[發(fā)明專利]使用可編程DNA結(jié)合蛋白增強(qiáng)靶向基因組修飾有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201780048469.4 | 申請日: | 2017-02-20 |
| 公開(公告)號: | CN109983124B | 公開(公告)日: | 2022-09-16 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | F.陳 | 申請(專利權(quán))人: | 西格馬-奧爾德里奇有限責(zé)任公司 |
| 主分類號: | C12N15/09 | 分類號: | C12N15/09;C07K14/00;C12N9/10;G01N33/50;G01N33/58 |
| 代理公司: | 中國專利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 初明明;周齊宏 |
| 地址: | 美國密*** | 國省代碼: | 暫無信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 使用 可編程 dna 結(jié)合 蛋白 增強(qiáng) 靶向 基因組 修飾 | ||
1.一種組合物,其包含:
(a) RNA引導(dǎo)的成簇規(guī)律間隔的短回文重復(fù)(CRISPR)核酸酶系統(tǒng)或編碼所述CRISPR核酸酶系統(tǒng)的核酸,其中所述CRISPR核酸酶系統(tǒng)包含(i) 可編程DNA修飾蛋白,其為CRISPR蛋白,和(ii) 引導(dǎo)RNA;和
(b) 至少一種無催化活性的CRISPR系統(tǒng)或編碼所述至少一種無催化活性的CRISPR系統(tǒng)的核酸,其中每種無催化活性的CRISPR系統(tǒng)包含(i) 可編程DNA結(jié)合蛋白,其是無催化活性的CRISPR蛋白,和(ii) 引導(dǎo)RNA;和其中
(x) 所述可編程DNA修飾蛋白是II型CRISPR蛋白,和所述至少一種可編程DNA結(jié)合蛋白是II型CRISPR蛋白,或
(y) 所述可編程DNA修飾蛋白是V型CRISPR蛋白,和所述至少一種可編程DNA結(jié)合蛋白是II型CRISPR蛋白。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的組合物,其中(i) 所述II型CRISPR蛋白選自新兇手弗朗西斯菌CRISPR-Cas9(FnCas9)、空腸彎曲桿菌CRISPR-Cas9(CjCas9)和釀膿鏈球菌CRISPR-Cas9(SpCas9);和/或(ii) 所述V型CRISPR蛋白是新兇手弗朗西斯菌CRISPR-Cpf1(FnCpf1)。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的組合物,其中所述至少一種可編程DNA結(jié)合蛋白是Cas9 II型CRISPR蛋白,其中所述Cas9蛋白在RuvC樣結(jié)構(gòu)域和HNH樣結(jié)構(gòu)域的每一個中具有一個或多個突變。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的組合物,其中(i) RuvC樣結(jié)構(gòu)域中的一個或多個突變是D10A、D8A、E762A和/或D986A;和/或(ii) HNH樣結(jié)構(gòu)域中的一個或多個突變是H840A、H559A、N854A、N856A和/或N863A。
5.根據(jù)任何前述權(quán)利要求所述的組合物,其中編碼每種CRISPR蛋白的核酸是mRNA或DNA。
6.根據(jù)任何前述權(quán)利要求所述的組合物,其中編碼每種CRISPR蛋白的核酸是質(zhì)粒載體或病毒載體的一部分。
7.根據(jù)任何前述權(quán)利要求所述的組合物,其中編碼每種引導(dǎo)RNA的核酸是質(zhì)粒載體或病毒載體的一部分。
8.根據(jù)任何前述權(quán)利要求所述的組合物,其中每種CRISPR系統(tǒng)的引導(dǎo)RNA是(a)酶促合成的,或(b)至少部分是化學(xué)合成的。
9.一種試劑盒,其包含權(quán)利要求1至8中任一項的組合物。
10.一種用于提高真核細(xì)胞中靶向基因組修飾效率和/或特異性的體外方法,所述方法包括向真核細(xì)胞中引入組合物,所述組合物包含:
(a) RNA引導(dǎo)的成簇規(guī)律間隔的短回文重復(fù)(CRISPR)核酸酶系統(tǒng)或編碼所述CRISPR核酸酶系統(tǒng)的核酸,其中所述CRISPR核酸酶系統(tǒng)包含(i) 可編程DNA修飾蛋白,其為CRISPR蛋白,和(ii) 引導(dǎo)RNA;和
(b) 至少一種無催化活性的CRISPR系統(tǒng)或編碼所述至少一種無催化活性的CRISPR系統(tǒng)的核酸,其中每種無催化活性的CRISPR系統(tǒng)包含(i) 可編程DNA結(jié)合蛋白,其是無催化活性的CRISPR蛋白,和(ii) 引導(dǎo)RNA;和其中
(x) 所述可編程DNA修飾蛋白是II型CRISPR蛋白,和所述至少一種可編程DNA結(jié)合蛋白是II型CRISPR蛋白,或
(y) 所述可編程DNA修飾蛋白是V型CRISPR蛋白,和所述至少一種可編程DNA結(jié)合蛋白是II型CRISPR蛋白;
其中所述可編程DNA修飾蛋白靶向于靶染色體序列,并且至少一種可編程DNA結(jié)合蛋白中的每種都靶向于靶染色體序列附近的位點,并且所述至少一種可編程DNA結(jié)合蛋白與靶染色體序列附近位點的結(jié)合提高可編程DNA修飾蛋白對靶染色體序列的可及性,從而提高靶向基因組修飾效率和/或特異性。
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