[發明專利]一種檢測外泌體tRFRNA的方法在審
| 申請號: | 201711437529.X | 申請日: | 2017-12-26 |
| 公開(公告)號: | CN108165613A | 公開(公告)日: | 2018-06-15 |
| 發明(設計)人: | 甘武;戴和萍;蔡建飛;何俊麗 | 申請(專利權)人: | 上海英拜生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6855 | 分類號: | C12Q1/6855;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京華仲龍騰專利代理事務所(普通合伙) 11548 | 代理人: | 董濤 |
| 地址: | 201112 上海市*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 接頭序列 檢測 特異性擴增 引物序列 靈敏度 定量PCR檢測 預擴增引物 接頭設計 擴增產物 種檢測 小RNA 擴增 前體 通用 | ||
1.一種檢測外泌體tRF RNA的方法,其特征在于,所述方法包括:在tRF RNA兩端加上接頭序列,針對接頭序列和tRF RNA序列設計引物序列,進行擴增反應。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法還包括:所述在tRF RNA兩端加上接頭序列后,先要針對所述接頭序列設計預擴增引物,進行預擴增反應,然后再以預擴增產物為模板,針對接頭序列和tRF RNA序列設計引物序列,進行擴增反應。
3.根據權利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述在tRF RNA兩端加上接頭序列包括:
1)提取待測樣品的外泌體RNA;
2)進行3’端加接頭序列反應;
3)根據3’端接頭序列設計引物,進行3’端引物雜交反應;
4)進行5’端加接頭序列反應;
5)進行逆轉錄反應。
4.根據權利要求1、2和/或3任一所述的方法,其特征在于,所述進行擴增反應包括進行實時熒光定量PCR反應。
5.根據權利要求1、2、3和/或4任一所述的方法,其特征在于,
所述接頭序列包括:序列表中SEQ ID№:1所示3’端接頭核苷酸序列和序列表中SEQ ID№:3所示5’端接頭核苷酸序列;
所述針對接頭序列和tRF RNA序列設計的引物序列包括:序列表中SEQ ID№:6-SEQ ID№:12所示的至少一種正向引物核苷酸序列和序列表中SEQ ID№:13-SEQ ID№:19所示反向引物核苷酸序列中的至少一種。
6.根據權利要求2、3、4和/或5任一所述的方法,其特征在于,所述預擴增引物序列包括:序列表中SEQ ID№:4所示正向引物核苷酸序列和序列表中SEQ ID№:5所示反向引物核苷酸序列。
7.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,所述步驟3)中根據3’端接頭序列設計的引物包括序列表中SEQ ID№:2所示核苷酸序列。
8.一種用于檢測外泌體tRF RNA的接頭序列或引物序列,其特征在于,
所述接頭序列包括序列表中SEQ ID№:1所示3’端接頭核苷酸序列和序列表中SEQ ID№:3所示5’端接頭核苷酸序列;
所述引物序列包括:序列表中SEQ ID№:6-SEQ ID№:12所示的至少一種正向引物核苷酸序列和序列表中SEQ ID№:13-SEQ ID№:19所示反向引物核苷酸序列中的至少一種。
9.一種用于檢測外泌體tRF RNA的組合物或試劑盒,其特征在于,所述組合物或試劑盒包括下述1)-3)中的至少一種:
1)權利要求8所述的接頭序列和引物序列;
2)序列表中SEQ ID№:4所示正向引物核苷酸序列和序列表中SEQ ID№:5所示反向引物核苷酸序列;
3)序列表中SEQ ID№:2所示核苷酸序列。
10.權利要求1-7任一所述方法、權利要求8所述接頭序列或引物序列、權利要求9所述組合物或試劑盒在檢測外泌體tRF RNA、或在制備檢測外泌體tRF RNA相關產品中的應用。
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