[發明專利]冠狀動脈疾病的血液RNA生物標記

在審

• 申請號: 201780067458.0
• 申請日: 2017-08-30
• 公開（公告）號: CN110225982A
• 公開（公告）日: 2019-09-10
• 發明（設計）人: T·A·麥卡弗瑞;G·圣勞倫特;I·托馬;R·卡茲
• 申請（專利權）人: 喬治·華盛頓大學;圣勞倫特研究院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;G01N33/68
• 代理公司: 上海專利商標事務所有限公司 31100
• 代理人: 余穎;楊昀

1.一種用于確定患有或發展冠狀動脈疾病的可能性增加的方法，所述方法包括：

從受試者獲得血樣；

從所述血樣萃取RNA；

量化至少一部分所述萃取的RNA中的RNA水平；

計算所述萃取的RNA中的多個RNA轉錄本的表達水平；

比較所述多個TRAC RNA轉錄本的所述表達水平與相同RNA轉錄本的對照表達水平；以及

確定所述萃取的RNA中的所述多個TRAC RNA轉錄本的所述表達水平是否共同地顯著不同于所述相同RNA轉錄本的所述對照表達水平，其中表達水平的顯著差異指示所述受試者患有或發展冠狀動脈疾病的可能性增加。

2.如權利要求1所述的方法，其中所述血樣包括全血。

3.如權利要求1所述的方法，其還包括在量化所述至少一部分所述萃取的RNA之前從所述萃取的RNA耗盡核糖體RNA。

4.如權利要求3所述的方法，其中從所述萃取的RNA耗盡核糖體RNA包括用對核糖體RNA特異的探針處理所述萃取的RNA。

5.如權利要求1所述的方法，其中所述多個RNA轉錄本包括FOXP3、CD4、CD25、ETS1和RUNX1，并且其中當表達水平存在顯著差異時，FOXP3、CD4、CD25、ETS1和RUNX1中每一者的表達水平下調。

6.如權利要求5所述的方法，其中當表達水平存在顯著差異時，FOXP3、CD4、CD25、ETS1和RUNX1中每一者的所述表達水平下調1.5倍與2倍之間。

7.如權利要求1所述的方法，其中所述多個RNA轉錄本包括DGKA、DLG1、ICOSLG、IKZF4/Eos、SMYD3、TCF3和TRIM28，并且其中當表達水平存在顯著差異時，DGK、DLG1、ICOSLG、IKZF4/Eos、SMYD3、TCF3和TRIM28中每一者的表達水平下調。

8.如權利要求7所述的方法，其中當表達水平存在顯著差異時，DGKA、DLG1、ICOSLG、IKZF4/Eos、SMYD3、TCF3和TRIM28中每一者的所述表達水平下調1.5倍與2倍之間。

9.如權利要求1所述的方法，其中所述受試者是人類。

10.如權利要求1所述的方法，其還包括在從所述受試者獲得所述血樣之前，選擇已經被鑒定為具有冠狀動脈疾病的一個或多個風險因素的受試者。

11.如權利要求10所述的方法，其中所述風險因素是選自由以下組成的組：高血壓、高齡、膽固醇升高和冠狀動脈疾病家族史。

12.如權利要求1所述的方法，其中所述方法鑒定陽性預測值大于80％的冠狀動脈疾病。

13.如權利要求12所述的方法，其中所述方法鑒定陽性預測值大于90％的冠狀動脈疾病。

14.如權利要求1所述的方法，其還包括基于所述受試者患有或發展冠狀動脈疾病的可能性增加的決定，用他汀類藥物、阿司匹林、ACE抑制劑、利尿劑、葡萄糖控制藥劑或β阻斷劑中的一者或多者治療所述受試者。

15.如權利要求1所述的方法，其還包括基于所述受試者患有或發展冠狀動脈疾病的可能性增加的決定，對所述受試者進行冠狀血管造影術。

16.如權利要求1所述的方法，其中基于無冠狀動脈疾病的個體的經驗表達水平數據確定所述對照表達水平。

17.如權利要求16所述的方法，其中所述無冠狀動脈疾病的個體已通過冠狀導管插入血管造影術被鑒定為無冠狀動脈疾病。