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[發明專利]Mini-III RNA酶、改變Mini-III RNA酶切割RNA序列的特異性的方法及其用途在審

專利信息
申請號: 201780019412.1 申請日: 2017-01-20
公開(公告)號: CN108884450A 公開(公告)日: 2018-11-23
發明(設計)人: J.布尼克基;K.斯克沃內克;D.格洛;M.庫爾克斯卡 申請(專利權)人: 生物技術創新私人有限公司
主分類號: C12N9/22 分類號: C12N9/22
代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001 代理人: 初明明;羅文鋒
地址: 波蘭*** 國省代碼: 波蘭;PL
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 切割 核糖核苷酸序列 枯草芽孢桿菌 氨基酸序列 可移植 氨基酸序列片段 編碼構建 編碼基因 底物結構 二級結構 輔助蛋白 顯示序列 底物 嵌合 突變 蛋白 細胞
【權利要求書】:

1. 一種具有氨基酸序列的Mini-III RNA酶,所述氨基酸序列包含受體部分和在Mini-III RNA酶結構中分別形成α4螺旋和α5b-α6環結構的可移植的α4螺旋和可移植的α5b-α6環,

其中分別形成α4螺旋和α5b-α6環結構的片段在結構上對應于分別由SEQ ID NO:1中所示的來自枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)的Mini-III RNA酶的氨基酸序列片段46-52和85-98形成的α4螺旋和α5b-α6環的相應結構,

其中所述Mini-III RNA酶在dsRNA切割中顯示出序列特異性,所述dsRNA切割僅依賴于底物的核糖核苷酸序列,并且不依賴于底物結構中二級結構的出現,并且不依賴于其它輔助蛋白的存在,

并且其中所述Mini-III RNA酶不是SEQ ID NO: 1的來自枯草芽孢桿菌的Mini-III蛋白,也不是具有D94R突變的SEQ ID NO: 1。

2. 根據權利要求1所述的Mini-III RNA酶,其特征在于氨基酸序列由源自一種微生物的Mini-III RNA酶的受體部分與分別源自來自不同微生物的Mini-III RNA酶的α4螺旋和/或α5b-α6環序列的插入的可移植的α4螺旋和/或可移植的α5b-α6環構成。

3. 根據權利要求1或2所述的Mini-III RNA酶,其特征在于其氨基酸序列包含

- 源自BsMiniIIIwt(SEQ ID NO: 1)、或Caldicellulosiruptor kristjanssonii的Mini-III CkMiniIIIwt (SEQ ID NO: 2)、或多枝梭菌(Clostridium ramosum)的CrMiniIIIwt (SEQ ID NO: 4)、或熱纖維梭菌(Clostridium thermocellum)的CtMiniIIIwt(SEQ ID NO: 6)、或Faecalibacterium prausnitzii的FpMiniIIIwt(SEQ ID NO: 8)、或具核梭桿菌具核亞種(Fusobacterium nucleatum subsp. Nucleatum)的FnMiniIIIwt(SEQ IDNO: 10)、或表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)的SeMiniIIIwt(SEQ ID NO:12)、或海棲熱袍菌(Thermotoga maritima)的TmMiniIIIwt(SEQ ID NO: 14)、或現稱為Caldanaerobacter subterraneus subsp. Tengcongensis的騰沖熱厭氧桿菌(Thermoanaerobacter tengcongensis)的TtMiniIIIwt (SEQ ID NO: 16)的Mini-III RNA酶的受體部分,或與其具有至少80%、優選85%、更優選90%、最優選95%同一性的氨基酸序列;

- 可移植的α4螺旋,其源自

具有包括SEQ ID NO: 1的46-52位氨基酸的氨基酸序列的BsMiniIIIwt、或具有包括SEQID NO: 2的氨基酸36-42的氨基酸序列的CkMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 4的氨基酸40-46的氨基酸序列的CtMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 6的56-62位氨基酸的氨基酸序列的CtMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 8的45-51位氨基酸的氨基酸序列的FpMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 10的氨基酸45-51的氨基酸序列的FnMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 12的43-49位氨基酸的氨基酸序列的SeMiniIIIwt、或具有包括SEQ IDNO: 14的氨基酸45-51的氨基酸序列的TmMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 16的氨基酸50-56的氨基酸序列的TtMiniIIIwt,或與其具有至少80%、優選85%、更優選90%、最優選95%同一性的氨基酸序列,和/或

- 可移植的α5b-α6環,其源自

具有包括SEQ ID NO: 1的85-98位氨基酸的氨基酸序列的BsMiniIIIwt、或具有包括SEQID NO: 2的氨基酸73-86的氨基酸序列的CkMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 4的氨基酸79-88的氨基酸序列的CtMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 6的93-106位氨基酸的氨基酸序列的CtMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 8的82-95位氨基酸的氨基酸序列的FpMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 10的氨基酸82-95的氨基酸序列的FnMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 12的82-95位氨基酸的氨基酸序列的SeMiniIIIwt、或具有包括SEQ IDNO: 14的氨基酸82-93的氨基酸序列的TmMiniIIIwt、或具有包括SEQ ID NO: 16的氨基酸87-100的氨基酸序列的TtMiniIIIwt,或與其具有至少80%、優選85%、更優選90%、最優選95%同一性的氨基酸序列。

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