[發明專利]誘導型酵母轉化重組系統的構建及其應用有效
| 申請號: | 201711364673.5 | 申請日: | 2017-12-18 |
| 公開(公告)號: | CN108060175B | 公開(公告)日: | 2021-02-12 |
| 發明(設計)人: | 汪洋;蘇會娟 | 申請(專利權)人: | 南京理工大學 |
| 主分類號: | C12N15/81 | 分類號: | C12N15/81;C12N15/64;C12N15/66;C12R1/865 |
| 代理公司: | 南京理工大學專利中心 32203 | 代理人: | 劉海霞 |
| 地址: | 210094 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 誘導 酵母 轉化 重組 系統 構建 及其 應用 | ||
1.重組載體pSHTB10,其特征在于,為將質粒pSH-SceI中的colE1、AmpR和PGal1基因元件替換成pSWB中的oriV、trfA和BleRDNA片段和Gal1-V10 DNA合成片段,形成全長序列為SEQID NO.32的質粒pSHTB10;所述的質粒pSH-SceI是將質粒pSH47中的Cre元件替換成I-SceI基因片段;所述的質粒pSWB是將質粒pDGICZ中的Phbs-BleR基因元件插入到質粒pSW-2中。
2.基于如權利要求1所述的重組載體pSHTB10的iTAR載體,其特征在于,為將質粒pSHTB10用限制性內切酶FspI酶切,通過在酶切位點處插入與目標線性大片段DNA兩端具有同源性的兩個同源臂并在同源臂間插入I-SceI酶切位點構建而成。
3.如權利要求2所述的iTAR載體,其特征在于,所述的iTAR載體為pSHTB10-HR12,為將pSHTB10用限制性內切酶FspI酶切,在該酶切位點處插入同源臂HR1、同源臂HR2和同源臂間的I-SceI酶切位點,形成全長序列為SEQ ID NO.33的iTAR載體pSHTB10-HR12。
4.如權利要求2所述的iTAR載體,其特征在于,所述的iTAR載體為pSHTB10-HR34,為將pSHTB10用限制性內切酶FspI酶切,在該酶切位點處插入同源臂HR3、同源臂HR4和同源臂間的I-SceI酶切位點,形成全長序列為SEQ ID NO.34的iTAR載體pSHTB10-HR34。
5.如權利要求1所述的重組載體pSHTB10的構建方法,其特征在于,包括引物設計、基因克隆和載體構建,具體為通過合成Gal1-V10基因片段,設計引物從質粒pSWB上PCR擴增oriV、trfA和BleR目標片段,限制性內切酶PmlI和SacI酶切質粒pSH-SceI,將Gal1-V10、oriV、trfA、BleR和pSH-SceI目的片段連接,得到質粒pSHTB10;所述的質粒pSH-SceI的構建方法是通過PCR擴增I-SceIDNA序列,將其與限制性內切酶ClaI酶切的pSH47目的片段連接,得到質粒pSH-SceI;所述的質粒pSWB的構建方法是通過限制性內切酶BamHI酶切質粒pDGICZ和pSW-2,將其目的片段連接,得到質粒pSWB。
6.如權利要求2所述的iTAR載體的構建方法,其特征在于,包括引物設計、基因克隆和載體構建,具體為通過合成引物PCR擴增相應的兩個同源臂片段及I-SceI酶切位點,與經不破壞pSHTB10功能元件的限制性內切酶酶切回收的目的DNA片段連接,得到相應的iTAR載體。
7.如權利要求3所述的iTAR載體的構建方法,其特征在于,包括引物設計、基因克隆和載體構建,具體為通過合成引物PCR擴增HR1和HR2 DNA片段,與經限制性內切酶FspI酶切的pSHTB10片段連接,得到iTAR載體pSHTB10-HR12。
8.如權利要求4所述的iTAR載體的構建方法,其特征在于,包括引物設計、基因克隆和載體構建,具體為通過合成引物PCR擴增HR3和HR4 DNA片段,與經限制性內切酶FspI酶切的pSHTB10片段連接,得到iTAR載體pSHTB10-HR34。
9.如權利要求2~4所述的iTAR載體在捕捉大片段DNA中的應用,其特征在于,具體應用方法如下:
步驟1:針對目標線性大片段DNA的兩端設計合成相應DNA片段,用體外轉錄的方式獲得gRNA;
步驟2:利用Cas9核酸酶和gRNA可以特異性切割DNA的特性得到目標線性DNA;
步驟3:將iTAR載體轉化到釀酒酵母中,通過將目標線性DNA片段轉化至經半乳糖誘導的且含iTAR載體的釀酒酵母中,篩選陽性克隆,得到相應的捕捉載體;
步驟4:將捕捉載體轉移至相應的模式菌株中使其表達,實現外源大片段DNA的克隆和表達。
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