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[發明專利]一種基于DNA條形碼的白蟻快速分類鑒定方法在審

專利信息
申請號: 201810050784.7 申請日: 2018-01-18
公開(公告)號: CN108118090A 公開(公告)日: 2018-06-05
發明(設計)人: 陳尚海;張亮;曾小虎;徐鵬;余盛;劉顯波 申請(專利權)人: 成都市房屋安全事務中心
主分類號: C12Q1/6869 分類號: C12Q1/6869
代理公司: 成都頂峰專利事務所(普通合伙) 51224 代理人: 何紅信
地址: 610000 四川*** 國省代碼: 四川;51
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 白蟻 特征片段 樣本DNA 快速分類 線粒體 樣本 條形碼數據庫 采集 比對 數據庫 分類
【權利要求書】:

1.一種基于DNA條形碼的白蟻快速分類鑒定方法,其特征在于,包括以下步驟:

A、選取在形態分類上鑒定準確且與模式標本核對過的白蟻樣本為模板,提取樣本DNA,選擇線粒體COI為特征片段,進行PCR擴增和Sanger測序,獲得相應序列,從而建立白蟻樣本DNA條形碼數據庫;

B、采集待測白蟻樣本,提取樣本DNA,選擇線粒體COI為特征片段進行PCR擴增和Sanger測序,獲得待測白蟻特征片段序列;

C、將步驟B獲得的待測白蟻特征片段序列與步驟A建立的DNA條形碼數據庫進行比對,判斷白蟻種類。

2.根據權利要求1所述的基于DNA條形碼的白蟻快速分類鑒定方法,其特征在于,所述步驟A和B中,提取樣本DNA采用試劑盒法進行抽提。

3.根據權利要求2所述的基于DNA條形碼的白蟻快速分類鑒定方法,其特征在于,所述采用試劑盒法進行抽提具體包括如下過程:

D1、取待試驗的白蟻樣本,剔除腹部,留下頭部和胸部,用蒸餾水漂洗干凈,然后置于2mL的Eppendorf管中;

D2、向Eppendorf管中加入200μL緩沖液GA;

D3、向Eppendorf管中加入20μL蛋白酶K溶液,充分顛倒混勻,置于56℃水浴鍋2-3小時,期間間歇性振蕩;

D4、向Eppendorf管中加入200μL緩沖液GB,充分顛倒混勻,70℃放置10min,待溶液變清亮,離心去除管蓋內壁的水珠;

D5、向Eppendorf管中加入200μL無水乙醇,充分振蕩混勻15秒,離心去除管蓋內壁的水珠;

D6、將步驟D5所得溶液加入吸附柱中,離心30秒,倒掉廢液,將吸附柱放回收集管中;

D7、向吸附柱中加入500μL緩沖液GD,離心30秒,倒掉廢液,將吸附柱放入收集管中;

D8、向吸附柱中加入600μL漂洗液PW,離心30秒,倒掉廢液,將吸附柱放入收集管中;

D9、重復操作步驟D7;

D10、將吸附柱放回收集管中,離心2分鐘,倒掉廢液,將吸附柱置于室溫放置2-9分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的漂洗液;

D11、將吸附柱轉入一個干凈的離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加50-200μL洗脫緩沖液TE,室溫放置2-5min,離心2分鐘,將溶液收集到離心管中,于零下20℃保存備用。

4.根據權利要求3所述的基于DNA條形碼的白蟻快速分類鑒定方法,其特征在于:所述步驟D6、D7、D8、D10和D11中離心時轉速控制為11000-13000轉/分鐘。

5.根據權利要求1所述的基于DNA條形碼的白蟻快速分類鑒定方法,其特征在于:所述步驟A和B中,線粒體COI特征片段的擴增通用引物序列為:

COI-F:CTTCGTATTTGGTGCATGAT;

COI-R:CWGGGTCRAAGAATGATGTA。

6.根據權利要求1所述的基于DNA條形碼的白蟻快速分類鑒定方法,其特征在于,步驟A和B中,所述的PCR擴增的反應條件為:98℃預變性2min,循環反應35次;每一循環包含98℃10s,56℃10s,72℃30s,72℃延伸3min,4℃保存。

7.根據權利要求1所述的基于DNA條形碼的白蟻快速分類鑒定方法,其特征在于:所述步驟A和B中,采集的白蟻樣本用質量分數為75%的酒精浸泡于5ml離心管中。

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