[發明專利]BRCA1、JAML及其調控基因在品種選育中的應用

有效

• 申請號: 201711464765.0
• 申請日: 2017-12-28
• 公開（公告）號: CN108103207B
• 公開（公告）日: 2020-07-31
• 發明（設計）人: 苗向陽;黃萬龍;李嬡;解領麗;張秀秀
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;G01N33/68;C12N15/113;C12N15/11
• 代理公司: 北京預立生科知識產權代理有限公司 11736
• 代理人: 李紅偉

本發明涉及BRCA1、JAML及其調控基因在品種選育中的應用，具體的涉及BRCA1、JAML及XLOC_011001在選育高肌肉品質畜禽品種中應用。發明發現了與豬肉肌內脂肪相關的BRCA1基因和JAML基因，進一步分析顯示XLOC_011001是調控上述2個基因表達的lncRNA。本發明發現了調控豬肌內脂肪沉積的分子標志物，并進一步研究他們的相互作用關系，結果顯示這些分子標志物可用于選育高肉品質畜禽品種，在畜牧業育種中具有很好的應用前景。

技術領域

本發明屬于分子生物學技術領域，具體涉及BRCA1、JAML及其調控基因在品種選育中的應用，更具體的涉及BRCA1、JAML及XLOC_011001在選育高肌肉品質畜禽品種中應用。

背景技術

BRCA1基因是人體重要的抑癌基因，參加DNA修復、細胞周期調節點控制、有絲分裂和細胞分化等生命活動的關鍵步驟。BRCA1基因突變與乳腺癌患病風險密切相關，此外還可以作為非小細胞肺癌放化療療效的預測基因，但是，目前在動物體內對該基因研究很少，更未見報道其與肌內脂肪的關系。

JAML是連接粘附分子樣蛋白，屬于分泌性的I型跨膜糖蛋白。JAML的結構特點提示它不僅可以介導細胞間的相互作用，更重要的是可以與細胞內蛋白結合介導下游信號通路。研究顯示JAML在各種固有免疫和適應性免疫細胞中表達，但是沒有報道提示其與肌肉脂肪間是否有聯系。

lncRNA是一類長度大于200個核苷酸、不具有蛋白編碼能力的RNA，但在表觀遺傳水平、轉錄水平和轉錄后水平等多個層面，參與多個生物學過程的調控，包括基因表達調控、劑量補償效應、基因組印記、染色質重塑、細胞周期調控、剪接調控、mRNA降解和翻譯調控等，因此也受到越來越多科研人員的關注，成為一個新的研究熱點。

本研究選取萊蕪豬和大白豬為實驗材料，利用RNA-seq技術和生物信息學方法，比較分析大白豬和萊蕪豬肌內脂肪組織基因表達譜，鑒定篩選與成脂分化及脂代謝相關的關鍵差異表達基因及調控他們的長鏈非編碼RNA，發明發現了與豬肉肌內脂肪相關的BRCA1基因和JAML基因，進一步分析顯示XLOC_011001是調控上述2個基因表達的lncRNA。本發明發現了調控豬肌內脂肪沉積的分子標志物，并進一步研究他們的相互作用關系，結果顯示這些分子標志物可用于選育高肉品質畜禽品種，在畜牧業育種中具有很好的應用前景。

發明內容

本發明的目的在于提供BRCA1和/或JAML基因及其表達產物在預測或輔助預測豬肉品質中的應用。

本發明的目的在于提供BRCA1和/或JAML基因及其表達產物在選育具有不同肌肉品質豬中的應用。

為實現上述目的，本發明首先通過高通量測序結合生物信息學方法篩選到候選基因BRCA1和JAML，進一步通過分子細胞生物學方法驗證了BRCA1和JAM與豬肌內脂肪密切關系，可用于預測或輔助預測豬肉品質，在畜牧業育種中具有重要的意義。

進一步，通過測序技術、核酸雜交技術或核酸擴增技術檢測BRCA1和/或JAML基因的表達水平。

優選的，核酸擴增技術采用一對特異性引物擴增BRCA1和/或JAML基因；核酸雜交包括與BRCA1和/或JAML基因的核酸序列雜交的探針。

進一步，通過免疫方法檢測BRCA1和/或JAML基因表達產物的表達水平。

優選的，通過ELISA檢測試劑盒和/或膠體金檢測試劑盒檢測BRCA1和/或JAML基因表達產物的表達水平。

本發明的目的在于提供一種與豬肌內脂肪相關的長鏈非編碼RNA XLOC_011001，序列與SEQ ID NO.1具有90％以上序列同源性。

優選的，XLOC_011001序列與SEQ ID NO.1具有95％以上序列同源性；更優選的，長鏈非編碼RNA序列為SEQ ID NO.1。