[發明專利]拆分型單堿基基因編輯系統及其應用有效
| 申請號: | 201711368309.6 | 申請日: | 2017-12-18 |
| 公開(公告)號: | CN109929839B | 公開(公告)日: | 2021-02-12 |
| 發明(設計)人: | 李大力;張曉輝;劉明耀 | 申請(專利權)人: | 華東師范大學;上海邦耀生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/113 | 分類號: | C12N15/113;C12N15/864 |
| 代理公司: | 上海一平知識產權代理有限公司 31266 | 代理人: | 徐迅;王正君 |
| 地址: | 200241 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 拆分 堿基 基因 編輯 系統 及其 應用 | ||
1.一種核酸構建物組合,其特征在于,包括第一核酸構建物和第二核酸構建物,其中,所述第一核酸構建物具有從5’-3’的式I結構:
P1-X1-X2-X3-Z-X4 (I);
其中,P1為第一啟動子序列;
X1為胞嘧啶脫氨酶Apobec1的編碼序列;
X2為任選的連接序列;
X3為Cas9核酸酶的N端片段的編碼序列或KKH核酸酶的N端片段的編碼序列;
Z為第一融合肽N端片段的編碼序列;
X4為polyA序列;
所述第二核酸構建物具有從5’-3’的式II結構:
P2-Z-Y1-Y2-Y3 (II);
其中,P2為第二啟動子序列;
Z為第一融合肽C端片段的編碼序列;
Y1為Cas9核酸酶的C端片段的編碼序列或KKH核酸酶的C端片段的編碼序列;
Y2為尿嘧啶糖苷酶抑制劑UGI的編碼序列;
Y3為polyA序列;
并且,各“-”獨立地為鍵或核苷酸連接序列;
所述的第一啟動子和第二啟動子各自獨立地選自下組:CAG啟動子、CMV啟動子、或其組合;
所述連接序列選自下組:XTEN、GGS、(GGS)3、(GGS)7、或其組合;
所述Cas9核酸酶的N端片段為登錄號為2828055的Cas9n核酸酶的2-573位氨基酸;
所述Cas9核酸酶的C端片段為登錄號為2828055Cas9n核酸酶的574-1368位氨基酸;
所述KKH的N端片段為登錄號為2828033的KKH核酸酶的2-739位氨基酸;
所述KKH的C端片段為登錄號為2828033的KKH核酸酶的740-1053位氨基酸;
所述的第一融合肽為內含肽Intein;并且所述第一融合肽N端片段為內含肽Intein的2-103位氨基酸;所述第一融合肽C端片段為內含肽Intein的104-137位氨基酸;
所述polyA序列各自獨立地選自下組:BGH的polyA、SV40的polyA、或其組合;
并且當所述第一核酸構建物中的X3為Cas9核酸酶的N端片段的編碼序列時,則所述第二核酸構建物中的Y1為Cas9核酸酶的C端片段的編碼序列;當所述第一核酸構建物中的X3為KKH核酸酶的N端片段的編碼序列時,則所述第二核酸構建物中的Y1為KKH核酸酶的C端片段的編碼序列。
2.如權利要求1所述的核酸構建物組合,其特征在于,所述的第一啟動子和第二啟動子各自獨立地為CAG啟動子。
3.如權利要求1所述的核酸構建物組合,其特征在于,所述連接序列為XTEN。
4.如權利要求1所述的核酸構建物組合,其特征的在于,所述X3元件的來源選自下組:釀膿鏈球菌(Streptococcus pyogenes)、葡萄球菌(
5.如權利要求1所述的核酸構建物組合,其特征在于,所述第一核酸構建物的長度≤4.7kb。
6.如權利要求5所述的核酸構建物組合,其特征在于,所述第一核酸構建物的長度≤4.5kb。
7.如權利要求6所述的核酸構建物組合,其特征在于,所述第一核酸構建物的長度為3.0-4.5kb。
8.如權利要求1所述的核酸構建物組合,其特征在于,所述第二核酸構建物的長度≤4.7kb。
9.如權利要求8所述的核酸構建物的組合,其特征在于,所述第二核酸構建物的長度≤4.5kb。
10.如權利要求9所述的核酸構建物的組合,其特征在于,所述第二核酸構建物的長度為3.0-4.5kb。
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