[發(fā)明專利]一種臨床藥物層次分類的方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201711379919.6
• 申請日: 2017-12-19
• 公開（公告）號: CN108122005B
• 公開（公告）日: 2021-09-21
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 李昊旻;曾嫻;段會龍
• 申請（專利權(quán)）人: 浙江大學(xué)
• 主分類號: G06K9/62
• 分類號: G06K9/62;G16H50/70
• 代理公司: 杭州天勤知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 33224
• 代理人: 高燕

本發(fā)明公開了一種臨床藥物層次分類的方法，包括：從患者的臨床電子病歷數(shù)據(jù)庫中獲取藥物和診斷關(guān)系，利用統(tǒng)計學(xué)方法建立藥物?診斷二值矩陣；以藥物?診斷二值矩陣為基礎(chǔ)，利用Jaccard相似系數(shù)計算藥物?藥物之間的距離，建立藥物?藥物距離矩陣；以藥物?藥物距離矩陣為基礎(chǔ)，利用K?means聚類算法對臨床藥物進行頂層分類；在每個頂層分類內(nèi)部，根據(jù)藥物?藥物距離關(guān)系進行頂層分類內(nèi)部的層次聚類；在頂層分類之間，根據(jù)頂層分類之間的距離關(guān)系進行頂層分類之間的層次聚類；合并頂層分類內(nèi)部的層次聚類和頂層分類之間的層次聚類，形成臨床藥物的層次分類。本發(fā)明的方法是基于臨床電子病歷數(shù)據(jù)、面向所有臨床藥物建立統(tǒng)一的藥物層次分類的方法。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及藥物分類，尤其涉及一種臨床藥物層次分類的方法。

背景技術(shù)

藥物可以通過其不同的化學(xué)結(jié)構(gòu)、作用機制、作用方式或者使用療法等方式來分類。當(dāng)前應(yīng)用最廣的藥物分類系統(tǒng)包括了世界衛(wèi)生組織維護ATC(Anatomical TherapeuticChemical Classification)、美國退伍軍人事務(wù)部退伍軍人健康管理局維護的NDF-RT(National Drug File Reference Terminology)以及歐洲藥品市場研究協(xié)會EphMRA(European Pharmaceutical Market Research Association)的分類系統(tǒng)等。但是即使是使用最為廣泛的ATC分類系統(tǒng)中，所能涵蓋的臨床藥物只是其中的一小部分，同時對于像我國這樣存在大量中成藥的情況下(2017版的國家基本醫(yī)療等保險藥品目錄中包含了中成藥1238個，相比于西藥的1297個應(yīng)該說占據(jù)半壁江山)，臨床中更是存在大量的藥物無法歸入到現(xiàn)有體系之中，這使得在開展一些臨床藥物的定量計算或者大數(shù)據(jù)分析的時候缺乏有效的手段。

現(xiàn)有的藥物分類體系都是由藥學(xué)方面的專家，通過構(gòu)建一套分類依據(jù)，然后人工來構(gòu)建的，一方面是不同藥物以及不同市場中的大量藥物出現(xiàn)的速度超出了專家維護的速度，另一方面一種固定分類體系有時候不能準確的給某種藥物找到合適的分類，比如中成藥不能依據(jù)其分子結(jié)構(gòu)來分類，化藥也不能根據(jù)中醫(yī)理論來分類，從而影響到他對于臨床藥物的覆蓋。為了應(yīng)對這樣的問題，近年來開始有研究者利用大規(guī)模的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)比如化學(xué)結(jié)構(gòu)、文獻共現(xiàn)、生物靶標(biāo)等來定量評估藥物和藥物之間的距離，以此來幫助構(gòu)建一個藥物分類體系服務(wù)于特定的目標(biāo)，比如藥物功能預(yù)測、藥物重定位等。

但是這些方法目前普遍缺乏對于中成藥的支持，一方面中成藥不具備相關(guān)的分子結(jié)構(gòu)、生物靶標(biāo)等信息，另一方面相關(guān)的研究文獻也比較少，從公開的數(shù)據(jù)庫和文獻中無法獲得足夠的資源來開展這方面的研究。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明提供了一種臨床藥物層次分類的方法，是基于臨床電子病歷數(shù)據(jù)、面向所有臨床藥物建立統(tǒng)一的藥物層次分類的方法。

本發(fā)明提供了如下技術(shù)方案：

一種臨床藥物層次分類的方法，包括以下步驟：

(1)從患者的臨床電子病歷數(shù)據(jù)庫中獲取藥物和診斷關(guān)系，利用統(tǒng)計學(xué)方法建立藥物-診斷二值矩陣；

(2)以藥物-診斷二值矩陣為基礎(chǔ)，利用Jaccard相似系數(shù)計算藥物-藥物之間的距離，建立藥物-藥物距離矩陣；

(3)以藥物-藥物距離矩陣為基礎(chǔ)，利用K-means聚類算法對臨床藥物進行頂層分類；

(4)在每個頂層分類內(nèi)部，根據(jù)藥物-藥物距離關(guān)系進行頂層分類內(nèi)部的層次聚類；

(5)在頂層分類之間，根據(jù)頂層分類之間的距離關(guān)系進行頂層分類之間的層次聚類；

(6)合并頂層分類內(nèi)部的層次聚類和頂層分類之間的層次聚類，形成臨床藥物的層次分類。