[發(fā)明專利]預(yù)測肺癌患者中對ALK抑制劑療法的響應(yīng)的間變性淋巴瘤激酶中的新型突變

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201780034006.2
• 申請日: 2017-06-01
• 公開（公告）號: CN109312406A
• 公開（公告）日: 2019-02-05
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: A.洛夫喬伊;S.楊
• 申請（專利權(quán)）人: 豪夫邁·羅氏有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 權(quán)陸軍;黃希貴

1.治療具有腫瘤的患者的方法，所述腫瘤可能攜帶在間變性淋巴瘤激酶(ALK)基因中具有突變的細(xì)胞，所述方法包括：

(a)測試來自所述患者的樣品的ALK突變R1209Q (G3636A)和/或I1268V (A3802G)的存在，且

(b)如果存在突變R1209Q，則不將ALK抑制劑化合物施用于所述患者，或者如果所述患者已經(jīng)正在接受ALK抑制劑化合物，則施用替代ALK抑制劑化合物；且

(c)如果存在突變I1268V或不存在突變，則將ALK抑制劑化合物施用于所述患者。

2.權(quán)利要求1的方法，其中所述ALK抑制劑化合物或替代ALK抑制劑化合物選自艾樂替尼、克里唑替尼、色瑞替尼、艾樂替尼、布加替尼、勞拉替尼和恩曲替尼。

3.權(quán)利要求1或2的方法，其中使用與突變序列互補(bǔ)的寡核苷酸進(jìn)行所述測試。

4.前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)的方法，其進(jìn)一步包括測試來自所述患者的樣品的一種或多種選自L1152R、C1156Y、F1174L、L1196M、G1269A和G1548E的ALK突變的存在，并且如果存在任何所述突變，則不將ALK抑制劑化合物施用于所述患者，或者如果所述患者已經(jīng)正在接受ALK抑制劑化合物，則施用替代ALK抑制劑化合物。

5.前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)的方法，其進(jìn)一步包括：

測試來自所述患者的樣品的一種或多種ALK融合產(chǎn)物的存在；

如果存在一種或多種ALK融合產(chǎn)物，則將ALK抑制劑化合物施用于所述患者；且

如果存在一種或多種ALK融合產(chǎn)物和一種或多種選自R1209Q、L1152R、C1156Y、F1174L、L1196M、G1269A和G1548E的突變，則不將ALK抑制劑化合物施用于所述患者，或者如果所述患者已經(jīng)正在接受ALK抑制劑化合物，則施用替代ALK抑制劑化合物。

6.用于確定癌癥患者對ALK抑制劑化合物的響應(yīng)的可能性的方法，其包括：測試來自所述患者的樣品的ALK突變R1209Q和/或I1268V，且，如果存在突變R1209Q，則報告所述患者將可能不對所述ALK抑制劑化合物響應(yīng)，且如果存在突變I1268V或不存在突變，則報告所述患者將可能對所述ALK抑制劑化合物響應(yīng)。

7.權(quán)利要求6的方法，其中使用與突變序列互補(bǔ)的寡核苷酸進(jìn)行所述測試。

8.權(quán)利要求6-7中任一項(xiàng)的方法，其進(jìn)一步包括測試所述樣品的一種或多種選自L1152R、C1156Y、F1174L、L1196M、G1269A和G1548E的ALK突變的存在，并且如果存在任何所述突變，則報告所述患者可能不對所述ALK抑制劑化合物響應(yīng)，或如果所述患者已經(jīng)正在接受ALK抑制劑化合物，則施用替代ALK抑制劑化合物。

9.權(quán)利要求6-8中任一項(xiàng)的方法，其進(jìn)一步包括：

測試來自所述患者的樣品的一種或多種ALK融合產(chǎn)物的存在；

如果存在一種或多種ALK融合產(chǎn)物，則將ALK抑制劑化合物施用于所述患者；且

如果存在一種或多種ALK融合產(chǎn)物和一種或多種選自R1209Q、L1152R、C1156Y、F1174L、L1196M、G1269A和G1548E的突變，則不將ALK抑制劑化合物施用于所述患者，或者如果所述患者已經(jīng)正在接受ALK抑制劑化合物，則施用替代ALK抑制劑化合物。

10.對于先前已經(jīng)用艾樂替尼治療的具有攜帶在基因中具有突變的細(xì)胞的腫瘤的患者選擇間變性淋巴瘤激酶(ALK)抑制劑療法的方法，其包括：

(a)測試來自所述患者的樣品的ALK突變R1209Q (G3636A)和/或I1268V (A3802G)的存在，且

(b)如果存在突變R1209Q，則不向所述患者施用ALK抑制劑化合物或施用替代ALK抑制劑化合物，且

(c)如果存在突變I1268V或不存在突變，則將艾樂替尼施用于所述患者。