[發(fā)明專利]自動化質(zhì)譜庫保留時間校正

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201780051347.0
• 申請日: 2017-07-19
• 公開（公告）號: CN109643633B
• 公開（公告）日: 2021-09-14
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 斯蒂芬·泰特
• 申請（專利權(quán)）人: DH科技發(fā)展私人貿(mào)易有限公司
• 主分類號: H01J49/00
• 分類號: H01J49/00
• 代理公司: 中國貿(mào)促會專利商標事務(wù)所有限公司 11038
• 代理人: 馬景輝

使用DIA串聯(lián)質(zhì)譜方法來產(chǎn)生多個經(jīng)測量產(chǎn)物離子質(zhì)譜。從已知化合物質(zhì)譜庫中檢索一或多個產(chǎn)物離子，或針對數(shù)據(jù)庫的所述已知化合物計算一或多個理論產(chǎn)物離子。對于每一已知或理論產(chǎn)物離子，根據(jù)所述經(jīng)測量產(chǎn)物離子質(zhì)譜計算XIC。對于產(chǎn)生已知化合物子集的所述已知化合物，將高于閾值強度的經(jīng)測量XIC峰值進行分組。針對所述已知化合物子集檢索或計算已知或理論保留時間。將所述已知化合物子集的所述已知或理論保留時間用作自變量，且將所述已知化合物子集的所述經(jīng)測量XIC峰值組的所述經(jīng)測量保留時間用作因變量，來計算回歸函數(shù)，以校正所述已知或理論保留時間。

相關(guān)申請的交叉引用

本申請案要求2016年8月10日提交的第62/372,854號美國臨時專利申請案的權(quán)益，所述申請案的內(nèi)容以其全文引用的方式并入本文中。

技術(shù)領(lǐng)域

本文中的教示涉及使用與串聯(lián)質(zhì)譜或質(zhì)譜/質(zhì)譜(mass spectrometry/massspectrometry，MS/MS)耦合的分離技術(shù)對樣本混合物中的已知化合物進行識別。更具體地說，本文中的教示涉及用于在每一樣本基礎(chǔ)上校正理論離子或所存儲庫離子的保留時間以使得可將所述保留時間與樣本混合物的離子的經(jīng)測量保留時間進行比較且用于識別樣本混合物中的已知化合物的系統(tǒng)和方法。

背景技術(shù)

質(zhì)譜法中的常見問題是確定存在于樣本中的化合物的屬性。在蛋白質(zhì)組學中，例如，所述問題是確定存在于樣本中的蛋白質(zhì)的屬性。典型地，使用兩步驟串聯(lián)質(zhì)譜方法在樣本中識別化合物或蛋白質(zhì)。

在第一步驟中，獲取實驗數(shù)據(jù)。使用如胰蛋白酶的酶來消化樣本中的蛋白質(zhì)，使每一蛋白質(zhì)產(chǎn)生一或多種肽。應(yīng)注意，如本文中所使用，肽是蛋白質(zhì)的經(jīng)消化部分。一些蛋白質(zhì)可被完整地消化，因而肽也可以是完整蛋白質(zhì)。然而，在大多數(shù)情況下，肽是蛋白質(zhì)的經(jīng)消化部分。

隨后使用樣本引入裝置或分離裝置將由蛋白質(zhì)消化而來的肽隨時間而與樣本分離。隨后使用離子源使分離肽離子化。利用質(zhì)荷比(m/z)來選擇離子化肽或肽前體離子，使所選前體離子碎裂，并使用串聯(lián)質(zhì)譜儀對所得產(chǎn)物離子進行質(zhì)量分析。第一步驟的結(jié)果是在一或多個不同時間所測量的一或多個產(chǎn)物離子質(zhì)譜的集合。

在第二步驟中，從所存儲質(zhì)譜庫或數(shù)據(jù)庫中獲取或計算機生成關(guān)于預期在實驗樣本中的已知化合物或蛋白質(zhì)的信息。將這一已知數(shù)據(jù)與實驗數(shù)據(jù)進行比較。這一已知數(shù)據(jù)包含例如產(chǎn)物離子在特定保留時間處的質(zhì)荷比值。

關(guān)于已知化合物的產(chǎn)物離子的信息例如可從質(zhì)譜庫或數(shù)據(jù)庫中獲取。質(zhì)譜庫包含例如根據(jù)分別分析已知化合物中的每一種所收集的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。隨后將來自此先前所收集質(zhì)譜數(shù)據(jù)的產(chǎn)物離子與根據(jù)樣本混合物在一或多個不同時間中的每一個處經(jīng)測量的一或多個經(jīng)測量產(chǎn)物離子質(zhì)譜中的每一個進行比較。典型地，基于已知化合物的庫產(chǎn)物離子與一或多個經(jīng)測量產(chǎn)物離子質(zhì)譜相匹配的良好程度來對已知化合物進行評分。隨后從最高評分已知化合物中識別樣本混合物中的化合物。

類似地，已知蛋白質(zhì)例如可從數(shù)據(jù)庫中獲取，且可使用用于串聯(lián)質(zhì)譜實驗中的相同酶在計算上消化，使每一已知蛋白質(zhì)產(chǎn)生一或多種理論肽。在計算上選擇并碎裂理論肽，使每一已知蛋白質(zhì)產(chǎn)生理論產(chǎn)物離子。也可以計算出理論保留時間。隨后將所得理論產(chǎn)物離子與在一或多個不同時間中的每一個處的一或多個經(jīng)測量產(chǎn)物離子質(zhì)譜中的每一個進行比較。典型地，基于已知蛋白質(zhì)的理論產(chǎn)物離子與一或多個經(jīng)測量產(chǎn)物離子質(zhì)譜相匹配的良好程度來對已知蛋白質(zhì)進行評分。隨后從最高評分已知蛋白質(zhì)中識別樣本中的蛋白質(zhì)。因此，可通過將庫或理論產(chǎn)物離子m/z和保留時間值與根據(jù)樣本混合物經(jīng)測量的實驗產(chǎn)物離子m/z和保留時間值進行比較來識別樣本混合物中的已知化合物或蛋白質(zhì)。

然而，不幸的是，庫或理論保留時間值通常并不與經(jīng)測量的保留時間值完全匹配。這是由于用于測量庫保留時間值或用于計算理論保留時間值的分離媒體與用以測量樣本混合物的分離媒體并不相同。庫或理論保留時間值的此不準確性可能不利地影響對化合物或蛋白質(zhì)的識別。