[發(fā)明專利]土沉香、云南沉香、馬來沉香的SNP分子標(biāo)記及應(yīng)用

在審

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• 申請日: 2017-12-22
• 公開（公告）號: CN109486983A
• 公開（公告）日: 2019-03-19
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 林源吉;丁佳女;鄭宜文
• 申請（專利權(quán)）人: 杭州百邁生物股份有限公司
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.用于鑒定土沉香、云南沉香、馬來沉香的SNP分子標(biāo)記，其特征在于，所述SNP分子標(biāo)記位于SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示序列的第81-84位堿基為TGCC則鑒定為土沉香，若第81-84位堿基為CGCT則鑒定為云南沉香，若第81-84位堿基為CGCC則鑒定為馬來沉香。

2.權(quán)利要求1所述SNP分子標(biāo)記在土沉香、云南沉香、馬來沉香鑒定中的應(yīng)用。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，其特征在于，從土沉香、云南沉香、馬來沉香混合物種中分別鑒定出土沉香、云南沉香、馬來沉香。

4.用于鑒定土沉香、云南沉香、馬來沉香的寡核苷酸，其特征在于，所述核苷酸包括SEQID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3，或者SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所對應(yīng)的cDNA或mRNA，所述核苷酸序列的第81-84位堿基為TGCC則為土沉香，若第81-84位堿基為CGCT則為云南沉香，若第81-84位堿基為CGCC則為馬來沉香。

5.一種鑒定土沉香、云南沉香、馬來沉香的試劑盒，其特征在于，包括用于特異性檢測SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3序列第81-84位堿基為TGCC或者CGCT或者CGCC的一種或多種引物，或引物和探針的組合。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒，其特征在于，所述引物和/或探針選自：用于測序檢測的特異性擴(kuò)增引物和測序引物，引物序列分別為：

上游引物F1：5'-CGTAACAAGGTTTTCGTAGGTGAAC-3'

下游引物R1：5'-GCTACGTTCTTCATCGAT-3'

測序引物：5'-CGTAACAAGGTTTTCGTAGGTGAAC-3'；

或者，用于熒光定量PCR檢測的擴(kuò)增特異性擴(kuò)增引物和探針，引物和探針序列分別為：

上游引物F2：5'-CCGTGAACGTTAATAACAATGTGC-3'

下游引物R2：5'-ATCAAGTTCCTTGGCGCAGTC-3'

探針2-1：5'-FAM-GTGTCGTTATGCCCATTCCCTCCT-BHQ1-3'

探針2-2：5'-HEX-GTGTCGTTACGCTCCATTCCCTCCT-BHQ1-3'

探針2-3：5'-ROX-GTGTCGTTACGCCCATTCCCTCCT-BHQ1-3'；

或者，用于ARMS-PCR擴(kuò)增的特異性擴(kuò)增引物，引物序列為：

土沉香特異性引物：

上游引物T1：5'-GATGCGCGCTATGATTGAAC-3'

下游引物T2：5'-CGGTGTATGCCATGATGCA-3'

云南沉香特異性引物：

上游引物Y1：5'-GATGCGCGCTATGATTGTGT-3'

下游引物Y2：5'-CGGTGTATGCCATGATGCG-3'

馬來沉香特異性引物

上游引物M1：5'-GATGCGCGCTATGATTGTAT-3'

下游引物M2：5'-CGGTGTATGCCATGATGCG-3'。

7.一種制備鑒定土沉香、云南沉香、馬來沉香試劑盒的方法，包括制備檢測反應(yīng)試劑的步驟，其特征在于，所述反應(yīng)試劑包含用于特異性檢測SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ IDNO.3序列第81-84位堿基為TGCC或者CGCT或者CGCC的一種或多種引物，或引物和探針的組合。