[發明專利]使用血液中的無細胞DNA檢測血液病癥

有效

• 申請號: 201780033380.0
• 申請日: 2017-05-30
• 公開（公告）號: CN109196120B
• 公開（公告）日: 2022-08-02
• 發明（設計）人: 盧煜明;趙慧君;陳君賜;孫坤
• 申請（專利權）人: 香港中文大學
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883
• 代理公司: 北京英賽嘉華知識產權代理有限責任公司 11204
• 代理人: 王達佐;洪欣

1.一種非疾病診斷目的的測量生物樣本中特定細胞譜系的細胞量的方法，所述方法包含：

獲得所述生物樣本的無細胞混合物，所述無細胞混合物包括來自多個細胞譜系的無細胞DNA；

實施分析所述無細胞混合物中對應于一個或多個差異甲基化區域的DNA片段的分析，所述一個或多個差異甲基化區域中的每一個通過相對于其它細胞譜系低甲基化或高度甲基化而對所述特定細胞譜系具有特異性；

基于從所述分析獲得的信號，在所述一個或多個差異甲基化區域處檢測所述無細胞混合物中的甲基化或未甲基化DNA片段的第一數量；

使用所述第一數量確定第一甲基化水平；

獲得一個或多個校準數據點，其中每個校準數據點指定（1）所述特定細胞譜系的校準細胞量和（2）校準甲基化水平，且其中所述一個或多個校準數據點由多個校準樣本確定；

將所述第一甲基化水平與至少一個校準數據點的校準甲基化水平進行比較；和

基于所述比較估計所述生物樣本中所述特定細胞譜系的細胞量。

2.根據權利要求1所述的方法，其中所述特定細胞譜系是特定血液細胞譜系。

3.根據權利要求1所述的方法，其中所述一個或多個校準數據點是多個校準數據點，且其中所述校準數據點形成校準曲線。

4.一種計算機產品，包含計算機可讀媒體，所述計算機可讀媒體存儲多個用于控制系統以執行根據權利要求1到3中任一項所述的方法的指令。

5.一種系統，包含：

根據權利要求4所述的計算機產品；和

一個或多個處理器，用于執行存儲在所述計算機可讀媒體上的指令。

6.一種系統，被配置成執行根據權利要求1到3中任一項所述的方法。

7.一種計算機產品，包含計算機可讀媒體，所述計算機可讀媒體儲存用于控制系統以通過執行以下來分析哺乳動物的血液樣本的多個指令：

基于從分析獲得的信號，在一個或多個差異甲基化區域處檢測所述血液樣本的無細胞混合物中甲基化或未甲基化DNA片段的第一數量，所述無細胞混合物包括來自多個細胞譜系的無細胞DNA，并且所述一個或多個差異甲基化區域中的每一個通過相對于其它細胞譜系低甲基化或高度甲基化而對特定血液細胞譜系具有特異性；

使用所述第一數量確定甲基化水平；和

將所述甲基化水平與一個或多個截止值進行比較，作為確定所述哺乳動物中血液病癥的分類的部分，其中所述一個或多個截止值對應于針對所述特定血液細胞譜系進行所述血液病癥的分類的范圍。

8.根據權利要求7所述的計算機產品，其中所述多個指令還控制所述系統以執行：

確定在所述一個或多個差異甲基化區域的所述無細胞混合物中DNA片段的總數；和

使用所述第一數量和所述總數確定所述甲基化水平。

9.根據權利要求7所述的計算機產品，其中所述多個指令還控制所述系統以執行：

確定所述無細胞混合物的體積，其中所述甲基化水平確定所述無細胞混合物的所述第一數量和所述體積。

10.根據權利要求7所述的計算機產品，其中獲得所述無細胞混合物包括：

將所述無細胞混合物與所述血液樣本分離，所述無細胞混合物包含血漿或血清。