[發明專利]一組用于兒童急性淋巴細胞白血病診斷的circRNA標志物及其應用

有效

• 申請號: 201711246097.4
• 申請日: 2017-12-01
• 公開（公告）號: CN107937522B
• 公開（公告）日: 2019-02-26
• 發明（設計）人: 方擁軍;薛瑤;康美云;王婭萍;戎留成
• 申請（專利權）人: 南京市兒童醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 南京經緯專利商標代理有限公司 32200
• 代理人: 唐循文

一組用于兒童急性淋巴細胞白血病診斷的circRNA標志物及其應用，所述標志物包括SEQ ID No:1所示的has_circ_0117909和SEQ ID No:2所示的has_circ_0005720兩種circRNAs。本發明所提供的兒童ALL診斷用circRNA生物標志物，可用于兒童ALL的診斷，其區分兒童ALL骨髓和正常對照骨髓的AUC可達到0.962，靈敏度達到90.9%，特異度達到95%。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，涉及一組用于兒童急性淋巴細胞白血病診斷的circRNA標志物及其應用。

背景技術

白血病是常見的造血系統惡性增生性疾病，是造血干細胞在分化過程中于某一階段出現阻滯的一種惡性增殖疾病。兒童急性淋巴細胞白血病(acute lymphoblasticleukemia,ALL)是兒童時期最常見的惡性腫瘤，約占15歲以下兒童惡性腫瘤的25-30％。在世界范圍內，其年發病率約為3-4/10萬人口。我國每年新增病例超過10000例，并且有逐年增高的趨勢。盡管隨著兒童ALL診斷與治療方案的不斷完善，多種藥物聯合治療、支持治療及造血干細胞移植的應用，兒童ALL的預后較以往有了顯著改善，5年生存率達到80-90％，成為一種可治愈性的惡性腫瘤，但仍有約15％的患兒死于化療副反應及疾病復發。因此，深入研究兒童ALL的發病機制，可以為兒童ALL提供新的診斷依據，也可以為發現新的生物學標志及新的靶向治療位點提供堅實的理論基礎。

隨著腫瘤分子生物學研究的深入，科學家逐漸將目光轉向環狀RNA(circularRNA,circRNA),因其在致癌與腫瘤抑制途徑中顯露出的潛在作用而成為腫瘤研究的新熱點。circRNA是區別于傳統線性RNA的RNA家族新成員，不具有5’末端帽子和3’末端poly(A)尾巴，并以共價鍵形成環形結構的非編碼RNA分子。最新研究表明，circRNA具有閉合環狀結構，主要通過非典型可變剪切加工產生，廣泛存在于各種生物細胞中，具有結構穩定，難以被RNA酶降解、表達豐度高、物種間保守性好，表達具有組織及時空特異性等特征，這些特點使得circRNA在疾病診斷與治療新型方法的開發應用上具有廣闊的前景。目前已經在食管癌、胃癌、肝癌等惡性腫瘤匯總相繼發現了具有早期診斷價值的circRNA，但是在兒童ALL領域中尚未見相關circRNA的報道。

發明內容

解決的技術問題：本發明提供一組用于兒童急性淋巴細胞白血病診斷的circRNA標志物及其應用，為兒童ALL的診斷提供參考依據。本發明所提供的circRNA生物標志物對于兒童ALL具有很高的靈敏度和特異性，可以作為新型的生物標志物用于兒童ALL的檢測。

技術方案：一組用于兒童急性淋巴細胞白血病診斷的circRNA標志物，標志物包括SEQ ID No:1所示的has_circ_0117909和SEQ ID No:2所示的has_circ_0005720兩種circRNAs。

上述引物組合包括：針對has_circ_0117909的特異性引物，針對has_circ_0005720的特異性引物。

上述針對has_circ_0117909的特異性引物包括如SEQ ID No:3所示的上游引物，如SEQ ID No:4所示的下游引物；所述針對has_circ_0005720的特異性引物包括如SEQ IDNo:5所示的上游引物，如SEQ ID No:6所示的下游引物。

上述標志物在制備診斷兒童急性淋巴細胞白血病試劑盒中的應用。

上述引物組合在制備診斷兒童急性淋巴細胞白血病試劑盒中的應用。

上述引物組合在篩選或制備兒童急性淋巴細胞白血病靶向藥物中的應用。

一種兒童急性淋巴細胞白血病的診斷試劑盒，包括上述的引物組合。