[發明專利]一種煙曲霉唑類耐藥的分子生物學快速檢測方法在審
| 申請號: | 201711276495.0 | 申請日: | 2017-12-06 |
| 公開(公告)號: | CN109880892A | 公開(公告)日: | 2019-06-14 |
| 發明(設計)人: | 劉沐桑;劉維達;鄭海林;梁官釗 | 申請(專利權)人: | 中國醫學科學院皮膚病醫院 |
| 主分類號: | C12Q1/6869 | 分類號: | C12Q1/6869;C12Q1/686;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 南京天翼專利代理有限責任公司 32112 | 代理人: | 李建芳 |
| 地址: | 210042 江蘇省*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 煙曲霉 分子生物學 快速檢測 真菌 唑類 擴增 提取試劑盒 臨床標本 微量DNA 真菌DNA 突變型 核酸 測序 位點 突變 耗時 采集 標本 檢測 優化 | ||
本發明公開了一種煙曲霉唑類耐藥的分子生物學快速檢測方法,采集臨床標本,用真菌微量DNA提取試劑盒提取真菌DNA,使用真菌ITS特異引文進行擴增,將擴增結果進行測序,blast確定標本中真菌種類,如果有煙曲霉,優化TaqMan探針,使用realtime PCR技術檢測L98H突變型對應的核酸位點DNA第363?365bp有無突變。本發明煙曲霉唑類耐藥的分子生物學快速檢測方法,具有耗時短,敏感性好,準確性高等優勢。
技術領域
本發明涉及一種煙曲霉唑類耐藥的分子生物學快速檢測方法,屬于耐藥監測領域。
背景技術
曲霉是最常見的環境真菌,多感染免疫缺陷人群引起肺、鼻竇和腦曲霉病,治療困難且病死率高。一項北美對960例侵襲性曲霉病的研究發現,主要為血液腫瘤、器官移植和造血干細胞移植患者并發肺部感染,12周內病死率高達45.6%。我國的數據提示侵襲性曲霉病在血液干細胞移植患者發病率10.8%而病死率60%,肝移植患者發病率4.8%而病死率62.5%,并且侵襲性曲霉病的發病率在逐年增加。
侵襲曲霉病絕大多數由煙曲霉引起,在歐洲達到95%以上。自1997年美國報道了首例伊曲康唑耐藥以來,煙曲霉耐藥逐漸增加,中國孫毅等也陸續報道了煙曲霉伊曲康唑耐藥和聯合耐藥。英國研究發現煙曲霉唑類耐藥比率1997-1998年為0%,2004-2005年為5%,2007年為17%,2008年為14%,2009年為20%,其中2008-2009年78%耐藥株為多重耐藥。
唑類藥物使真菌病治療有了革命性的突破,不僅僅因為抗菌譜廣,還因為相對于兩性霉素B藥物毒性明顯降低。2008年美國感染性疾病協會發表的曲霉病治療方案中,肺、鼻竇和腦等侵襲性曲霉病首選伏立康唑,其次為兩性霉素B及其脂質體、卡泊芬凈、泊沙康唑和伊曲康唑。伊曲康唑、伏立康唑和泊沙康唑可口服,故慢性或過敏性曲霉病首選。因此,煙曲霉唑類耐藥的臨床危害很大,且有逐漸增加的趨勢,需要密切關注和積極研究。
國內外的真菌耐藥檢測還是以傳統真菌培養和藥敏實驗為主,耗時長,敏感性差。
發明內容
為了解決現有技術中存在的上述缺陷,本發明提供一種煙曲霉唑類耐藥的分子生物學快速檢測方法。
為解決上述技術問題,本發明所采用的技術方案如下:
一種煙曲霉唑類耐藥的分子生物學快速檢測方法,采集臨床標本,用真菌微量DNA提取試劑盒提取真菌DNA,使用真菌ITS特異引文進行擴增,將擴增結果進行測序,blast確定標本中真菌種類,如果有煙曲霉,優化TaqMan探針,使用realtime PCR技術檢測L98H突變型對應的核酸位點DNA第363-365bp有無突變。
為了提高檢測準確性,優選,步驟1)中,真菌微量DNA提取試劑盒為Qiagen真菌微量DNA提取試劑盒。
設計特異性引物,對我國臨床最為常見的煙曲霉唑類耐藥突變TR34/L98H和
TR34/L98H/S297T/F495I進行快速的分子生物學檢測。由于我國cyp51A基因突變尤其以L98H型突變最為常見,該突變導致高度的伊曲康唑MIC>16mg/L)、伏立康唑和泊沙康唑耐藥。L98H突變型對應的核酸位點為DNA第363-365bp,是一個SNIP位點,可以有2種以上的基因型。
本發明未提及的技術均參照現有技術。
本發明煙曲霉唑類耐藥的分子生物學快速檢測方法,具有耗時短,敏感性好,準確性高等優勢。
附圖說明
圖1為現有技術及本申請檢測方法對照示意圖。
具體實施方式
為了更好地理解本發明,下面結合實施例進一步闡明本發明的內容,但本發明的內容不僅僅局限于下面的實施例。
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