[發明專利]臨床蛋白質質譜數據的分類方法在審
| 申請號： | 201711341974.6 | 申請日： | 2017-12-14 |
| 公開（公告）號： | CN107895159A | 公開（公告）日： | 2018-04-10 |
| 發明（設計）人： | 白娟;張自力 | 申請（專利權）人： | 西南大學 |
| 主分類號： | G06K9/00 | 分類號： | G06K9/00;G06K9/40;G06K9/62 |
| 代理公司： | 北京海虹嘉誠知識產權代理有限公司11129 | 代理人： | 呂小琴 |
| 地址： | 400715*** | 國省代碼： | 重慶;85 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 臨床 蛋白質 數據 分類 方法 | ||
1.一種臨床蛋白質質譜數據的分類方法，其特征在于：包括如下步驟：
S1.對含噪的臨床蛋白質質譜數據進行預處理，剔除質譜數據中的噪聲；
S2.從剔除噪聲的質譜數據中提取出類別區分特征；
S3.采用決策樹對類別區分特征進行訓練，然后將待測的蛋白質質譜數據輸入到決策樹中進行訓練分類。
2.根據權利要求1所述的臨床蛋白質質譜數據的分類方法，其特征在于：步驟S1中，根據如下方法剔除質譜數據中的噪聲：
S101.線性掃描蛋白質質譜數據中的峰值信號，并判斷每個峰值信號的峰值是否為左右相鄰峰值信號的峰值最大值，如是，則該峰值信號確定為有效的局部峰值信號；
S102.對局部有效峰值信號進行兩步分窗算法求取窗內有效峰值信號的平均值形成剔除噪聲的新的質譜數據。
3.根據權利要求2所述的臨床蛋白質質譜數據的分類方法，其特征在于：步驟S102中，根據如下方法進行兩步分窗算法處理：
將質譜數據中的mass坐標按照系統的最大誤差進行分窗，然后取每個窗口的平均峰值作為該窗口的新的峰值，并以分窗時的各窗口的序列值作為新的mass值；
采用滑窗處理算法對新的峰值進行處理，剔除噪聲。
4.根據權利要求3所述的臨床蛋白質質譜數據的分類方法，其特征在于：在對mass坐標分窗時，第一步分窗的窗口寬度取系統最大誤差，第二步分窗為新的mass坐標的寬度為2的窗口大小進行滑窗處理。
5.根據權利要求1所述的臨床蛋白質質譜數據的分類方法，其特征在于：步驟S2中，根據如下方法提取出類別區分特征：
S201.將步驟S1中剔除噪聲的質譜數據樣本進行t檢驗：
其中，為第一類樣本的均值，σi0為第一類樣本的方差；為第二類樣本的均值，σil為第二類樣本的方差，Ti為樣本中第i個質譜數據的t統計值；
S201.將t統計值進行排序，選出t統計值最大的10個特征作為先驗信息，并采用遺傳算法得到質譜數據的類別區分特征。
6.根據權利要求1所述的臨床蛋白質質譜數據的分類方法，其特征在于：步驟S3中，決策樹分類過程中，集合多棵決策樹組成隨機森林對前面步驟提取的區別性特征數據，進行訓練以及分類。
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