[發明專利]一種與豬懸蹄過度生長性狀相關的SNP標記及其用途

有效

• 申請號: 201711310397.4
• 申請日: 2017-12-11
• 公開（公告）號: CN107988388B
• 公開（公告）日: 2018-12-21
• 發明（設計）人: 吳珍芳;鄭恩琴;楊杰;丁榮榮;楊明;蔡更元;楊化強
• 申請（專利權）人: 華南農業大學;廣東溫氏食品集團股份有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 廣東廣信君達律師事務所 44329
• 代理人: 楊曉松

本發明提供了一種與豬懸蹄過度生長性狀相關的SNP標記，所述SNP標記的位點為國際豬參考基因組11.1版本13號染色體上第133470903個核苷酸位點，該位點的堿基是T或G。本發明通過優選該SNP的優勢等位基因，能夠減少大白懸蹄過度生長的發生，加快遺傳進展，有效提高種豬育種的經濟效益。

技術領域

本發明涉及一種與豬懸蹄過度生長性狀相關的SNP標記及其用途。

背景技術

豬是典型的偶蹄目哺乳動物，其第1趾完全退化；第3、4趾特別發達，長短相等，稱之為主蹄；第2、5趾不發達，正常情況下懸立在空中，稱之為懸蹄(見圖1)。懸蹄的主要作用在于輔助主蹄承受豬的體重以及維持其身體平衡，當母豬懸蹄過長時(大于7cm)，極易發生機械損傷，進而造成無法站立及飲食，繼發引起懷孕母豬流產、哺乳母豬營養不良等(見圖2)，從而對母豬的各方面產生影響，嚴重時母豬直接被淘汰，給養殖企業帶來了巨大的經濟損失。

由于豬懸蹄的最終長度在成年后才能觀察到，而種豬的選種卻在此之前，因此早期選擇的準確性就顯得尤為重要。而分離和鑒定豬懸蹄過度生長易感位點則是豬懸蹄過度生長抗病育種的關鍵。目前，全基因組關聯分析(Genome-wide association studies,GWAS)被廣泛應用于尋找與畜禽復雜性狀高度關聯的位點，所篩選出的分子標記可對難以測量的性狀(如懸蹄過度生長)進行早期的分子標記輔助選擇(marker assistedselection，MAS)育種。目前，該方法已成為規模化養豬業分子育種的重要手段。

懸蹄過度生長廣泛分布于瘦肉型豬種中，是造成能繁母豬被提前淘汰的決定因素之一。大白是世界上著名的瘦肉型豬種之一，因其較高的繁殖力、較好的生長育肥性和適應性等特點，常被作為諸多商品豬合成系的母本。多項研究表明，大白母豬群體存在明顯的懸蹄過度生長現象。因此，對大白母豬的懸蹄生長性狀進行遺傳改良，將可以有效避免母豬因肢蹄異常而被提前淘汰，最大限度的提高母豬的使用年限，從而減少母豬因趾蹄疾患而提前被淘汰所帶給養殖企業的經濟損失。

發明內容

本發明的目的在于，提供一種一種與豬懸蹄過度生長性狀相關的SNP標記及其用途。

為實現上述目的，本發明所采取的技術方案：一種與豬懸蹄過度生長性狀相關的SNP標記，所述SNP標記的位點為國際豬參考基因組11.1版本13號染色體上第133470903個核苷酸位點，該位點的堿基是T或G。

優選地，所述SNP標記的序列如SEQ ID NO：1所示，所述SEQ ID NO：1所示序列自5’端起第332位堿基是T或G。所述分子標記的SNP位點對應于國際豬參考基因組11.1版本13號染色體上第133470903處的T>G突變；所述分子標記的SNP位點為SEQ ID NO1:所示，其中序列中的M是T或G，導致懸蹄生長性狀的不同。本發明通過優選該SNP的優勢等位基因，能夠減少大白懸蹄過度生長的發生，加快遺傳進展，有效提高種豬育種的經濟效益。

本發明提供了一種用于檢測上述所述的SNP標記的引物對，所述引物對的核酸序列如SEQ ID NO：2和SEQ ID NO：3所示。

本發明提供了一種用于檢測上述所述的SNP標記的試劑盒，包括上述所述的引物對。

本發明提供了一種減少豬懸蹄過度生長的方法，所述方法包括以下步驟：

檢測豬的國際豬參考基因組11.1版本13號染色體上第133470903個核苷酸位點的基因型，選擇第133470903個核苷酸位點的GG型個體作為種豬。

優選地，所述檢測豬的國際豬參考基因組11.1版本13號染色體上第133470903個核苷酸位點的基因型的方法包括以下步驟：

(1)提取待測豬的基因組DNA；