[發明專利]與大豆種子油分含量相關的分子標記、區間、引物及應用

有效

• 申請號: 201810083241.5
• 申請日: 2018-01-29
• 公開（公告）號: CN107988421B
• 公開（公告）日: 2021-01-15
• 發明（設計）人: 王躍強;侯云龍;邱紅梅;王洋;馬曉萍;于妍;高淑芹;陳健;胡金海;王麗
• 申請（專利權）人: 吉林省農業科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 西安銘澤知識產權代理事務所(普通合伙) 61223
• 代理人: 韓曉娟

本發明屬于大豆分子生物學技術領域，具體涉及一種與大豆種子油分含量相關的分子標記、區間、引物及應用。所述SNP標記位于大豆第10號染色體的9763969位，所述分子標記的核苷酸為C或T；含有所述標記序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述標記區間是大豆第10號染色體的9753969位?9773969位區間。該SNP標記屬于共顯性的標記，可靠且使用方便，這為大豆高油分品系選育提供了極大的便利，可應用于大豆種子油分組分改良中的分子標記輔助選擇以及在種子油分含量相關基因的精細定位以及圖位克隆中的應用，從而加速大豆種子油分含量性狀的改良進程。

技術領域

本發明屬于大豆分子生物學技術領域，具體涉及一種與大豆種子油分含量相關的分子標記、區間、引物及應用。

背景技術

大豆是重要的油料作物，其油脂是食品業、工業深加工以及醫療保健藥品的重要來源。大豆油脂中不飽和脂肪酸含量高達85%，其中亞油酸和亞麻酸是人體必需脂肪酸，具有降低血清膽固醇和甘油三酯及軟化血管等重要生理功能，被營養學家稱之為“安全脂肪酸”。關于大豆油分表型鑒定的研究早有報道。大豆種質資源油分含量及脂肪酸組分存在廣泛的遺傳變異。科學工作者測定了18840份大豆種質資源的油分含量，油分含量在15.10%～20.00%之間的種質居多為92.40%，油分含量小于15.10%或大于20.00%的特異種質較少為7.60%，遺傳多樣性指數為2.61。種質資源油分表型鑒定，為種質創新與育種奠定了基礎，但種質較多、數據量較大且缺乏脂肪酸組成分級評價，不利于高油種質的利用。

近十余年，伴隨測序技術的發展，使研究者對大豆基因組有了較全面的認識。對17株野生大豆和14株栽培大豆的基因組重測序研究表明，發現了630多萬個SNPs，分析表明，大豆存在較高程度的連鎖不平衡（linkage disequilibrium，LD），有利于對目標性狀進行關聯分析。1996年，首次利用LD定位了躁郁癥相關基因。關聯分析是LD應用的一種，其檢測的是某群體內處于LD狀態的一些標記或候選基因的遺傳變異與特定表型顯著關聯的頻率是否比期望的高。目前關聯分析已廣泛應用于植物研究，如大豆籽粒蛋白質含量，水稻氨基酸組分，黑小麥鋁毒抗性等。近年利用關聯分析法開發目標性狀功能標記，已成為分子生物學研究的熱點之一。分子標記輔助選擇可顯著提高種子油分含量遺傳改良進程。

迄今為止，通過連鎖分析對大豆種子油分含量相關基因進行數量性狀基因位點(Quantitative trait locus，QTL)定位研究的較多，現發現100余個大豆種子油分含量相關QTL，主要分布在F、G、M、C2、I等連鎖群上，相關的作用機理及其應用研究還尚未充分進行。然而并未發現與大豆種子油分含量性狀相關的SNP（Single nucleotidepolymorphism，單核苷酸的多態性）分子標記，給大豆種子油分含量性狀的遺傳改良和分子標記輔助選擇育種帶來了困難。

發明內容

本發明提供的一種與大豆種子油分含量相關的分子標記、區間、引物及應用，該分子標記與大豆種子油分含量性狀密切相關，可以更有效反應大豆種子油分含量，可用于大豆分子標記輔助選擇育種和遺傳改良，顯著提高種子油分含量較大材料的選擇效率。

本發明的第一個目的是提供一種與大豆種子油分含量相關的分子標記，所述分子標記位于大豆第10號染色體的9763969位，所述分子標記的核苷酸為C或T。

本發明的第二個目的是提供一種含有所述的與大豆種子油分含量相關的分子標記的標記序列，所述標記序列的核苷酸序列如SEQ ID NO. 1所示。

本發明的第三個目的是提供一種含有所述的與大豆種子油分含量相關的分子標記的標記區間，所述標記區間是大豆第10號染色體的9753969位-9773969位區間。

本發明的第四個目的是提供一種擴增所述的標記序列的引物，所述引物為：

M10-O1F：5’- AAACAGGATGCTACCGCA -3’，如SEQ ID NO. 2所示，