[發(fā)明專利]凡納濱對(duì)蝦EST-STR標(biāo)記及其擴(kuò)增引物、檢測(cè)方法和應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201711251213.1
• 申請(qǐng)日: 2017-12-01
• 公開（公告）號(hào): CN107881246B
• 公開（公告）日: 2021-05-04
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 任春華;江曉;黃文;陳廷;胡超群
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 廣州科粵專利商標(biāo)代理有限公司 44001
• 代理人: 劉明星;胡素麗

1.一種凡納濱對(duì)蝦EST-STR標(biāo)記的擴(kuò)增引物，其特征在于，所述的擴(kuò)增引物包括：

針對(duì)Lv-F2a位點(diǎn)：

Lv-F2a-F：5’-CCCCAAAATCGTCTTTCCAA-3’；

Lv-F2a-R：5’-GGTGGATTTAGGGAAGGCGTA-3’；

針對(duì)Lv-F7a位點(diǎn)：

Lv-F7a-F：5’-GAGGTGTTGAGGGAAGGTTGTG-3’；

Lv-F7a-R：5’-GAGGCCAATTACGATTGTTTCA-3’；

針對(duì)Lv-F8a位點(diǎn)：

Lv-F8a-F：5’-TCGCACATAGTCAAAATGGCA-3’；

Lv-F8a-R：5’-TGTGAGCCGTGCGAAAGTC-3’；

針對(duì)Lv-F9a位點(diǎn)：

Lv-F9a-F：5’-CTGCTGTTCGAGAAAGCTGTTC-3’；

Lv-F9a-R：5’-TTTTGGGCGCTTTGAGATTC-3’；

針對(duì)Lv-F30a位點(diǎn)：

Lv-F30a-F：5’-GTCCCATCGCCGAGTTGA-3’；

Lv-F30a-R：5’-TTTGAATCAGCGACACGACAG-3’；

針對(duì)Lv-F31a位點(diǎn)：

Lv-F31a-F：5’-CGCCAACGAATGTCTAAGAGC-3’；

Lv-F31a-R：5’-GCAATATGCAAAATGCCTGTTC-3’；

針對(duì)Lv-F36a位點(diǎn)：

Lv-F36a-F：5’-GCCTCGGTAACATTGTGAAGAG-3’；

Lv-F36a-R：5’-ACAGCAACCAGGGTATTCAGG-3’；

針對(duì)Lv-F40a位點(diǎn)：

Lv-F40a-F：5’-CATTTCCCTTTCGCATTTCTC-3’；

Lv-F40a-R：5’-GCAATGATTCCATCAGGTTCG-3’；

所述的EST-STR標(biāo)記編號(hào)為L(zhǎng)v-F2a、Lv-F7a、Lv-F8a、Lv-F9a、Lv-F30a、Lv-F31a、Lv-F36a和Lv-F40a；

所述的Lv-F2a的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；

所述的Lv-F7a的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；

所述的Lv-F8a的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；

所述的Lv-F9a的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；

所述的Lv-F30a的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示；

所述的Lv-F31a的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；

所述的Lv-F36a的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示；

所述的Lv-F40a的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的擴(kuò)增引物，其特征在于，所述的擴(kuò)增引物的正向引物的5’端標(biāo)記有熒光基團(tuán)。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的擴(kuò)增引物，其特征在于，所述的熒光基團(tuán)為FAM、HEX或TAMRA。

4.一種凡納濱對(duì)蝦EST-STR標(biāo)記的檢測(cè)方法，其特征在于，包括以下步驟：

（1）、提取凡納濱對(duì)蝦基因組DNA；

（2）、以步驟（1）提取的基因組DNA為模板，分別利用權(quán)利要求2所述的針對(duì)Lv-F2a位點(diǎn)的引物對(duì)Lv-F2a-F/R、針對(duì)Lv-F7a位點(diǎn)的引物對(duì)Lv-F7a-F/R、針對(duì)Lv-F8a位點(diǎn)的引物對(duì)Lv-F8a-F/R、針對(duì)Lv-F9a位點(diǎn)的引物對(duì)Lv-F9a-F/R、針對(duì)Lv-F30a位點(diǎn)的引物對(duì)Lv-F30a-F/R、針對(duì)Lv-F31a位點(diǎn)的引物對(duì)Lv-F31a-F/R、針對(duì)Lv-F36a位點(diǎn)的引物對(duì)Lv-F36a-F/R和針對(duì)Lv-F40a位點(diǎn)的引物對(duì)Lv-F40a-F/R進(jìn)行PCR擴(kuò)增；

（3）、利用測(cè)序儀對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行分型。