)標記有檢測標記A的第三位點特異性雜交探針和標記有檢測標記B的第四位點特異性雜交探針位于第二染色體片段的遠端和近端側面,并在通過原位雜交生成的信號圖像中產生融合信號A-B,且

(c)所述第三位點特異性雜交探針和/或所述第四位點特異性雜交探針標記有另外的檢測標記X1,并在通過原位雜交生成的信號圖像中產生融合信號和混合信號A-B/X1,

其中所述另外的檢測標記X1不同于所述檢測標記A和B,和

其中所述雜交探針由所述檢測標記直接標記,所述檢測標記是熒光染料并且與探針中的核酸或核酸片段偶聯(lián),

其中混合信號是由至少兩個彼此不同并位于同一位點特異性雜交探針上的檢測標記產生的信號;和

其中利用所述信號圖像識別存在的染色體畸變,和/或將存在的染色體畸變分配至染色體區(qū)域和/或DNA區(qū)域。

2.根據(jù)權利要求1所述的用途,

其中使用至少六個不同的位點特異性雜交探針,其中在每種情況下,兩個位點特異性雜交探針位于染色體片段的遠端和近端側面。

3.根據(jù)權利要求2所述的用途,其中

(a)標記有檢測標記A的第一位點特異性雜交探針和標記有檢測標記B的第二位點特異性雜交探針位于染色體片段的遠端和近端側面,并在通過原位雜交生成的信號圖像中產生融合信號A-B,

(b)2至12個另外的位點特異性雜交探針位于多達六個另外的染色體片段的遠端和近端側面,其中另外,在每種情況下,

位于染色體片段的遠端和近端側面的兩個位點特異性雜交探針中的一個標記有檢測標記A,且在每種情況下,位于染色體片段的遠端和近端側面的兩個位點特異性雜交探針中的一個標記有檢測標記B,使得在每種情況下,位于染色體片段的遠端和近端側面的所述位點特異性雜交探針在通過原位雜交產生的信號圖像中產生融合信號A-B,和

(c)至少一個所述位點特異性雜交探針標記有至少一個另外的檢測標記X,使得標記有所述至少一個另外的檢測標記X的位點特異性雜交探針在通過原位雜交產生的信號圖像中產生融合信號和混合信號A-B/X,

其中,在通過原位雜交產生的信號圖像中,染色體畸變處的融合信號和混合信號A-B/X變?yōu)榛旌闲盘朅/X和/或B/X,和/或

其中,在通過原位雜交產生的信號圖像中,染色體畸變處的融合信號A-B變?yōu)閱蝹€信號A和/或B,

使得使用通過原位雜交產生的信號圖像,染色體畸變被分配至染色體區(qū)域和/或DNA區(qū)域和/或被分配至兩個位點特異性雜交探針位于遠端和近端側面的染色體片段。

4.根據(jù)權利要求3所述的用途,其中多個所述位點特異性雜交探針標記有至少一個另外的檢測標記X,使得標記有至少一個另外的檢測標記的位點特異性雜交探針在通過原位雜交產生的信號圖像中產生融合信號和混合信號A-B/X。

5.根據(jù)權利要求1-3中任一項所述的用途,

其中所述位點特異性雜交探針在每種情況下由覆蓋待測染色體區(qū)域和/或DNA區(qū)域的單核酸片段形成。

6.根據(jù)權利要求1-3中任一項所述的用途,其中所述位點特異性雜交探針在每種情況下由覆蓋待測染色體區(qū)域和/或DNA區(qū)域的多個核酸片段形成。

7.根據(jù)權利要求1-3中任一項所述的用途,

(i)其中雜交特異性探針的單個核酸片段僅用一個檢測標記進行標記,和/或

(ii)其中雜交特異性探針的單個核酸片段用多個彼此不同的檢測標記進行標記,

其中可能性(i)和(ii)的組合還產生混合信號。

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