[發(fā)明專(zhuān)利]用于識(shí)別用于植物育種的雜交物種的方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201780035726.0 | 申請(qǐng)日: | 2017-06-08 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN109328016A | 公開(kāi)(公告)日: | 2019-02-12 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | S.P.K.查瓦利;S.達(dá)斯古普塔;N.波拉瓦拉普 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人: | 孟山都技術(shù)有限公司 |
| 主分類(lèi)號(hào): | A01H1/04 | 分類(lèi)號(hào): | A01H1/04;A01H5/00;C12Q1/00;G16B25/00 |
| 代理公司: | 中國(guó)專(zhuān)利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 李進(jìn);黃希貴 |
| 地址: | 美國(guó)密*** | 國(guó)省代碼: | 美國(guó);US |
| 權(quán)利要求書(shū): | 查看更多 | 說(shuō)明書(shū): | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 雜交 物種 過(guò)濾 雜交物 種子群 植物育種 親本 育種 多個(gè)目標(biāo) 規(guī)則過(guò)濾 群體預(yù)測(cè) 商業(yè)成功 集合 遺傳 | ||
1.一種用于識(shí)別用于植物育種的雜交物種的方法,所述方法包括:
訪問(wèn)代表多個(gè)親本的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu);
識(shí)別潛在雜交物種集合,所述潛在雜交物種集合中的每個(gè)潛在雜交物種包括所述數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)中所包括的所述多個(gè)親本中的至少兩個(gè);
通過(guò)至少一種計(jì)算裝置,基于與所述潛在雜交物種集合的群體預(yù)測(cè)分值相關(guān)的一個(gè)或多個(gè)閾值來(lái)從所述潛在雜交物種集合中選擇潛在雜交物種子群,每個(gè)群體預(yù)測(cè)分值與所述潛在雜交物種集合內(nèi)的相關(guān)潛在雜交物種的商業(yè)成功性預(yù)測(cè)值相關(guān);
通過(guò)所述至少一種計(jì)算裝置,基于所述潛在雜交物種子群中的親本的遺傳相關(guān)性從所述潛在雜交物種子群中選擇多個(gè)目標(biāo)雜交物種;
通過(guò)所述至少一種計(jì)算裝置,基于至少一種規(guī)則過(guò)濾所述目標(biāo)雜交物種,所述至少一種規(guī)則限定以下中至少一者的至少一個(gè)特征和/或特點(diǎn)的至少一個(gè)閾值:所述多個(gè)目標(biāo)雜交物種、所述目標(biāo)雜交物種中所包括的所述多個(gè)親本之一、以及所述目標(biāo)雜交物種的親本品系;
通過(guò)所述至少一種計(jì)算裝置,基于與所述經(jīng)過(guò)過(guò)濾的目標(biāo)雜交物種相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)來(lái)選擇選定的經(jīng)過(guò)過(guò)濾的目標(biāo)雜交物種;以及
將所述選定的經(jīng)過(guò)過(guò)濾的目標(biāo)雜交物種引向育種管道,由此至少部分地基于所述選定的經(jīng)過(guò)過(guò)濾的雜交物種中所包括的親本的商業(yè)成功性將雜交物種提供至所述育種管道。
2.如權(quán)利要求1所述的方法,還包括通過(guò)所述至少一種計(jì)算裝置,產(chǎn)生所述潛在雜交物種集合內(nèi)的每個(gè)潛在雜交物種的群體預(yù)測(cè)分值。
3.如權(quán)利要求2所述的方法,其中產(chǎn)生所述群體預(yù)測(cè)分值包括通過(guò)所述至少一種計(jì)算裝置,基于以下算法產(chǎn)生所述群體預(yù)測(cè)分值:
4.如權(quán)利要求1所述的方法,其中基于所述遺傳相關(guān)性從所述潛在雜交物種子群中選擇所述多個(gè)目標(biāo)雜交物種包括:
通過(guò)所述至少一種計(jì)算裝置,基于所述親本的相關(guān)性來(lái)群聚所述子群中所包括的所述潛在雜交物種的親本;以及
基于與所述群聚的目標(biāo)雜交物種的親本相關(guān)的相關(guān)性閾值來(lái)選擇所述多個(gè)目標(biāo)雜交物種。
5.如權(quán)利要求4所述的方法,其中群聚所述親本包括通過(guò)所述至少一種計(jì)算裝置,譜聚所述子群中所包括的所述潛在雜交物種的親本;并且
其中選擇所述多個(gè)目標(biāo)雜交物種包括:
通過(guò)所述至少一種計(jì)算裝置,將與所述子群中所包括的所述潛在雜交物種之一的至少一個(gè)親本相關(guān)的集群分值和與所述潛在雜交物種之一相關(guān)的集群分值合并;以及
基于所述合并的集群分值與所述相關(guān)性閾值的對(duì)比來(lái)選擇所述多個(gè)目標(biāo)雜交物種。
6.如權(quán)利要求1所述的方法,其中所述至少一種規(guī)則與以下中的至少一者相關(guān):莖稈倒伏、根倒伏、戈斯枯萎、親本相似性以及所述兩個(gè)親本之間預(yù)期相對(duì)成熟度(ERM)之間的差異。
7.如權(quán)利要求1所述的方法,其中基于與所述經(jīng)過(guò)過(guò)濾的目標(biāo)雜交物種相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)選擇所述經(jīng)過(guò)過(guò)濾的目標(biāo)雜交物種包括通過(guò)所述至少一種計(jì)算裝置,基于取決于所述雜交物種的風(fēng)險(xiǎn)變量、多樣性變量和性能變量的二次算法來(lái)確定與所述潛在雜交物種相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)。
8.如權(quán)利要求7所述的方法,其中確定所述風(fēng)險(xiǎn)包括通過(guò)所述至少一種計(jì)算裝置,基于以下算法來(lái)確定所述風(fēng)險(xiǎn):
導(dǎo)出的約束條件是∑xi=1,且
且
9.如權(quán)利要求7所述的方法,其中與所述經(jīng)過(guò)過(guò)濾的目標(biāo)雜交物種相關(guān)的所述二次算法的風(fēng)險(xiǎn)變量導(dǎo)致與所述雜交物種的多個(gè)特征和/或特點(diǎn)相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)。
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