[發明專利]應用于分布式基因組分析的快速I/O系統在審
| 申請號： | 201810102016.1 | 申請日： | 2018-02-01 |
| 公開（公告）號： | CN108280214A | 公開（公告）日： | 2018-07-13 |
| 發明（設計）人： | 馬志強;薛紅;顧磷;李威潔 | 申請（專利權）人： | 馬志強 |
| 主分類號： | G06F17/30 | 分類號： | G06F17/30 |
| 代理公司： | 北京市萬慧達律師事務所 11111 | 代理人： | 王虎;梁順珍 |
| 地址： | 中國香港新界*** | 國省代碼： | 中國香港;81 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 計算節點 基因組分析 文件系統 掛載 集群 寫入 分布式文件系統 傳統文件系統 讀取 分布式計算 基因組數據 存儲系統 臨時存儲 數據節點 寫入文件 自動保存 進程 耦合 多節點 高通量 磁盤 代理 副本 應用 存儲 退出 名字 分析 | ||
【權利要求書】：
1.應用于分布式基因組分析的快速I/O系統，其特征在于，它使用分布式文件系統HDFS作為基本存儲系統，利用每個節點的本地磁盤提高多節點分布式計算中的基因組數據的高通量的I/O功能；
HDFS集群與基因組分析計算節點耦合；其中一個計算節點作為HDFS的名字節點；所有計算節點用作HDFS數據節點；寫入文件系統的數據在集群中的3個不同節點上存儲3個副本；
在每個計算節點上，啟動NFS代理；NFS代理向計算節點提供文件系統支持；在每個計算節點上，通過NFS代理將HDFS掛載為文件系統MF；
在每個計算節點上，本地文件系統LF用作臨時存儲；計算節點上的分析進程像讀取傳統文件系統一樣從掛載文件系統MF讀取數據；對于要寫入的數據，將數據寫入LF；在LF中，由進程生成的文件將在進程退出之前自動保存到MF；
HDFS存儲節點是同一組分析計算節點；計算節點上的分析進程可以通過掛載的文件系統MF對HDFS的數據節點進行I/O操作。
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