[發明專利]用于組表征的方法和系統

在審

• 申請號: 201780057144.2
• 申請日: 2017-09-18
• 公開（公告）號: CN109715059A
• 公開（公告）日: 2019-05-03
• 發明（設計）人: 丹尼爾·阿爾莫納西德;勞倫斯·克拉爾;弗朗西斯科·奧桑頓;胡安·巴勃羅·卡德納斯;杰西卡·里奇曼;扎迦利·阿普特;伊麗莎白·比克;奧德麗·戈達德
• 申請（專利權）人: 優比歐邁公司
• 主分類號: A61B5/05
• 分類號: A61B5/05;A61B1/00;G16B35/00
• 代理公司: 北京派特恩知識產權代理有限公司 11270
• 代理人: 王子曄;姚開麗

用于表征病癥組的系統和方法的實施方案能包括分類數據庫，其中該病癥組與有微生物有關的分類單位集合相關，所述分類數據庫包括針對與所述病癥組相關的分類單位集合的參考微生物特征；處理，其能夠操作以從用戶收集包括生物材料的容器，處理系統包括能夠操作以確定微生物序列數據集的測序儀系統；和組表征系統，其能夠操作以：基于所述微生物序列數據集確定針對用戶所述分類單位集合的用戶微生物群系特征，生成所述用戶微生物群系特征與所述參考微生物群系特征之間的比較，并基于所述比較確定用戶病癥組的組表征；以及治療系統，其能夠操作以基于所述組表征來促進針對所述病癥組的病癥的治療。

相關申請的交叉引用

本申請是于2017年5月26日提交的美國申請序列號15/606,743(其是2015年10月21日提交的序列號為14/919,614的美國申請的接續)的部分接續申請，其要求于2014年10月21日提交的序列號為62/066,369的美國臨時申請、于2014年12月04日提交的序列號為62/087,551的美國臨時申請、于2014年12月17日提交的序列號為62/092,999的美國臨時申請、于2015年4月14日提交的序列號62/147,376的美國臨時申請、于2015年4月14日提交的序列號為62/147,212的美國臨時申請、于2015年4月14日提交的序列號為62/147,362的美國臨時申請、于2015年4月13日提交的序列號為62/146,855的美國臨時申請以及于2015年8月18日提交的序列號為62/206,654的美國臨時申請的權益，這些申請各自通過引用整體并入本文。本申請還要求于2017年9月16日提交的美國臨時申請序列號62/395,939，2017年6月15日提交的美國臨時申請序列號62/520,058，和2017年6月27日提交的美國臨時申請序列號62/525,379的權益，這些申請各自通過引用整體并入本文。

技術領域

本發明總體上涉及微生物學領域，并更具體地涉及微生物學領域中用于表征病癥組的新的且有用的方法和系統。

附圖說明

圖1A-1B是用于表征病癥組的方法的實施方案的變型的流程圖表示；

圖2是用于表征病癥組的方法的實施方案的變型的流程圖表示；

圖3是系統的實施方案的示意圖表示；

圖4是方法的實施方案的變型的示意圖表示；

圖5是用于表征病癥組的方法的變型中的過程的示意圖表示；

圖6是用于確定目標分類單位的優化參數的實例的圖表表示；

圖7是表征過程的驗證的實例的圖形表示；

圖8是健康參考相對豐度范圍的實例的圖表表示；

圖9A-9B是目標分類單位的實例；

圖10是選擇用于表征的益生菌的實例；

圖11-12是益生菌和相關分類單位組的實例；

圖13A-13B是與益生菌有關的分類單位組關聯的相對豐度的實例；和

圖14-15是界面的實例。

具體實施方式

以下對本發明實施方案的描述無意于將本發明限于這些實施方案，而是旨在使本領域技術人員能夠進行和使用本發明。

1、概述