[發(fā)明專利]Y染色體STR熒光標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)及試劑盒

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201810064956.6
• 申請(qǐng)日: 2018-01-23
• 公開（公告）號(hào): CN110066877A
• 公開（公告）日: 2019-07-30
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 李生斌;熊文娟;伏東科;沈瑞霖
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 深圳華大法醫(yī)科技有限公司
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888;C12Q1/6851;C12N15/11
• 代理公司: 深圳鼎合誠知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 44281
• 代理人: 廖金暉;彭家恩

本發(fā)明公開了一種Y染色體STR熒光標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)及試劑盒，其中，Y染色體STR熒光標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)包括針對(duì)Y染色體上27個(gè)位點(diǎn)設(shè)計(jì)的熒光標(biāo)記的引物，27個(gè)位點(diǎn)包括20個(gè)低突變位點(diǎn)和7個(gè)高突變位點(diǎn)。由于結(jié)合了低突變位點(diǎn)和高突變位點(diǎn)的各種優(yōu)勢，在維持低突變率的前提下增加了對(duì)男性個(gè)體的識(shí)別率，具有較高的分辨率及靈敏度，對(duì)低濃度的DNA模板能夠進(jìn)行完整準(zhǔn)確的分型；另外，27個(gè)位點(diǎn)參考炎黃基因組和人類基因組數(shù)據(jù)，選擇了黃種人﹑白種人和黑種人的特征位點(diǎn)，其中包含了公安Y?STR建庫家系排查所有位點(diǎn)，使得本Y染色體STR熒光標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)及試劑盒能夠用于家譜構(gòu)建或溯源及基于男性犯罪的建庫排查等。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及基因檢測技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種Y染色體STR熒光標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)及試劑盒。

背景技術(shù)

短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeats,STR)又稱微衛(wèi)星，是由2～6個(gè)堿基構(gòu)成的核心單元串聯(lián)重復(fù)形成，在人類基因組中分布廣泛，約占整個(gè)基因組的10％，且遺傳多態(tài)性高，是目前用于個(gè)體識(shí)別，親緣鑒定和群體遺傳學(xué)研究最廣泛的遺傳標(biāo)記。與其他遺傳標(biāo)記相較，STR位點(diǎn)片段小，易于擴(kuò)增，適用于微量和降解檢材，此外各位點(diǎn)能同時(shí)進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增，具有信息量大，靈敏，準(zhǔn)確，快速及高效等優(yōu)點(diǎn)。基于上述優(yōu)點(diǎn)，STR位點(diǎn)在國內(nèi)外人類遺傳學(xué)，法醫(yī)學(xué)，醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)等相關(guān)領(lǐng)域得到廣泛的應(yīng)用，尤其是在建立人類DNA數(shù)據(jù)庫方面，STR復(fù)合擴(kuò)增技術(shù)具有極大的優(yōu)越性，且是眾多國家的主流技術(shù)。

Y染色體STR遺傳標(biāo)記是Y染色體非重組區(qū)域的短串聯(lián)重復(fù)序列。目前，已發(fā)現(xiàn)并以各種形式命名的Y-STR位點(diǎn)可達(dá)220多種。與常染色體STR遺傳標(biāo)記不同，Y染色體STR遺傳標(biāo)記具有男性特有、父系遺傳及單倍型遺傳等三大特征。Y-STR檢驗(yàn)作為常染色體的一種補(bǔ)充手段，在男性家系排查，父系親權(quán)鑒定及一些男性犯罪案件中男女混合樣本中男性成分的鑒定具有重要價(jià)值。因此，Y-STR檢測在DNA鑒定中也扮演著越來越重要的角色。

然而，不同的Y-STR位點(diǎn)突變速率并不一樣，法醫(yī)上往往將突變率高于1％的Y-STR位點(diǎn)稱為快速突變位點(diǎn)，這類位點(diǎn)一般具有較高的多態(tài)性，從而具有較高的相關(guān)男性區(qū)分能力，但位點(diǎn)突變率較高會(huì)干擾某些情況的Y-STR家系排查，造成同系異型的現(xiàn)象。

為此，結(jié)合快速突變位點(diǎn)及低突變率位點(diǎn)各自優(yōu)勢，開發(fā)出既能滿足Y-STR數(shù)據(jù)建庫又對(duì)男性近親具有較高識(shí)別度的試劑盒具有重要意義。

目前國內(nèi)外的試劑盒如下：

(1)國外:具有代表性的為AB公司的Yfiler Plus，該試劑盒采用6色熒光標(biāo)記，包含27個(gè)位點(diǎn)；Promega公司的Y23，采用5色熒光標(biāo)記，包含23個(gè)位點(diǎn)；QIAGEN的Investigator Argus Y-12QS Kit采用4色熒光標(biāo)記，包含12個(gè)位點(diǎn)。

(2)國內(nèi)：基點(diǎn)認(rèn)知的Goldeneye 26Y，采用5色熒光標(biāo)記，包含26個(gè)位點(diǎn)；閱微基因的MicroreaderTM24Y Direct ID System，采用5色熒光標(biāo)記，包含24個(gè)位點(diǎn)；中德美聯(lián)的AGCU Data Y24，采用5色熒光標(biāo)記，包含24個(gè)位點(diǎn)等。

目前國內(nèi)外的試劑盒具有如下缺點(diǎn)：

(1)國外：試劑盒成本高且價(jià)格昂貴，包含位點(diǎn)數(shù)少，可涵蓋的遺傳信息量少。

(2)國內(nèi):包含位點(diǎn)少，靈敏度不高，不適合較低模板量下樣本的分析。

發(fā)明內(nèi)容

本申請(qǐng)?zhí)峁┮环N位點(diǎn)多，靈敏度高，并適用于低模板量下樣本的分析的Y染色體STR熒光標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)及試劑盒。