[發明專利]土沉香、云南沉香、馬來沉香的SNP分子標記及其應用

在審

• 申請號: 201711397665.0
• 申請日: 2017-12-22
• 公開（公告）號: CN109486978A
• 公開（公告）日: 2019-03-19
• 發明（設計）人: 林源吉;丁佳女;鄭宜文
• 申請（專利權）人: 杭州百邁生物股份有限公司
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.用于鑒定土沉香、云南沉香、馬來沉香的SNP分子標記，其特征在于，所述SNP分子標記位于SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示序列的第190-191堿基，若第190-191位的堿基為GT則鑒定為土沉香，若第190-191堿基為TT則鑒定為云南沉香，若第190-191堿基為CC則鑒定為馬來沉香。

2.權利要求1所述SNP分子標記在土沉香、云南沉香、馬來沉香鑒定中的應用。

3.根據權利要求2所述的應用，其特征在于，從土沉香、云南沉香、馬來沉香混合樹種中分別鑒定出土沉香、云南沉香、馬來沉香。

4.用于鑒定土沉香、云南沉香、馬來沉香的核苷酸序列，其特征在于，所述核苷酸序列包括SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3，或者SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ IDNO.3所對應的cDNA或mRNA，所述核苷酸序列的第190-191位的堿基為GT則鑒定為土沉香，若第190-191堿基為TT則鑒定為云南沉香，若第190-191堿基為CC則鑒定為馬來沉香。

5.一種鑒定土沉香、云南沉香、馬來沉香的試劑盒，其特征在于，包括用于特異性檢測SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3序列第190-191位的堿基為GT、TT或CC的一種或多種引物，或引物和探針的組合。

6.根據權利要求5所述的試劑盒，其特征在于，所述引物和/或探針選自：用于測序檢測的特異性擴增引物和測序引物，引物序列分別為：

上游引物F1：5'-CGTAACAAGGTTTTCGTAGGTGAAC-3'

下游引物R1：5'-GCTACGTTCTTCATCGAT-3'

測序引物：5'-CGTAACAAGGTTTTCGTAGGTGAAC-3'；

或者，用于HRM-PCR方法鑒定的擴增特異性擴展引物，引物序列為：

上游引物F2：5’-AAGGAACTTGATCACATAATATGTT-3’

下游引物R2：5’-TCATTTTAGATTCGTTTCAACGC-3’；

或者，用于ARMS-PCR擴增的特異性引物，引物序列為：

上游引物FP：5’-CTTGTGGCCGTCATAACCAAACC-3’

土沉香下游引物TR：5’-CGTTTCAACGCTTGATCTCA-3’

云南沉香下游引物YR：5’-CGTTTCAACGCTTGATCTAA-3’

馬來沉香下游引物MR：5’-CGTTTCAACGCTTGATCTGG-3’。

7.一種制備鑒定土沉香、云南沉香、馬來沉香試劑盒的方法，包括制備檢測反應試劑的步驟，其特征在于，所述反應試劑包含用于特異性檢測SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ IDNO.3序列第190-191位的堿基為GT、TT或CC的一種或多種引物，或引物和探針的組合。