[發明專利]用于微管蛋白β-3鏈(TUBB3)蛋白的SRM/MRM測定

在審

• 申請號: 201780060335.4
• 申請日: 2017-09-07
• 公開（公告）號: CN109863405A
• 公開（公告）日: 2019-06-07
• 發明（設計）人: 托德·亨布羅;法比奧拉·塞奇;沙力特·施瓦茲
• 申請（專利權）人: 愛科譜迅病理研究公司
• 主分類號: G01N33/68
• 分類號: G01N33/68
• 代理公司: 中科專利商標代理有限責任公司 11021
• 代理人: 張國梁

1.福爾馬林固定組織的人生物樣品中人TUBB3蛋白水平的測量方法，包括使用質譜檢測和/或定量從所述人生物樣品制備的蛋白質消化物中TUBB3片段肽的量；并計算所述樣品中TUBB3蛋白的水平；其中所述TUBB3片段肽是SEQ IDNO：1，并且其中所述水平是相對水平或絕對水平。

2.權利要求1的方法，還包括在檢測和/或定量所述TUBB3片段肽的量之前分離所述蛋白質消化物的步驟。

3.權利要求1的方法，其中所述蛋白質消化物包含蛋白酶消化物。

4.權利要求1的方法，其中所述組織是石蠟包埋組織。

5.權利要求1的方法，其中所述組織獲自腫瘤。

6.權利要求1的方法，還包括定量所述TUBB3片段肽。

7.權利要求6的方法，其中定量所述TUBB3片段肽包括將一種生物樣品中所述TUBB3片段肽的量與其他獨立生物樣品中相同TUBB3片段肽的量進行比較。

8.權利要求7的方法，其中定量所述TUBB3片段肽包括通過與已知量的添加內標肽進行比較來確定生物樣品中所述TUBB3片段肽的量，其中將生物樣品中的所述TUBB3片段肽與具有相同氨基酸序列的內標肽進行比較，以及其中所述內標肽是同位素標記的肽。

9.權利要求1的方法，其中檢測和/或定量蛋白質消化物中所述TUBB3片段肽的量指示了存在修飾的或未修飾的TUBB3蛋白以及與受試者體內癌癥的關聯。

10.權利要求9的方法，還包括將所述檢測和/或定量所述TUBB3片段肽的量的結果或所述TUBB3蛋白的水平與癌癥的診斷階段/等級/狀態相關聯。

11.權利要求10的方法，其中所述將所述檢測和/或定量所述TUBB3片段肽的量的結果或所述TUBB3蛋白的水平與癌癥的診斷階段/等級/狀態相關聯與以多重形式檢測和/或定量其他蛋白質或來自其他蛋白質的肽的量相結合，以提供關于癌癥的診斷階段/等級/狀態的額外信息。

12.權利要求1的方法，還包括向所述生物樣品獲自其的患者施用治療有效量的癌癥治療劑，其中所述治療劑和/或治療劑的施用量基于所述TUBB3片段肽的量或TUBB3蛋白的水平。

13.權利要求1的方法，其中治療劑結合TUBB3蛋白和/或抑制其生物活性。

14.治療患有癌癥的患者的方法，包括：

(a)定量從所述患者獲得的腫瘤樣品制備的蛋白質消化物中特定TUBB3片段肽的水平，并且使用質譜通過選擇反應監測計算所述樣品中TUBB3肽的水平；

(b)將所述TUBB3片段肽的水平與參考水平進行比較，和

(c)當TUBB3片段肽的水平低于所述參考水平時，用基于紫杉烷的化療方案治療患者，或者

(d)當TUBB3片段肽的水平高于所述參考水平時，用不含有效量紫杉烷的治療方案治療患者。

15.權利要求14的方法，其中所述參考水平為700amol/μg+/-250amol/μg的被分析的生物樣品蛋白。

16.權利要求14的方法，其中所述參考水平為700amol/μg+/-150amol/μg的被分析的生物樣品蛋白。

17.權利要求14的方法，其中所述參考水平為700amol/μg+/-100amol/μg的被分析的生物樣品蛋白。