[發明專利]金黃色葡萄球菌和蠟樣芽孢桿菌快速檢測方法在審
| 申請號: | 201711457774.7 | 申請日: | 2017-12-28 |
| 公開(公告)號: | CN107904287A | 公開(公告)日: | 2018-04-13 |
| 發明(設計)人: | 聶丹丹;王寧寧;王準;曲輝;彭勃;孫晶瑩;王瑋琳;劉金華;羅雁非 | 申請(專利權)人: | 吉林出入境檢驗檢疫局檢驗檢疫技術中心 |
| 主分類號: | C12Q1/6851 | 分類號: | C12Q1/6851;C12Q1/14;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 長春市東師專利事務所22202 | 代理人: | 張鐵生 |
| 地址: | 130062 吉林*** | 國省代碼: | 吉林;22 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 金黃色 葡萄球菌 芽孢 桿菌 快速 檢測 方法 | ||
1.金黃色葡萄球菌和蠟樣芽孢桿菌快速檢測方法,包括以下步驟:
1)稱取25g樣品至盛有225mL無菌培養液的均質袋中,用拍擊式均質器拍打成勻液;增菌培養,金黃色葡萄球菌增菌培養按照GB/T 23743方法進行,蠟樣芽胞桿菌增菌培養按照GB/T 26427方法進行;所述的樣品為飼料或食品;
2)提取待測樣品、陽性對照、陰性對照的DNA;
3)以提取的DNA為模板,加入金黃色葡萄球菌檢測用nuc特異性引物和探針、蠟樣芽孢桿菌的16s保守引物和探針以及酶反應液進行雙重微滴數字PCR反應;
4)反應結束后,進行檢測與分析;
所述的金黃色葡萄球菌檢測用nuc特異性引物和探針、蠟樣芽孢桿菌的16s保守引物和探針為:
nuc基因上游引物: GGTTTTTCTTTTTCGCTACTAGTTG;
nuc基因下游引物: TGGATCTTCAGAACCACTTCTATTT;
nuc探針:5’-(FAM)-CAGCAAATGCATCACAAACAGATAACGGC-(BHQ1)-3’;
16s保守基因上游引物:CCTTATGACCTGGGCTACAC;
16s保守基因下游引物:AACGGTTTTATGAGATTAGCTCC;
16s探針:5’-(HEX)-TGCAGCTCTTTGTACCGTCCATTGT-(ECLIPSE)-3’。
2. 根據權利要求1所述的金黃色葡萄球菌和蠟樣芽孢桿菌快速檢測方法,其特征在于:步驟3)中所述的雙重微滴數字PCR反應體系為:
2×dd PCR預混液10μL
10 μmol/L nuc基因上游引物1.6μL
10 μmol/L nuc基因下游引物1.6μL
10 μmol/L rfbE基因探針 0.8μL
10 μmol/L 16s保守基因上游引物0.4μL
10 μmol/L 16s保守基因下游引物0.4μL
10 μmol/L16s保守基因探針 0.2μL
1~100 ng/μL模板DNA(金黃色葡萄球菌)4μL
1~100 ng/μL模板DNA(蠟樣芽孢桿菌)1μL;
所述的雙重微滴數字PCR反應條件為:95℃/5min,1個循環;95℃/15s,60℃/1min,40個循環;98℃/10min(1℃/s),12℃保存反應產物。
3.根據權利要求2所述的金黃色葡萄球菌和蠟樣芽孢桿菌快速檢測方法,其特征在于:步驟4)中所述的反應與分析,是雙重微滴數字PCR反應結束后,檢測所有微滴的熒光信號值并設定閾值,根據熒光信號的閾值確定微滴是否包裹模板DNA,高于閾值的微滴包裹模板DNA,為陽性微滴;低于閾值的微滴不包裹模板DNA為陰性微滴,再根據陽性微滴數計算模板DNA的拷貝數,根據陽性拷貝數值判定結果。
4.根據權利要求3所述的金黃色葡萄球菌和蠟樣芽孢桿菌快速檢測方法,其特征在于:所述的判定結果的方法為:
1)待測樣品金黃色葡萄球菌和蠟樣芽胞桿菌基因僅有一種得到擴增,擴增終點熒光信號大于或等于閾值,可判定該樣品結果為陽性,報告檢出金黃色葡萄球菌或蠟樣芽胞桿菌基因;
2)待測樣品金黃色葡萄球菌和蠟樣芽胞桿菌基因得到擴增,擴增終點熒光信號大于或等于閾值,可判定該樣品結果為陽性,報告檢出金黃色葡萄球菌和蠟樣芽胞桿菌基因;
3)待測樣品金黃色葡萄球菌和蠟樣芽胞桿菌基因均未得到擴增,擴增終點熒光信號小于閾值,可判定樣品結果為陰性,可報告未檢出金黃色葡萄球菌或蠟樣芽胞桿菌基因。
5.根據權利要求1、2、3或4所述的金黃色葡萄球菌和蠟樣芽孢桿菌快速檢測方法,還設有空白對照、陰性對照和陽性對照,判定標準為:
1)陽性對照:以金黃色葡萄球菌和蠟樣芽孢桿菌陽性成分DNA為模板,按照所述的雙重微滴數字PCR反應體系和反應條件,進行雙重微滴數字PCR反應,檢測出金黃色葡萄球菌和蠟樣芽胞桿菌陽性基因有明顯擴增,擴增終點熒光信號大于或等于閾值;
2)陰性對照:以非目標源性成分DNA為模板,按照所述的雙重微滴數字PCR反應體系和反應條件,進行雙重微滴數字PCR反應,檢測出金黃色葡萄球菌和蠟樣芽胞桿菌基因均無擴增,擴增終點熒光信號小于閾值;
3)空白對照:以雙蒸水為模板,按照所述的雙重微滴數字PCR反應體系和反應條件,進行雙重微滴數字PCR反應,檢測出金黃色葡萄球菌和蠟樣芽胞桿菌基因均無擴增,擴增終點熒光信號小于閾值。
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