[發明專利]一種用于miRNA干擾載體構建篩選特異對照的質粒及其構建方法在審
| 申請號: | 201711372777.0 | 申請日: | 2017-12-19 |
| 公開(公告)號: | CN108384803A | 公開(公告)日: | 2018-08-10 |
| 發明(設計)人: | 冼學進 | 申請(專利權)人: | 上海百力格生物技術有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/85 | 分類號: | C12N15/85;C12N15/66 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 201111 上海市閔*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 質粒 構建 人源 小鼠 大鼠 篩選 干擾載體 轉錄 蛋白表達 功能篩選 目標序列 特異序列 大鼠類 負調控 實驗組 同源 數據庫 調控 | ||
1.一種用于miRNA干擾載體構建篩選特異對照的質粒,其特征在于:所述質粒miRNA序列與人源、小鼠和大鼠數據庫中已公布的序列不存在同源,所述質粒作為人源、小鼠和大鼠miRNA干擾的對照組實驗,有較準確的對照參照組實驗意義,所述質粒含有經過特異篩選的目標序列,目標序列為CCTAGGTTAAGTCGCCCTCGT。
2.根據權利要求1所述的一種用于miRNA干擾載體構建篩選特異對照的質粒,其特征在于:所述質粒轉錄出的miRNA不對人源、小鼠和大鼠的蛋白表達起正調控或者負調控作用,是實驗組的miRNA干擾作用能較明顯的做出判斷,從而篩選到理想的miRNA。
3.根據權利要求1或2所述的一種用于miRNA干擾載體構建篩選特異對照的質粒,其特征在于:miRNA干擾載體表達出的miRNA具有經過基因工程改良的骨架結構,其中靶向結合序列進一步剪切成熟后結合目標基因miRNA發揮干擾作用。
4.根據權利要求1或2所述的一種用于miRNA干擾載體構建篩選特異對照的質粒,其特征在于:所述質粒針對靶基因miRNA的干擾載體,在轉染效率>80%的前提下,對實驗中的轉錄水平無明顯干擾作用。
5.根據權利要求1所述的一種用于miRNA干擾載體構建篩選特異對照的質粒的構建方法,其特征在于:所述構建方法包括如下步驟:
(1)預測一段21bp的序列,對人源、小鼠和大鼠的數據庫用局部序列比對基本檢索工具blast進行比對檢索,找到大于90%特異與人源、小鼠和大鼠數據庫的序列;
(2)篩選到預測的21bp序列進行合成構建,載體骨架選用pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR載體;
(3)構建好質粒后進行轉錄后水平表達測試,細胞系選用較常規的HEK293進行干擾實驗;
(4)收集細胞株進行Qpcr檢測,檢測結果顯示對人源、小鼠和大鼠的目標蛋白無明顯干擾作用,目標蛋白正常表達。
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