[發(fā)明專利]與大豆種子油分含量相關(guān)的SNP標(biāo)記、區(qū)間、引物及應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201810083844.5
• 申請(qǐng)日: 2018-01-29
• 公開（公告）號(hào): CN107988422B
• 公開（公告）日: 2021-01-12
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 王洋;王躍強(qiáng);邱紅梅;侯云龍;馬曉萍;于妍;高淑芹;陳健;胡金海;王麗
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 吉林省農(nóng)業(yè)科學(xué)院
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 西安銘澤知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 61223
• 代理人: 韓曉娟

本發(fā)明屬于大豆分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種與大豆種子油分含量相關(guān)的SNP標(biāo)記、區(qū)間、引物及應(yīng)用。所述SNP標(biāo)記位于大豆第18號(hào)染色體的43173920位，所述SNP標(biāo)記的核苷酸為A或T；所述標(biāo)記序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述標(biāo)記區(qū)間是大豆第18號(hào)染色體的43163920位?43183920位區(qū)間。該SNP標(biāo)記屬于共顯性的標(biāo)記，可靠且使用方便，這為大豆高油分品系選育提供了極大的便利，可應(yīng)用于大豆種子油分組分改良中的分子標(biāo)記輔助選擇以及在種子油分含量相關(guān)基因的精細(xì)定位以及圖位克隆中的應(yīng)用，從而加速大豆種子油分含量性狀的改良進(jìn)程。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于大豆分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種與大豆種子油分含量相關(guān)的SNP標(biāo)記、區(qū)間、引物及應(yīng)用。

背景技術(shù)

大豆是重要的油料作物，其油脂是食品業(yè)、工業(yè)深加工以及醫(yī)療保健藥品的重要來(lái)源。大豆油脂中不飽和脂肪酸含量高達(dá)85%，其中亞油酸和亞麻酸是人體必需脂肪酸，具有降低血清膽固醇和甘油三酯及軟化血管等重要生理功能，被營(yíng)養(yǎng)學(xué)家稱之為“安全脂肪酸”。關(guān)于大豆油分表型鑒定的研究早有報(bào)道。大豆種質(zhì)資源油分含量及脂肪酸組分存在廣泛的遺傳變異。科學(xué)工作者測(cè)定了18840份大豆種質(zhì)資源的油分含量，油分含量在15.10%～20.00%之間的種質(zhì)居多為92.40%，油分含量小于15.10%或大于20.00%的特異種質(zhì)較少為7.60%，遺傳多樣性指數(shù)為2.61。種質(zhì)資源油分表型鑒定，為種質(zhì)創(chuàng)新與育種奠定了基礎(chǔ)，但種質(zhì)較多、數(shù)據(jù)量較大且缺乏脂肪酸組成分級(jí)評(píng)價(jià)，不利于高油種質(zhì)的利用。

近十余年，伴隨測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，使研究者對(duì)大豆基因組有了較全面的認(rèn)識(shí)。對(duì)17株野生大豆和14株栽培大豆的基因組重測(cè)序研究表明，發(fā)現(xiàn)了630多萬(wàn)個(gè)SNPs，分析表明，大豆存在較高程度的連鎖不平衡（linkage disequilibrium，LD），有利于對(duì)目標(biāo)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。1996年，首次利用LD定位了躁郁癥相關(guān)基因。關(guān)聯(lián)分析是LD應(yīng)用的一種，其檢測(cè)的是某群體內(nèi)處于LD狀態(tài)的一些標(biāo)記或候選基因的遺傳變異與特定表型顯著關(guān)聯(lián)的頻率是否比期望的高。目前關(guān)聯(lián)分析已廣泛應(yīng)用于植物研究，如大豆籽粒蛋白質(zhì)含量，水稻氨基酸組分，黑小麥鋁毒抗性等。近年利用關(guān)聯(lián)分析法開發(fā)目標(biāo)性狀功能標(biāo)記，已成為分子生物學(xué)研究的熱點(diǎn)之一。分子標(biāo)記輔助選擇可顯著提高種子油分含量遺傳改良進(jìn)程。

迄今為止，通過(guò)連鎖分析對(duì)大豆種子油分含量相關(guān)基因進(jìn)行數(shù)量性狀基因位點(diǎn)(Quantitative trait locus，QTL)定位研究的較多，現(xiàn)發(fā)現(xiàn)100余個(gè)大豆種子油分含量相關(guān)QTL，主要分布在F、G、M、C2、I等連鎖群上，相關(guān)的作用機(jī)理及其應(yīng)用研究還尚未充分進(jìn)行。然而并未發(fā)現(xiàn)與大豆種子油分含量性狀相關(guān)的SNP（Single nucleotidepolymorphism，單核苷酸的多態(tài)性）分子標(biāo)記，給大豆種子油分含量性狀的遺傳改良和分子標(biāo)記輔助選擇育種帶來(lái)了困難。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明提供的一種與大豆種子油分含量相關(guān)的SNP標(biāo)記、區(qū)間、引物及應(yīng)用，該SNP標(biāo)記與大豆種子油分含量性狀密切相關(guān)，可以更有效反應(yīng)大豆種子油分含量，可用于大豆分子標(biāo)記輔助選擇育種和遺傳改良，顯著提高種子油分含量較大材料的選擇效率。

本發(fā)明的第一個(gè)目的是提供一種與大豆種子油分含量相關(guān)的SNP標(biāo)記，所述SNP標(biāo)記位于大豆第18號(hào)染色體的43173920位，所述SNP標(biāo)記的核苷酸為A或T。

本發(fā)明的第二個(gè)目的是提供一種含有所述的與大豆種子油分含量相關(guān)的SNP標(biāo)記的標(biāo)記序列，所述標(biāo)記序列的核苷酸序列如SEQ ID NO. 1所示。

本發(fā)明的第三個(gè)目的是提供一種含有所述的與大豆種子油分含量相關(guān)的SNP標(biāo)記的標(biāo)記區(qū)間，所述標(biāo)記區(qū)間是大豆第18號(hào)染色體的43163920位-43183920位區(qū)間區(qū)間。

本發(fā)明的第四個(gè)目的是提供一種擴(kuò)增所述的標(biāo)記序列的引物，所述引物為：