[發明專利]人類常染色體STR多態性位點復合擴增試劑盒及其應用

有效

• 申請號: 201711441348.4
• 申請日: 2017-12-27
• 公開（公告）號: CN107904317B
• 公開（公告）日: 2021-06-29
• 發明（設計）人: 石美琳;姜穎曄;范曉蕓;王偉;陳林麗;邵澤香;郭育林;夏子芳;鄭衛國
• 申請（專利權）人: 無錫中德美聯生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 南京經緯專利商標代理有限公司 32200
• 代理人: 余俊杰

本發明公開了人類常染色體STR多態性位點復合擴增試劑盒，所述試劑盒包含擴增如下25個基因座的特異性擴增引物；所述基因座為：D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、D1S1656、PentaE、TPOX、TH01、D2S1338、CSF1PO、Penta D、D19S433、vWA、D21S11、D18S51、D6S1043、Amelogenin、D8S1179、D5S818、D12S391、FGA、D22S1045、Yindel、D2S441、D10S1248。本發明所述試劑盒具有以下優點：本發明所述試劑盒在基因座累積的鑒別能力增強的前提下，提高了靈敏度，做到DNA模板量在50pg下全部檢出25個基因座，29個循環擴增，可獲得完整分型；本發明基因座數量更加滿足數據庫建設不斷擴容，并增加檢測基因座的要求；試劑盒高效、穩定，提高了案件現場檢材中的檢出率，縮短擴增時間。

技術領域

本發明屬于分子生物學領域，涉及STR分子標記，具體為一種涵蓋更多基因座、個體識別能力更高的人類常染色體STR多態性位點復合擴增試劑盒及其應用。

背景技術

短串聯重復序列基因座(STR)是由幾個堿基對作為核心單位串聯重復形成的一類DNA序列。串聯重復的核心單位數目可變，因此STR具有很好的遺傳多態性。關于STR，早在90年代初就已經發現。STR基因座片段小，能復合擴增，靈敏度高，可快速提供準確、豐富的信息，已被廣泛應用于建立DNA數據庫。在1997年，美國FBI選擇了13個STR基因座：CSF1PO、D16S539、FGA、D18S51、TH01、D5S818、TPOX、VWA、D3S1358、D13S317、D7S820、D8S1179、D21S11；而在今年(2017年1月1日)FBI又公布了7個新增的STR基因座：D1S1656,D2S441,D2S1338,D10S1248,D12S391,D19S433,D22S1045和Amelogenin。這些基因座的個體識別率較高，一般被稱為核心基因座。

我國對STR DNA的數據庫建設逐步標準化。根據中華人民共和國公共安全最新行業標準《法庭科學DNA數據庫選用的基因座及其數據結構》，其中常染色體含有20個核心基因座即Amelogenin、D18S51、D21S11、D3S1358、FGA、D8S1179、vWA、CSF1PO、D16S539、D7S820、D13S317、D5S818、D2S1338、D19S433、TH01、TPOX、D6S1043、Penta D、Penta E和D12S391，10個優選基因座D1S1656、D2S441、D22S1045、D10S1248、D8S1132、D15S659、D3S3045、D19S253、D6S477、D10S1435。其中，Amelogenin、D18S51、D21S11、D3S1358、FGA、D8S1179、vWA、CSF1PO、D16S539、D7S820、D13S317、D5S818、D2S1338、D19S433、TH01和TPOX這16個基因座DNA數據庫中排序靠前，兼容性好；D6S1043、Penta D和Penta E在DNA數據庫中排序靠前，中國人群遺傳多態性高，識別率高；D12S391、D1S1656、D2S441、D22S1045和D10S1248是引入的NEWCODIS，由美國FBI在2017年新增的核心位點，同時在歐洲的標準(ESS)中也包含這5個基因座。

商品化的試劑盒ABI的Identifiler，Promega(USA)的PowerPlex16，到現在AB公司的含有24個基因組的AmpFeSTR global filer，和Promega包含27個STR的PowerPlexfusion。在國內，中德美聯的17+1，EX20，EX27，公安部物證鑒定中心已經有了含有25個基因座的DNATyper25，基點認知的25A，海爾施的STRtyper26G等。但長期以來，國內廠商由于試劑盒的性能，比如靈敏度抗抑制能力，穩定性不如國外廠商，長期只應用于建庫市場，而實際案件檢材應用的均為國外廠商產品，在這塊，國內試劑盒的應用一片空白。

發明內容